Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JAN4

Protein Details
Accession N1JAN4    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-126DLNVKSWLMKQKKRQKQIEKARKLENDHydrophilic
270-293IPQIKIKKVKNKVKSTRRKKVDDDBasic
390-414VSNLQKPTNKDRKQRSLLRQSKPETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-84RKKRNEKLEAIKKARDTAKR
112-113KR
274-289KIKKVKNKVKSTRRKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSDSISIEETNRIRVSLGMRPLPVPNQSGPVFEEAPAVDVGSTLESRQAEGYENFRKLQELEEIRKKRNEKLEAIKKARDTAKRFSRLEGKGLADGDDEDLNVKSWLMKQKKRQKQIEKARKLENDLAEAEKTAEYTAKDLSGIKVGHEISTFEEGEEQILTLKDTTIDENEEEGDELENVDLRAKEKLNETLELKKKKPVYNPLDEIESGGHGILSHYDEEIDGKKKKNFTLDSQGSILKNTIDEPSQNLNVISLDTFNTEPISDYLEIPQIKIKKVKNKVKSTRRKKVDDDDILLPKEESVNSTGLSNITTDEPASKRQKLVDTSFIDDDDLQGSLAAQRKISLKKRQKYLAEQLVRRIREGSTNVSAENDANDEGCGLIIDETSEFVSNLQKPTNKDRKQRSLLRQSKPETAMSDDSDGDGDVNMEHSYITGEEALQSKAHDSAEGLASTDVTNNGLEAEATLDCGLGSTRKQRREADAELKARSQRERDRTNGRLDRMSAREKEEYARSQNTLRDQIESRQLAEHFNKEYKPNVELKYIDEFGRSMNKKEAFKHLSHQFHGKGSGKQKTEKMLKKIEDEKRREAQSSLDGSQIGGMSGATAQQRKKQGQAGVRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.28
4 0.35
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.39
9 0.4
10 0.4
11 0.37
12 0.31
13 0.33
14 0.32
15 0.32
16 0.31
17 0.31
18 0.28
19 0.24
20 0.25
21 0.18
22 0.2
23 0.18
24 0.16
25 0.11
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.15
36 0.17
37 0.19
38 0.27
39 0.3
40 0.33
41 0.33
42 0.33
43 0.34
44 0.3
45 0.31
46 0.33
47 0.33
48 0.39
49 0.48
50 0.54
51 0.58
52 0.66
53 0.66
54 0.65
55 0.67
56 0.65
57 0.64
58 0.68
59 0.73
60 0.76
61 0.79
62 0.76
63 0.69
64 0.69
65 0.68
66 0.65
67 0.61
68 0.6
69 0.64
70 0.68
71 0.67
72 0.65
73 0.67
74 0.61
75 0.6
76 0.54
77 0.47
78 0.41
79 0.4
80 0.34
81 0.25
82 0.23
83 0.2
84 0.15
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.14
93 0.24
94 0.32
95 0.4
96 0.49
97 0.6
98 0.71
99 0.8
100 0.85
101 0.86
102 0.88
103 0.91
104 0.92
105 0.91
106 0.88
107 0.86
108 0.8
109 0.75
110 0.71
111 0.62
112 0.54
113 0.46
114 0.41
115 0.33
116 0.29
117 0.24
118 0.17
119 0.15
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.15
138 0.19
139 0.18
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.1
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.12
172 0.13
173 0.15
174 0.18
175 0.24
176 0.25
177 0.28
178 0.3
179 0.36
180 0.43
181 0.48
182 0.46
183 0.45
184 0.5
185 0.52
186 0.57
187 0.58
188 0.58
189 0.6
190 0.63
191 0.58
192 0.54
193 0.48
194 0.41
195 0.31
196 0.23
197 0.14
198 0.1
199 0.08
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.11
210 0.16
211 0.19
212 0.23
213 0.26
214 0.3
215 0.32
216 0.39
217 0.39
218 0.4
219 0.47
220 0.45
221 0.44
222 0.43
223 0.43
224 0.35
225 0.32
226 0.26
227 0.16
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.09
233 0.12
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.09
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.18
259 0.17
260 0.18
261 0.24
262 0.28
263 0.33
264 0.43
265 0.52
266 0.58
267 0.67
268 0.75
269 0.8
270 0.86
271 0.88
272 0.88
273 0.87
274 0.83
275 0.77
276 0.75
277 0.74
278 0.67
279 0.61
280 0.55
281 0.5
282 0.44
283 0.39
284 0.3
285 0.2
286 0.17
287 0.13
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.09
303 0.16
304 0.2
305 0.21
306 0.22
307 0.24
308 0.29
309 0.3
310 0.32
311 0.34
312 0.31
313 0.32
314 0.32
315 0.29
316 0.25
317 0.21
318 0.18
319 0.1
320 0.08
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.07
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.17
330 0.25
331 0.32
332 0.4
333 0.46
334 0.53
335 0.6
336 0.65
337 0.66
338 0.66
339 0.68
340 0.67
341 0.65
342 0.59
343 0.6
344 0.59
345 0.54
346 0.47
347 0.39
348 0.3
349 0.27
350 0.28
351 0.25
352 0.23
353 0.23
354 0.23
355 0.22
356 0.22
357 0.17
358 0.15
359 0.11
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.1
378 0.12
379 0.14
380 0.17
381 0.2
382 0.23
383 0.34
384 0.45
385 0.48
386 0.55
387 0.63
388 0.7
389 0.76
390 0.82
391 0.81
392 0.82
393 0.84
394 0.82
395 0.8
396 0.74
397 0.72
398 0.65
399 0.57
400 0.47
401 0.42
402 0.37
403 0.3
404 0.28
405 0.21
406 0.19
407 0.17
408 0.15
409 0.1
410 0.08
411 0.06
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.07
424 0.09
425 0.1
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.07
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.09
459 0.19
460 0.26
461 0.33
462 0.39
463 0.43
464 0.5
465 0.56
466 0.61
467 0.6
468 0.62
469 0.6
470 0.56
471 0.56
472 0.52
473 0.48
474 0.45
475 0.44
476 0.44
477 0.49
478 0.53
479 0.57
480 0.63
481 0.65
482 0.71
483 0.7
484 0.64
485 0.59
486 0.55
487 0.55
488 0.51
489 0.53
490 0.46
491 0.44
492 0.44
493 0.41
494 0.43
495 0.42
496 0.42
497 0.42
498 0.43
499 0.4
500 0.4
501 0.44
502 0.45
503 0.46
504 0.41
505 0.39
506 0.38
507 0.4
508 0.45
509 0.42
510 0.37
511 0.34
512 0.34
513 0.36
514 0.37
515 0.37
516 0.33
517 0.36
518 0.37
519 0.36
520 0.42
521 0.38
522 0.39
523 0.42
524 0.4
525 0.41
526 0.39
527 0.4
528 0.4
529 0.39
530 0.35
531 0.28
532 0.25
533 0.23
534 0.32
535 0.31
536 0.27
537 0.33
538 0.39
539 0.42
540 0.46
541 0.54
542 0.5
543 0.51
544 0.56
545 0.57
546 0.58
547 0.57
548 0.61
549 0.54
550 0.51
551 0.56
552 0.52
553 0.5
554 0.52
555 0.57
556 0.54
557 0.57
558 0.59
559 0.61
560 0.67
561 0.68
562 0.67
563 0.69
564 0.69
565 0.7
566 0.76
567 0.76
568 0.76
569 0.74
570 0.74
571 0.73
572 0.73
573 0.67
574 0.58
575 0.53
576 0.51
577 0.5
578 0.43
579 0.37
580 0.32
581 0.3
582 0.3
583 0.25
584 0.17
585 0.1
586 0.09
587 0.07
588 0.07
589 0.1
590 0.13
591 0.18
592 0.22
593 0.29
594 0.38
595 0.41
596 0.48
597 0.52
598 0.55
599 0.58