Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JHU8

Protein Details
Accession N1JHU8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-447EIEWQLHLKSRRHRTMNKRKVKEGKSNELLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-440SRRHRTMNKRKVKEG
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MSMARKSPRRPLIVIIGATGTGKSQLAIDLAKKFNGEIINADAMQMYVGLPIITNKVSQEEQEEIPHHLLGHVKLEEETWRVDAFQSEARKLLHQIRSKDKIPIVVGGTHYYAQSLLFEDSILSARGAYGTAENLSSDRDISKEFPILDGPSDVILKKLKEVDPVMAERWHPNDIRKIRRSLEIFLTTGEKASDAYAKQKNVTNILLEKESDTNRLSEHLDATSTLIFWLHADSKILDQRLDARVNKMMKAGLLEEIRCMHQYWQEQQQIGVRIDKTRGIWASIGWKQFDPYLSALDKGEDMEQILELCIQQTQAATRRYAKRQVRWIQLKLRPALTKCKSLRDRLYLLDSSDTSRFQQNVSELSISITSKMLANEDLPSPLDSSAIARDVLGGVKEKPDVWFRGECEICQVKTMNEIEWQLHLKSRRHRTMNKRKVKEGKSNELLGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.47
3 0.39
4 0.32
5 0.3
6 0.24
7 0.15
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.11
14 0.14
15 0.17
16 0.23
17 0.25
18 0.26
19 0.26
20 0.24
21 0.27
22 0.26
23 0.23
24 0.18
25 0.21
26 0.23
27 0.22
28 0.22
29 0.18
30 0.16
31 0.14
32 0.12
33 0.08
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.19
47 0.2
48 0.21
49 0.25
50 0.26
51 0.26
52 0.26
53 0.26
54 0.22
55 0.19
56 0.21
57 0.18
58 0.21
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.18
63 0.2
64 0.18
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.18
73 0.21
74 0.2
75 0.23
76 0.24
77 0.25
78 0.29
79 0.35
80 0.38
81 0.4
82 0.46
83 0.53
84 0.58
85 0.59
86 0.61
87 0.54
88 0.5
89 0.45
90 0.42
91 0.35
92 0.31
93 0.3
94 0.25
95 0.25
96 0.2
97 0.19
98 0.15
99 0.13
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.12
129 0.14
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.17
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.18
146 0.18
147 0.22
148 0.24
149 0.24
150 0.25
151 0.27
152 0.26
153 0.23
154 0.23
155 0.2
156 0.21
157 0.22
158 0.2
159 0.21
160 0.29
161 0.35
162 0.44
163 0.47
164 0.49
165 0.48
166 0.53
167 0.53
168 0.47
169 0.45
170 0.38
171 0.33
172 0.29
173 0.29
174 0.22
175 0.2
176 0.16
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.08
182 0.16
183 0.19
184 0.2
185 0.23
186 0.25
187 0.26
188 0.27
189 0.27
190 0.22
191 0.2
192 0.21
193 0.19
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.14
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.1
222 0.13
223 0.14
224 0.12
225 0.11
226 0.15
227 0.19
228 0.23
229 0.21
230 0.21
231 0.25
232 0.27
233 0.27
234 0.24
235 0.2
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.14
249 0.18
250 0.21
251 0.29
252 0.31
253 0.31
254 0.31
255 0.33
256 0.33
257 0.31
258 0.3
259 0.23
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.22
270 0.24
271 0.25
272 0.22
273 0.21
274 0.21
275 0.22
276 0.22
277 0.17
278 0.14
279 0.16
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.12
286 0.12
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.09
301 0.16
302 0.18
303 0.21
304 0.28
305 0.36
306 0.41
307 0.51
308 0.55
309 0.56
310 0.65
311 0.71
312 0.74
313 0.75
314 0.76
315 0.76
316 0.73
317 0.72
318 0.65
319 0.61
320 0.56
321 0.51
322 0.54
323 0.48
324 0.53
325 0.49
326 0.56
327 0.56
328 0.59
329 0.64
330 0.6
331 0.6
332 0.54
333 0.57
334 0.48
335 0.44
336 0.39
337 0.32
338 0.28
339 0.26
340 0.24
341 0.2
342 0.23
343 0.22
344 0.19
345 0.23
346 0.22
347 0.23
348 0.24
349 0.23
350 0.19
351 0.2
352 0.22
353 0.18
354 0.16
355 0.14
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.14
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.13
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.14
383 0.16
384 0.16
385 0.19
386 0.23
387 0.25
388 0.28
389 0.31
390 0.31
391 0.4
392 0.4
393 0.36
394 0.39
395 0.42
396 0.37
397 0.36
398 0.35
399 0.26
400 0.32
401 0.33
402 0.26
403 0.25
404 0.27
405 0.25
406 0.28
407 0.3
408 0.25
409 0.3
410 0.35
411 0.39
412 0.46
413 0.56
414 0.62
415 0.68
416 0.77
417 0.82
418 0.87
419 0.9
420 0.91
421 0.88
422 0.89
423 0.9
424 0.88
425 0.88
426 0.86
427 0.86
428 0.81