Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1J9U5

Protein Details
Accession N1J9U5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29DPTFNFCRKQARQRRDYLYRRALIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0034457  C:Mpp10 complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0043047  F:single-stranded telomeric DNA binding  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MNVCEDPTFNFCRKQARQRRDYLYRRALILRDSEISEKRAKLRAALASGITPDPTIVNDKGLREDFKFDESKKDLTKNDALDLDDEYSQLSGTVDPRILVTTSRDPSTRLSSFAKEVRLLLPTSIRLNRGNLILPNLVQSAQASGLSDMILLHEHRGIPTALTISHFPHGPTASFSLHNVVLRHDIPNSARGTVSESYPHLIFEGFTSKLGLRIVKILKHLFPPREAITNKSKIGSRVVTFKNVEDSIELRHHVFVKTSYQSVELAEVGPRMTMRCFEIRGGTLENKDGDVEWRLNQYTRTSRKKDLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.64
3 0.69
4 0.75
5 0.79
6 0.86
7 0.86
8 0.86
9 0.85
10 0.84
11 0.77
12 0.71
13 0.66
14 0.58
15 0.5
16 0.46
17 0.38
18 0.31
19 0.31
20 0.32
21 0.31
22 0.32
23 0.35
24 0.34
25 0.36
26 0.4
27 0.38
28 0.36
29 0.4
30 0.41
31 0.39
32 0.37
33 0.33
34 0.27
35 0.29
36 0.25
37 0.19
38 0.14
39 0.11
40 0.09
41 0.1
42 0.14
43 0.13
44 0.17
45 0.19
46 0.2
47 0.25
48 0.27
49 0.29
50 0.25
51 0.29
52 0.26
53 0.29
54 0.33
55 0.29
56 0.34
57 0.35
58 0.39
59 0.38
60 0.43
61 0.4
62 0.41
63 0.46
64 0.39
65 0.39
66 0.35
67 0.32
68 0.27
69 0.26
70 0.22
71 0.16
72 0.14
73 0.11
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.13
88 0.18
89 0.2
90 0.22
91 0.22
92 0.22
93 0.25
94 0.31
95 0.28
96 0.25
97 0.25
98 0.26
99 0.29
100 0.31
101 0.3
102 0.24
103 0.24
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.17
119 0.18
120 0.16
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.15
167 0.13
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.19
175 0.18
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.11
200 0.17
201 0.19
202 0.2
203 0.25
204 0.27
205 0.27
206 0.34
207 0.4
208 0.36
209 0.35
210 0.38
211 0.35
212 0.4
213 0.39
214 0.36
215 0.38
216 0.42
217 0.41
218 0.39
219 0.39
220 0.33
221 0.38
222 0.38
223 0.31
224 0.34
225 0.35
226 0.39
227 0.38
228 0.37
229 0.37
230 0.33
231 0.31
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.22
236 0.22
237 0.18
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.23
244 0.25
245 0.25
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.22
250 0.21
251 0.15
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.15
262 0.19
263 0.21
264 0.22
265 0.26
266 0.26
267 0.29
268 0.32
269 0.32
270 0.29
271 0.31
272 0.3
273 0.26
274 0.25
275 0.22
276 0.2
277 0.2
278 0.21
279 0.2
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.3
284 0.34
285 0.4
286 0.48
287 0.56
288 0.57