Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JKG9

Protein Details
Accession N1JKG9    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-257VPGAGGKAKRERERRQKQFLEIDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-106RGRG
239-249GKAKRERERRQ
265-293RGRGGGGPRGGRGRGGRGGRGDGPSRAGR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 13, cyto 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVVASKNLYELLGNTHDEDSDREPEPPVKVIDKTPARTTKRNAPAEAPSSKVPESTGGRGGSRAVQGNEGAFRDRNAGSAQNRAKPIDEVERQRNRGSGEGRGRGGRSEPRNFDRHSRGVGGDSEKQASHGWGANEGKAELADEQAGEALANAETKDAMASWGEAEAASGAVNDAEREENNISYADYLIQQQEKKLALAAETPQLRKPNEGREQDKKWANAKPICRDEEEDLVPGAGGKAKRERERRQKQFLEIDQRFTEGSERGRGGGGPRGGRGRGGRGGRGDGPSRAGRGNGGQGNPETNASINTNDTSAFPSLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.23
7 0.22
8 0.22
9 0.22
10 0.21
11 0.24
12 0.28
13 0.29
14 0.29
15 0.28
16 0.28
17 0.29
18 0.31
19 0.38
20 0.41
21 0.43
22 0.49
23 0.55
24 0.58
25 0.63
26 0.66
27 0.67
28 0.7
29 0.72
30 0.66
31 0.61
32 0.61
33 0.6
34 0.56
35 0.49
36 0.41
37 0.39
38 0.36
39 0.32
40 0.25
41 0.25
42 0.27
43 0.27
44 0.3
45 0.28
46 0.28
47 0.28
48 0.28
49 0.25
50 0.24
51 0.25
52 0.2
53 0.2
54 0.2
55 0.21
56 0.22
57 0.2
58 0.19
59 0.15
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.22
66 0.21
67 0.3
68 0.34
69 0.36
70 0.38
71 0.37
72 0.37
73 0.32
74 0.34
75 0.33
76 0.35
77 0.37
78 0.44
79 0.51
80 0.53
81 0.53
82 0.52
83 0.44
84 0.44
85 0.39
86 0.38
87 0.37
88 0.38
89 0.39
90 0.39
91 0.37
92 0.32
93 0.34
94 0.33
95 0.33
96 0.36
97 0.4
98 0.42
99 0.47
100 0.48
101 0.51
102 0.5
103 0.46
104 0.42
105 0.38
106 0.34
107 0.31
108 0.31
109 0.28
110 0.25
111 0.23
112 0.22
113 0.19
114 0.2
115 0.18
116 0.16
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.11
127 0.11
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.25
193 0.25
194 0.28
195 0.31
196 0.35
197 0.42
198 0.48
199 0.51
200 0.55
201 0.6
202 0.63
203 0.65
204 0.59
205 0.56
206 0.53
207 0.55
208 0.52
209 0.54
210 0.55
211 0.56
212 0.54
213 0.51
214 0.5
215 0.45
216 0.44
217 0.38
218 0.3
219 0.24
220 0.21
221 0.18
222 0.15
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.12
227 0.19
228 0.27
229 0.36
230 0.45
231 0.56
232 0.64
233 0.75
234 0.81
235 0.84
236 0.83
237 0.81
238 0.81
239 0.78
240 0.78
241 0.69
242 0.64
243 0.54
244 0.49
245 0.42
246 0.33
247 0.28
248 0.2
249 0.22
250 0.21
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.22
256 0.25
257 0.27
258 0.24
259 0.26
260 0.3
261 0.29
262 0.33
263 0.33
264 0.32
265 0.35
266 0.36
267 0.38
268 0.37
269 0.41
270 0.41
271 0.43
272 0.4
273 0.34
274 0.36
275 0.34
276 0.33
277 0.3
278 0.27
279 0.24
280 0.24
281 0.31
282 0.31
283 0.29
284 0.3
285 0.3
286 0.32
287 0.31
288 0.28
289 0.21
290 0.17
291 0.19
292 0.17
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.17