FuNGI

N1JEF1

Protein Details

Accession

N1JEF1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-96	SQPIELDRRKRCKYQSQKTCGEQGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 6, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MALGLLYLLARDKYSANYIITFVKISLERTHSQIRDAEVLEAPKDNLETIGRLTEKLAMQAEERRGEHDTVSQPIELDRRKRCKYQSQKTCGEQGQKKRGGTELLRMGFDSIDNSTVTQNKNPTEEPIFSSRISPHNNEAPKRNNVSKRNTRAVYGKNSPKNSQNVPLCHSSASRKSSDSRKKKIDPIKFVASNSDESDVEIPKTFKPPCSEFLDPEWAKTSNRDISGSPDEPLIRKFDSTQGFKRFDIDSTESFVEESNTQLSCFKVITVDNTPQSSSEASSSVVHSKGKDCGIARSTTPSKSFKAYLDLGFDESPDSSYHVSRAYISDEESPNLGSSGLINSLASTPSLALCPMCYEPVCSDELREYGPMNTRKQEKFCLSHRIKTAKENWTSNRYPAIEWDLLDSRVSNHHGFIQRLIKGETSYYRALLQEKVDQGKDRNLRTMTSNLIPGYYGPRGLRIISENIFREFTPLLKEYIIQDRLMAARGYTPYVQSVLVPEVAARLITEDLQITLPEARRIMAESASVGELLHEETRDVIPETVLDHGNNPNHSINAQYLYKDGVIEAAYRGTYSVSDCSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.23
3	0.23
4	0.24
5	0.25
6	0.27
7	0.27
8	0.24
9	0.19
10	0.2
11	0.19
12	0.21
13	0.25
14	0.29
15	0.29
16	0.34
17	0.43
18	0.39
19	0.41
20	0.41
21	0.39
22	0.38
23	0.37
24	0.35
25	0.29
26	0.3
27	0.28
28	0.26
29	0.23
30	0.19
31	0.18
32	0.15
33	0.14
34	0.14
35	0.14
36	0.14
37	0.19
38	0.19
39	0.19
40	0.2
41	0.23
42	0.22
43	0.24
44	0.25
45	0.2
46	0.22
47	0.28
48	0.33
49	0.33
50	0.33
51	0.32
52	0.33
53	0.33
54	0.32
55	0.32
56	0.3
57	0.28
58	0.3
59	0.27
60	0.24
61	0.25
62	0.32
63	0.31
64	0.36
65	0.42
66	0.5
67	0.56
68	0.64
69	0.69
70	0.73
71	0.78
72	0.81
73	0.82
74	0.81
75	0.84
76	0.8
77	0.8
78	0.75
79	0.73
80	0.7
81	0.7
82	0.71
83	0.69
84	0.66
85	0.59
86	0.56
87	0.53
88	0.48
89	0.46
90	0.43
91	0.39
92	0.38
93	0.37
94	0.34
95	0.27
96	0.25
97	0.18
98	0.11
99	0.1
100	0.1
101	0.11
102	0.13
103	0.17
104	0.19
105	0.22
106	0.26
107	0.27
108	0.31
109	0.31
110	0.33
111	0.33
112	0.33
113	0.32
114	0.32
115	0.33
116	0.29
117	0.31
118	0.29
119	0.32
120	0.34
121	0.33
122	0.34
123	0.39
124	0.45
125	0.47
126	0.51
127	0.51
128	0.54
129	0.57
130	0.61
131	0.62
132	0.63
133	0.7
134	0.73
135	0.74
136	0.76
137	0.7
138	0.65
139	0.64
140	0.62
141	0.6
142	0.59
143	0.6
144	0.58
145	0.62
146	0.61
147	0.6
148	0.6
149	0.55
150	0.55
151	0.52
152	0.48
153	0.47
154	0.48
155	0.42
156	0.37
157	0.36
158	0.33
159	0.33
160	0.34
161	0.32
162	0.3
163	0.35
164	0.44
165	0.53
166	0.57
167	0.59
168	0.65
169	0.69
170	0.76
171	0.8
172	0.78
173	0.76
174	0.73
175	0.72
176	0.65
177	0.59
178	0.54
179	0.47
180	0.4
181	0.32
182	0.28
183	0.19
184	0.18
185	0.19
186	0.16
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.13
191	0.2
192	0.2
193	0.22
194	0.27
195	0.29
196	0.31
197	0.37
198	0.38
199	0.34
200	0.37
201	0.43
202	0.38
203	0.35
204	0.34
205	0.28
206	0.26
207	0.25
208	0.27
209	0.21
210	0.23
211	0.23
212	0.21
213	0.26
214	0.31
215	0.3
216	0.25
217	0.23
218	0.22
219	0.21
220	0.22
221	0.19
222	0.14
223	0.13
224	0.14
225	0.19
226	0.24
227	0.29
228	0.35
229	0.39
230	0.41
231	0.4
232	0.42
233	0.36
234	0.31
235	0.31
236	0.28
237	0.21
238	0.22
239	0.22
240	0.2
241	0.19
242	0.18
243	0.14
244	0.1
245	0.1
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.11
257	0.14
258	0.17
259	0.17
260	0.18
261	0.18
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.12
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.15
277	0.15
278	0.17
279	0.15
280	0.18
281	0.19
282	0.19
283	0.18
284	0.22
285	0.23
286	0.22
287	0.26
288	0.25
289	0.24
290	0.26
291	0.27
292	0.22
293	0.24
294	0.24
295	0.22
296	0.21
297	0.2
298	0.19
299	0.17
300	0.16
301	0.12
302	0.1
303	0.1
304	0.07
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.11
313	0.12
314	0.11
315	0.12
316	0.16
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.15
321	0.12
322	0.12
323	0.1
324	0.06
325	0.05
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.09
344	0.08
345	0.1
346	0.1
347	0.12
348	0.14
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.13
353	0.12
354	0.13
355	0.11
356	0.12
357	0.2
358	0.24
359	0.25
360	0.3
361	0.36
362	0.39
363	0.42
364	0.46
365	0.45
366	0.45
367	0.47
368	0.53
369	0.5
370	0.52
371	0.56
372	0.56
373	0.51
374	0.53
375	0.57
376	0.54
377	0.56
378	0.56
379	0.55
380	0.56
381	0.56
382	0.5
383	0.48
384	0.41
385	0.35
386	0.31
387	0.32
388	0.26
389	0.24
390	0.26
391	0.22
392	0.21
393	0.21
394	0.18
395	0.13
396	0.15
397	0.19
398	0.16
399	0.15
400	0.21
401	0.25
402	0.26
403	0.29
404	0.32
405	0.3
406	0.32
407	0.32
408	0.27
409	0.23
410	0.25
411	0.23
412	0.21
413	0.2
414	0.19
415	0.19
416	0.2
417	0.21
418	0.22
419	0.21
420	0.22
421	0.25
422	0.28
423	0.29
424	0.31
425	0.31
426	0.37
427	0.41
428	0.38
429	0.41
430	0.38
431	0.38
432	0.38
433	0.39
434	0.34
435	0.3
436	0.31
437	0.24
438	0.23
439	0.21
440	0.18
441	0.2
442	0.17
443	0.18
444	0.15
445	0.18
446	0.19
447	0.19
448	0.21
449	0.19
450	0.23
451	0.22
452	0.27
453	0.26
454	0.28
455	0.28
456	0.26
457	0.26
458	0.21
459	0.2
460	0.2
461	0.19
462	0.19
463	0.18
464	0.19
465	0.2
466	0.28
467	0.29
468	0.23
469	0.22
470	0.23
471	0.23
472	0.24
473	0.21
474	0.12
475	0.14
476	0.15
477	0.18
478	0.17
479	0.17
480	0.16
481	0.17
482	0.17
483	0.14
484	0.15
485	0.14
486	0.14
487	0.13
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.1
492	0.08
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.14
503	0.16
504	0.17
505	0.17
506	0.17
507	0.17
508	0.2
509	0.2
510	0.16
511	0.15
512	0.14
513	0.15
514	0.15
515	0.14
516	0.11
517	0.09
518	0.09
519	0.1
520	0.11
521	0.09
522	0.09
523	0.12
524	0.12
525	0.14
526	0.16
527	0.14
528	0.12
529	0.13
530	0.14
531	0.15
532	0.16
533	0.15
534	0.16
535	0.22
536	0.26
537	0.27
538	0.3
539	0.28
540	0.28
541	0.28
542	0.27
543	0.24
544	0.25
545	0.25
546	0.22
547	0.21
548	0.23
549	0.23
550	0.21
551	0.17
552	0.14
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.13
557	0.12
558	0.12
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.13

N1JEF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer