Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JED5

Protein Details
Accession N1JED5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-221RAFDRRSRRYSRSPPPRQRDSREBasic
255-276ATRSRSRSPVRRRPQSPSRNRSHydrophilic
320-392SSRSRSYSRSPSPAKRRRPKPKTKSPSPSISRRARRARSRSRSSSTSRSPTRTHRRRRSRSRARTRASPSPDSHydrophilic
395-445HVPYKQPETRRDRGHNEYRLTRSRSITPRERRNSWRNRSRSRDNGERIRKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-176RR
190-216RRRIDRYSGRAFDRRSRRYSRSPPPRQ
255-386ATRSRSRSPVRRRPQSPSRNRSPIPRRKSITPPRRVDSYRGRGERSAKGKGFERRAARRSPSYTNSSRSRSYSRSPSPAKRRRPKPKTKSPSPSISRRARRARSRSRSSSTSRSPTRTHRRRRSRSRARTRA
417-445SRSITPRERRNSWRNRSRSRDNGERIRKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002483  PWI_dom  
IPR036483  PWI_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51025  PWI  
Amino Acid Sequences MACSVDAKLLKSTKFPPEFNQKVDMQKVNAEVMKKWIAGKISEILGNDDDVVIELCFNLIEGSRYPDIKKTQIQLTGFLDKDTAGFCKELWKLCLSAQENPQGVPKELLEAKKLELIQEKLEAGKAAEEARKKREAEQHQQQDNSKIRSRQNEREDRSNRGERGEYGDRNSRGGRRDSWRGGFAERDIDRRRIDRYSGRAFDRRSRRYSRSPPPRQRDSREMDSFRPIRGPDTYIPPHRFERRKTSISDSRSSSATRSRSRSPVRRRPQSPSRNRSPIPRRKSITPPRRVDSYRGRGERSAKGKGFERRAARRSPSYTNSSRSRSYSRSPSPAKRRRPKPKTKSPSPSISRRARRARSRSRSSSTSRSPTRTHRRRRSRSRARTRASPSPDSDNHVPYKQPETRRDRGHNEYRLTRSRSITPRERRNSWRNRSRSRDNGERIRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.52
4 0.58
5 0.62
6 0.6
7 0.6
8 0.54
9 0.55
10 0.6
11 0.56
12 0.47
13 0.45
14 0.44
15 0.43
16 0.41
17 0.35
18 0.29
19 0.31
20 0.32
21 0.3
22 0.29
23 0.27
24 0.27
25 0.26
26 0.28
27 0.26
28 0.24
29 0.25
30 0.24
31 0.24
32 0.22
33 0.21
34 0.18
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.07
48 0.08
49 0.14
50 0.17
51 0.19
52 0.21
53 0.27
54 0.31
55 0.35
56 0.4
57 0.4
58 0.43
59 0.48
60 0.47
61 0.46
62 0.46
63 0.46
64 0.4
65 0.35
66 0.29
67 0.23
68 0.22
69 0.19
70 0.15
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.17
75 0.21
76 0.24
77 0.25
78 0.25
79 0.25
80 0.27
81 0.35
82 0.31
83 0.34
84 0.35
85 0.4
86 0.38
87 0.38
88 0.41
89 0.35
90 0.33
91 0.28
92 0.23
93 0.22
94 0.25
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.22
99 0.25
100 0.25
101 0.23
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.25
106 0.24
107 0.2
108 0.21
109 0.18
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.15
115 0.21
116 0.24
117 0.29
118 0.35
119 0.35
120 0.41
121 0.48
122 0.53
123 0.57
124 0.64
125 0.68
126 0.67
127 0.7
128 0.65
129 0.64
130 0.62
131 0.57
132 0.51
133 0.48
134 0.48
135 0.54
136 0.6
137 0.61
138 0.65
139 0.7
140 0.69
141 0.74
142 0.72
143 0.68
144 0.68
145 0.66
146 0.56
147 0.49
148 0.46
149 0.36
150 0.41
151 0.4
152 0.34
153 0.31
154 0.37
155 0.35
156 0.36
157 0.37
158 0.33
159 0.31
160 0.33
161 0.35
162 0.33
163 0.41
164 0.43
165 0.43
166 0.42
167 0.4
168 0.38
169 0.33
170 0.27
171 0.27
172 0.23
173 0.27
174 0.27
175 0.3
176 0.3
177 0.31
178 0.33
179 0.28
180 0.31
181 0.3
182 0.34
183 0.38
184 0.41
185 0.43
186 0.45
187 0.45
188 0.5
189 0.54
190 0.52
191 0.52
192 0.55
193 0.57
194 0.61
195 0.68
196 0.71
197 0.72
198 0.77
199 0.8
200 0.82
201 0.85
202 0.82
203 0.79
204 0.77
205 0.73
206 0.7
207 0.66
208 0.61
209 0.53
210 0.53
211 0.48
212 0.4
213 0.35
214 0.27
215 0.22
216 0.2
217 0.22
218 0.17
219 0.23
220 0.27
221 0.31
222 0.34
223 0.35
224 0.38
225 0.43
226 0.47
227 0.44
228 0.5
229 0.51
230 0.51
231 0.51
232 0.55
233 0.54
234 0.53
235 0.54
236 0.46
237 0.4
238 0.38
239 0.36
240 0.29
241 0.28
242 0.3
243 0.32
244 0.33
245 0.36
246 0.44
247 0.52
248 0.6
249 0.64
250 0.69
251 0.73
252 0.78
253 0.78
254 0.79
255 0.81
256 0.82
257 0.82
258 0.8
259 0.79
260 0.77
261 0.74
262 0.75
263 0.75
264 0.75
265 0.71
266 0.71
267 0.66
268 0.64
269 0.73
270 0.74
271 0.74
272 0.74
273 0.73
274 0.68
275 0.7
276 0.67
277 0.63
278 0.62
279 0.61
280 0.6
281 0.57
282 0.56
283 0.53
284 0.56
285 0.56
286 0.51
287 0.5
288 0.43
289 0.43
290 0.47
291 0.51
292 0.52
293 0.51
294 0.54
295 0.55
296 0.58
297 0.61
298 0.6
299 0.6
300 0.58
301 0.59
302 0.55
303 0.55
304 0.55
305 0.55
306 0.56
307 0.53
308 0.51
309 0.49
310 0.5
311 0.47
312 0.49
313 0.52
314 0.52
315 0.56
316 0.61
317 0.67
318 0.72
319 0.77
320 0.81
321 0.82
322 0.86
323 0.88
324 0.91
325 0.93
326 0.92
327 0.94
328 0.94
329 0.94
330 0.93
331 0.89
332 0.88
333 0.84
334 0.83
335 0.81
336 0.81
337 0.79
338 0.78
339 0.82
340 0.81
341 0.84
342 0.85
343 0.87
344 0.87
345 0.88
346 0.87
347 0.84
348 0.81
349 0.78
350 0.77
351 0.74
352 0.73
353 0.7
354 0.67
355 0.65
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357 0.73
358 0.74
359 0.77
360 0.78
361 0.83
362 0.89
363 0.94
364 0.95
365 0.95
366 0.96
367 0.96
368 0.96
369 0.91
370 0.9
371 0.86
372 0.85
373 0.81
374 0.77
375 0.69
376 0.67
377 0.63
378 0.61
379 0.57
380 0.53
381 0.5
382 0.45
383 0.43
384 0.38
385 0.45
386 0.45
387 0.49
388 0.53
389 0.58
390 0.64
391 0.72
392 0.77
393 0.76
394 0.79
395 0.8
396 0.78
397 0.77
398 0.77
399 0.75
400 0.75
401 0.73
402 0.69
403 0.63
404 0.64
405 0.65
406 0.67
407 0.69
408 0.71
409 0.75
410 0.79
411 0.82
412 0.83
413 0.85
414 0.87
415 0.87
416 0.87
417 0.87
418 0.89
419 0.9
420 0.9
421 0.89
422 0.87
423 0.87
424 0.86
425 0.87