Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JAV5

Protein Details
Accession N1JAV5    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-283LPESEKKAKKPPSGRPRGRPALPESEKKAKKPPSGRPRGRPALPENERKTKKTPTGRPRGRPAGVBasic
297-319LDGESTRKRGRPPKKDDTETEEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-280EPKPKKEPSGLPRGRPALPESEKKAKKPPSGRPRGRPALPESEKKAKKPPSGRPRGRPALPENERKTKKTPTGRPRGRP
304-309KRGRPP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
Amino Acid Sequences MASTVTESDFKDALSRYPSIIQKISRKPKAGSLTLEELDKFRYETALTQFDKSTGRVMDISDLKNLIEHHGTFRPTLAKLVSSNSNEKLAAATKDAYEYYANNKEDIAGTLERLTKPLSGIGPAAGSLMLSIHDSKNVVFFSDELYRWLCNDGCKVPLRYTVQEFEKLFSKASDFMARIKCTPVELEKAAFVFINELDPPPEPKPKKEPSGLPRGRPALPESEKKAKKPPSGRPRGRPALPESEKKAKKPPSGRPRGRPALPENERKTKKTPTGRPRGRPAGVATQQSDKQATSVSLDGESTRKRGRPPKKDDTETEEEEVEVEEDNDTDTDRKRSLSVESPINNRNKMAKTRNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.23
4 0.3
5 0.34
6 0.35
7 0.4
8 0.43
9 0.48
10 0.58
11 0.66
12 0.67
13 0.68
14 0.65
15 0.68
16 0.69
17 0.65
18 0.6
19 0.55
20 0.53
21 0.49
22 0.48
23 0.4
24 0.33
25 0.29
26 0.25
27 0.2
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.17
32 0.22
33 0.28
34 0.29
35 0.3
36 0.3
37 0.31
38 0.33
39 0.29
40 0.28
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.24
46 0.27
47 0.27
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.23
52 0.23
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.2
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.25
61 0.25
62 0.22
63 0.24
64 0.21
65 0.18
66 0.18
67 0.22
68 0.26
69 0.27
70 0.31
71 0.29
72 0.31
73 0.28
74 0.27
75 0.25
76 0.22
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.13
85 0.13
86 0.17
87 0.24
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.19
95 0.12
96 0.12
97 0.15
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.14
130 0.15
131 0.13
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.14
137 0.11
138 0.14
139 0.14
140 0.17
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.26
145 0.28
146 0.28
147 0.29
148 0.3
149 0.29
150 0.32
151 0.31
152 0.26
153 0.26
154 0.24
155 0.22
156 0.17
157 0.17
158 0.13
159 0.14
160 0.16
161 0.13
162 0.18
163 0.22
164 0.23
165 0.22
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.19
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.09
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.11
187 0.13
188 0.22
189 0.22
190 0.26
191 0.35
192 0.4
193 0.45
194 0.47
195 0.53
196 0.5
197 0.6
198 0.61
199 0.55
200 0.54
201 0.52
202 0.48
203 0.41
204 0.37
205 0.34
206 0.35
207 0.37
208 0.38
209 0.44
210 0.46
211 0.47
212 0.54
213 0.53
214 0.57
215 0.61
216 0.66
217 0.67
218 0.75
219 0.81
220 0.8
221 0.82
222 0.81
223 0.75
224 0.69
225 0.63
226 0.63
227 0.59
228 0.55
229 0.52
230 0.55
231 0.55
232 0.53
233 0.56
234 0.53
235 0.57
236 0.61
237 0.66
238 0.67
239 0.75
240 0.81
241 0.8
242 0.82
243 0.81
244 0.75
245 0.71
246 0.65
247 0.65
248 0.64
249 0.65
250 0.62
251 0.65
252 0.67
253 0.64
254 0.64
255 0.62
256 0.64
257 0.65
258 0.69
259 0.69
260 0.76
261 0.82
262 0.85
263 0.85
264 0.85
265 0.76
266 0.69
267 0.63
268 0.62
269 0.57
270 0.53
271 0.46
272 0.42
273 0.42
274 0.41
275 0.38
276 0.27
277 0.23
278 0.2
279 0.19
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.18
287 0.19
288 0.21
289 0.26
290 0.28
291 0.36
292 0.46
293 0.56
294 0.62
295 0.7
296 0.76
297 0.8
298 0.84
299 0.81
300 0.8
301 0.77
302 0.7
303 0.63
304 0.52
305 0.42
306 0.35
307 0.3
308 0.21
309 0.13
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.11
317 0.14
318 0.18
319 0.2
320 0.21
321 0.22
322 0.24
323 0.28
324 0.34
325 0.37
326 0.41
327 0.45
328 0.5
329 0.57
330 0.62
331 0.58
332 0.53
333 0.54
334 0.52
335 0.57