Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JIX6

Protein Details
Accession N1JIX6    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-200IEHPAFDRRHHQRQRRNSVITHydrophilic
250-283KGTTKLRSKKASKPEKKKTTHKRTRSTPNGRHGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-275EKRADKKGTTKLRSKKASKPEKKKTTHKRTRS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSNRKENEKRDPLDQMTSKFERLGGSWNNDKLKIFEKDTAKFFSYISDLLSDKDQSVFDEFDNAIDVWNFLKDKYNKISESTTSNFMSKIQSFPNQFEMEEKGIHSAWETLKGYRRKLIAADESFRFAYPDKTLFLILGKTLPPKYSSILDSFRGNKWTVEEKLNILIEKEEDSRDHEIEHPAFDRRHHQRQRRNSVITMENTPDAFVEMRCYKCHGSNHISRNCPYAKAALEYAITLRDKDEKRADKKGTTKLRSKKASKPEKKKTTHKRTRSTPNGRHGYAAYEETSDSTSHNSTSEDSPEEESESDSDFHKPQKVMLTKELISKSTPAAWVLDTGATFPMTDQIHLFRGKLKNIHPITIQVGGGTLTSSHRGTVVVKCADGLWGIAENVFYVPNLGVNLLSAKRLCRTGMEGHFDEKNVWIKDENKTMIHAVQSDGLYIVKHIATELRGKPLDTRVTKQVACPATHRAPDNNLPATHLKTSLNYYRNTSIKCSDNPDFSDKDPDQSDDDLAETKEERARYRLMHPRFGHYSPNIISKLHKTSNIDRVKIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.64
3 0.56
4 0.54
5 0.54
6 0.49
7 0.42
8 0.39
9 0.31
10 0.28
11 0.32
12 0.31
13 0.34
14 0.4
15 0.45
16 0.48
17 0.48
18 0.48
19 0.43
20 0.43
21 0.43
22 0.41
23 0.42
24 0.45
25 0.48
26 0.52
27 0.54
28 0.49
29 0.43
30 0.39
31 0.34
32 0.3
33 0.25
34 0.22
35 0.19
36 0.17
37 0.18
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.18
42 0.16
43 0.15
44 0.18
45 0.18
46 0.16
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.19
51 0.16
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.09
56 0.13
57 0.13
58 0.11
59 0.21
60 0.23
61 0.3
62 0.37
63 0.43
64 0.41
65 0.45
66 0.48
67 0.42
68 0.46
69 0.42
70 0.39
71 0.34
72 0.33
73 0.3
74 0.27
75 0.3
76 0.25
77 0.25
78 0.25
79 0.3
80 0.32
81 0.35
82 0.39
83 0.35
84 0.33
85 0.32
86 0.32
87 0.27
88 0.25
89 0.23
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.32
100 0.37
101 0.39
102 0.4
103 0.41
104 0.36
105 0.37
106 0.4
107 0.41
108 0.4
109 0.42
110 0.38
111 0.39
112 0.37
113 0.34
114 0.29
115 0.2
116 0.19
117 0.18
118 0.19
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.15
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.22
135 0.23
136 0.24
137 0.26
138 0.27
139 0.3
140 0.31
141 0.31
142 0.31
143 0.29
144 0.25
145 0.26
146 0.3
147 0.29
148 0.3
149 0.29
150 0.27
151 0.3
152 0.31
153 0.27
154 0.21
155 0.18
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.13
160 0.12
161 0.16
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.19
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.23
173 0.3
174 0.33
175 0.43
176 0.5
177 0.58
178 0.64
179 0.74
180 0.83
181 0.83
182 0.79
183 0.7
184 0.66
185 0.62
186 0.55
187 0.47
188 0.38
189 0.3
190 0.25
191 0.23
192 0.17
193 0.13
194 0.11
195 0.08
196 0.12
197 0.15
198 0.16
199 0.17
200 0.2
201 0.21
202 0.25
203 0.29
204 0.31
205 0.34
206 0.41
207 0.5
208 0.53
209 0.54
210 0.5
211 0.51
212 0.46
213 0.4
214 0.32
215 0.26
216 0.21
217 0.19
218 0.19
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.09
226 0.1
227 0.16
228 0.17
229 0.22
230 0.3
231 0.36
232 0.41
233 0.49
234 0.52
235 0.5
236 0.56
237 0.6
238 0.62
239 0.59
240 0.63
241 0.63
242 0.69
243 0.72
244 0.71
245 0.7
246 0.7
247 0.76
248 0.77
249 0.8
250 0.81
251 0.83
252 0.85
253 0.87
254 0.88
255 0.88
256 0.88
257 0.87
258 0.85
259 0.83
260 0.86
261 0.86
262 0.86
263 0.82
264 0.81
265 0.77
266 0.69
267 0.61
268 0.51
269 0.42
270 0.33
271 0.26
272 0.17
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.14
301 0.18
302 0.17
303 0.18
304 0.26
305 0.29
306 0.3
307 0.32
308 0.35
309 0.32
310 0.37
311 0.36
312 0.29
313 0.25
314 0.23
315 0.2
316 0.18
317 0.17
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.15
336 0.16
337 0.16
338 0.18
339 0.22
340 0.25
341 0.29
342 0.3
343 0.37
344 0.37
345 0.4
346 0.33
347 0.32
348 0.31
349 0.29
350 0.26
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.07
357 0.05
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.12
364 0.15
365 0.21
366 0.19
367 0.19
368 0.19
369 0.19
370 0.18
371 0.16
372 0.13
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.09
390 0.08
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.14
395 0.15
396 0.16
397 0.15
398 0.19
399 0.25
400 0.3
401 0.35
402 0.35
403 0.36
404 0.36
405 0.35
406 0.31
407 0.27
408 0.28
409 0.22
410 0.22
411 0.23
412 0.26
413 0.31
414 0.37
415 0.37
416 0.3
417 0.31
418 0.32
419 0.3
420 0.28
421 0.24
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.16
426 0.14
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.11
436 0.19
437 0.21
438 0.26
439 0.27
440 0.28
441 0.31
442 0.36
443 0.43
444 0.4
445 0.42
446 0.42
447 0.48
448 0.48
449 0.47
450 0.48
451 0.43
452 0.4
453 0.39
454 0.4
455 0.4
456 0.43
457 0.44
458 0.4
459 0.42
460 0.47
461 0.51
462 0.48
463 0.42
464 0.42
465 0.42
466 0.43
467 0.38
468 0.34
469 0.28
470 0.25
471 0.31
472 0.36
473 0.37
474 0.35
475 0.39
476 0.44
477 0.48
478 0.48
479 0.47
480 0.44
481 0.45
482 0.47
483 0.49
484 0.47
485 0.47
486 0.49
487 0.5
488 0.47
489 0.43
490 0.48
491 0.41
492 0.41
493 0.38
494 0.36
495 0.34
496 0.32
497 0.32
498 0.23
499 0.23
500 0.2
501 0.18
502 0.18
503 0.16
504 0.17
505 0.2
506 0.23
507 0.25
508 0.26
509 0.31
510 0.32
511 0.41
512 0.48
513 0.5
514 0.57
515 0.57
516 0.61
517 0.63
518 0.61
519 0.6
520 0.51
521 0.53
522 0.46
523 0.51
524 0.44
525 0.39
526 0.41
527 0.4
528 0.47
529 0.44
530 0.47
531 0.46
532 0.53
533 0.62
534 0.66