FuNGI

N1JIP2

Protein Details

Accession

N1JIP2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
167-206	LRTLKDKSSSSKKTKRPKNPKVSAKTNKRKPNPKISSNLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
173-202	KSSSSKKTKRPKNPKVSAKTNKRKPNPKIS
339-347	VKKAARKKK
381-408	KNIPKLKPSGKLHSKIKLKSKSKNVKAK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MAPHRSYLVMSSPPRQHKAIDLSSSPLPSLSELVNSISKDAQRGHAVSNTVDPLCRSESMKTPAPESFHMIGNSISGNDWSNIQSICGPDVEPKLPLKGLEPDEMNEEVSIYQERSKIITKPIELKVLDEFSSPETKYLKSIQMDESGTEENPLPLENIGSGREQTLRTLKDKSSSSKKTKRPKNPKVSAKTNKRKPNPKISSNLDAKFPKGKVTKPSTSLASVPKIDRSVPGTEQPIIDTPGFGLMDAVKRRRDWTPPNKPNSSFDTKDSVAKWPSSCESNKSGDKKSRFFDLFGKFAFSGSDSTVDQKPVPKDRVASKRKEIELVKTNNSSTKLSPVKKAARKKKATTITELATSFYAETNPPESLSPKDLPVVKFPSKNIPKLKPSGKLHSKIKLKSKSKNVKAKEPTLLSPESALKEVHKQDFVFGTSSQLAMDDSPTFIRNINEAIQESNNLYDPFNSSPTVTSTLEGVVAKRNLWNAASRDSAGSLLETDIVDLETLSSDMSITSRPSFAENSEKNCFIVSSSAAHSRNAIISLENIDIEEEAPKYSQTSSPRQKLNYPPTSKNKHQINSLCNKIFSLPDSSVHRIDAEQIPNFNSYTNAQLAKEISMYHFKAVKKREQMIDLLENCWRGKQQIKMAVATTKSAIKNTTLSINTDKFQEQPMDCFTEPHESSLNSLIIPATSKFIPIQANTLNQIEKKNDVQLLLDETPTKEHGNSLQFEESGSDLDINPYSSGPKVQPSSSISSLSQLEPTNDDTHLLFSHITSAIKNTKPSDDCSNPTWYEKMLLYDPIVLEDLTIWLNTGALQETNWDGEVELRDVKKWCESKSVCCLSRESLRNGTRCRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.54
3	0.51
4	0.5
5	0.56
6	0.55
7	0.52
8	0.45
9	0.45
10	0.47
11	0.46
12	0.38
13	0.29
14	0.23
15	0.18
16	0.19
17	0.15
18	0.13
19	0.14
20	0.17
21	0.2
22	0.19
23	0.2
24	0.22
25	0.22
26	0.24
27	0.26
28	0.28
29	0.3
30	0.32
31	0.33
32	0.34
33	0.34
34	0.32
35	0.33
36	0.32
37	0.27
38	0.26
39	0.23
40	0.22
41	0.24
42	0.25
43	0.23
44	0.23
45	0.31
46	0.36
47	0.43
48	0.41
49	0.41
50	0.42
51	0.44
52	0.42
53	0.41
54	0.37
55	0.34
56	0.33
57	0.3
58	0.27
59	0.24
60	0.22
61	0.15
62	0.13
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.13
67	0.13
68	0.15
69	0.14
70	0.15
71	0.16
72	0.15
73	0.16
74	0.15
75	0.15
76	0.17
77	0.22
78	0.22
79	0.23
80	0.23
81	0.25
82	0.25
83	0.25
84	0.23
85	0.27
86	0.29
87	0.31
88	0.3
89	0.28
90	0.31
91	0.31
92	0.29
93	0.21
94	0.18
95	0.13
96	0.13
97	0.14
98	0.11
99	0.13
100	0.15
101	0.16
102	0.19
103	0.22
104	0.24
105	0.31
106	0.36
107	0.37
108	0.43
109	0.46
110	0.49
111	0.46
112	0.44
113	0.4
114	0.37
115	0.33
116	0.26
117	0.23
118	0.19
119	0.24
120	0.23
121	0.21
122	0.21
123	0.21
124	0.24
125	0.27
126	0.31
127	0.28
128	0.32
129	0.32
130	0.35
131	0.36
132	0.33
133	0.31
134	0.26
135	0.23
136	0.21
137	0.19
138	0.13
139	0.13
140	0.12
141	0.1
142	0.08
143	0.09
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.11
148	0.11
149	0.12
150	0.15
151	0.15
152	0.18
153	0.24
154	0.26
155	0.28
156	0.33
157	0.33
158	0.37
159	0.41
160	0.44
161	0.48
162	0.54
163	0.62
164	0.66
165	0.74
166	0.78
167	0.85
168	0.88
169	0.89
170	0.9
171	0.91
172	0.91
173	0.93
174	0.91
175	0.92
176	0.91
177	0.91
178	0.91
179	0.89
180	0.89
181	0.88
182	0.9
183	0.87
184	0.88
185	0.86
186	0.82
187	0.81
188	0.77
189	0.77
190	0.74
191	0.66
192	0.62
193	0.54
194	0.49
195	0.47
196	0.41
197	0.4
198	0.36
199	0.4
200	0.42
201	0.49
202	0.53
203	0.5
204	0.53
205	0.48
206	0.46
207	0.45
208	0.4
209	0.36
210	0.33
211	0.3
212	0.3
213	0.29
214	0.27
215	0.25
216	0.24
217	0.24
218	0.23
219	0.26
220	0.26
221	0.26
222	0.25
223	0.24
224	0.22
225	0.21
226	0.18
227	0.14
228	0.11
229	0.13
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.08
234	0.14
235	0.18
236	0.22
237	0.22
238	0.23
239	0.26
240	0.3
241	0.37
242	0.42
243	0.49
244	0.57
245	0.63
246	0.71
247	0.74
248	0.72
249	0.68
250	0.65
251	0.61
252	0.52
253	0.46
254	0.44
255	0.39
256	0.4
257	0.37
258	0.35
259	0.3
260	0.3
261	0.28
262	0.25
263	0.26
264	0.27
265	0.28
266	0.26
267	0.28
268	0.32
269	0.38
270	0.41
271	0.46
272	0.49
273	0.53
274	0.53
275	0.51
276	0.53
277	0.47
278	0.44
279	0.45
280	0.41
281	0.38
282	0.34
283	0.35
284	0.27
285	0.25
286	0.23
287	0.16
288	0.13
289	0.11
290	0.13
291	0.1
292	0.13
293	0.14
294	0.15
295	0.15
296	0.19
297	0.23
298	0.28
299	0.31
300	0.3
301	0.32
302	0.4
303	0.5
304	0.52
305	0.53
306	0.54
307	0.58
308	0.57
309	0.6
310	0.53
311	0.5
312	0.51
313	0.5
314	0.46
315	0.41
316	0.4
317	0.37
318	0.38
319	0.33
320	0.24
321	0.28
322	0.31
323	0.32
324	0.35
325	0.4
326	0.47
327	0.53
328	0.62
329	0.64
330	0.67
331	0.73
332	0.73
333	0.75
334	0.75
335	0.7
336	0.67
337	0.6
338	0.51
339	0.46
340	0.42
341	0.33
342	0.24
343	0.21
344	0.14
345	0.1
346	0.1
347	0.07
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.1
353	0.11
354	0.12
355	0.16
356	0.16
357	0.15
358	0.18
359	0.21
360	0.21
361	0.25
362	0.3
363	0.29
364	0.3
365	0.31
366	0.38
367	0.39
368	0.45
369	0.48
370	0.47
371	0.48
372	0.53
373	0.56
374	0.55
375	0.55
376	0.58
377	0.58
378	0.59
379	0.59
380	0.61
381	0.63
382	0.59
383	0.64
384	0.64
385	0.63
386	0.64
387	0.7
388	0.72
389	0.75
390	0.78
391	0.72
392	0.72
393	0.71
394	0.67
395	0.62
396	0.54
397	0.46
398	0.41
399	0.38
400	0.28
401	0.24
402	0.21
403	0.16
404	0.15
405	0.14
406	0.11
407	0.16
408	0.19
409	0.2
410	0.2
411	0.19
412	0.19
413	0.2
414	0.2
415	0.16
416	0.12
417	0.13
418	0.11
419	0.11
420	0.1
421	0.09
422	0.08
423	0.06
424	0.07
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.09
432	0.08
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.11
439	0.12
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.09
444	0.09
445	0.08
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.11
451	0.11
452	0.13
453	0.17
454	0.15
455	0.14
456	0.12
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.13
466	0.12
467	0.13
468	0.17
469	0.15
470	0.18
471	0.18
472	0.18
473	0.17
474	0.16
475	0.16
476	0.11
477	0.1
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.04
495	0.05
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.08
500	0.1
501	0.11
502	0.13
503	0.22
504	0.23
505	0.28
506	0.3
507	0.3
508	0.29
509	0.28
510	0.26
511	0.17
512	0.15
513	0.11
514	0.1
515	0.12
516	0.18
517	0.19
518	0.19
519	0.19
520	0.18
521	0.18
522	0.17
523	0.15
524	0.09
525	0.09
526	0.11
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.08
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.09
540	0.13
541	0.17
542	0.27
543	0.36
544	0.42
545	0.47
546	0.49
547	0.54
548	0.59
549	0.64
550	0.64
551	0.61
552	0.63
553	0.68
554	0.73
555	0.72
556	0.71
557	0.69
558	0.62
559	0.64
560	0.62
561	0.61
562	0.61
563	0.64
564	0.56
565	0.48
566	0.45
567	0.38
568	0.33
569	0.26
570	0.23
571	0.16
572	0.19
573	0.24
574	0.27
575	0.27
576	0.26
577	0.25
578	0.2
579	0.23
580	0.25
581	0.23
582	0.22
583	0.22
584	0.23
585	0.24
586	0.24
587	0.2
588	0.16
589	0.13
590	0.14
591	0.16
592	0.16
593	0.15
594	0.17
595	0.18
596	0.17
597	0.16
598	0.14
599	0.13
600	0.18
601	0.18
602	0.2
603	0.24
604	0.25
605	0.32
606	0.37
607	0.43
608	0.44
609	0.5
610	0.51
611	0.49
612	0.49
613	0.47
614	0.49
615	0.42
616	0.36
617	0.32
618	0.3
619	0.27
620	0.26
621	0.21
622	0.16
623	0.21
624	0.26
625	0.32
626	0.38
627	0.4
628	0.41
629	0.42
630	0.43
631	0.38
632	0.33
633	0.26
634	0.24
635	0.23
636	0.22
637	0.22
638	0.2
639	0.21
640	0.21
641	0.26
642	0.22
643	0.24
644	0.28
645	0.29
646	0.28
647	0.29
648	0.28
649	0.23
650	0.25
651	0.28
652	0.23
653	0.24
654	0.26
655	0.3
656	0.29
657	0.29
658	0.27
659	0.3
660	0.3
661	0.29
662	0.28
663	0.22
664	0.24
665	0.27
666	0.25
667	0.16
668	0.16
669	0.14
670	0.12
671	0.13
672	0.12
673	0.11
674	0.1
675	0.12
676	0.12
677	0.15
678	0.19
679	0.17
680	0.22
681	0.23
682	0.25
683	0.27
684	0.29
685	0.28
686	0.27
687	0.3
688	0.27
689	0.28
690	0.28
691	0.3
692	0.3
693	0.27
694	0.26
695	0.24
696	0.28
697	0.26
698	0.24
699	0.2
700	0.19
701	0.21
702	0.22
703	0.21
704	0.15
705	0.16
706	0.21
707	0.25
708	0.27
709	0.29
710	0.29
711	0.27
712	0.27
713	0.26
714	0.21
715	0.16
716	0.14
717	0.11
718	0.09
719	0.11
720	0.12
721	0.12
722	0.12
723	0.11
724	0.12
725	0.12
726	0.15
727	0.15
728	0.21
729	0.23
730	0.24
731	0.29
732	0.32
733	0.38
734	0.37
735	0.38
736	0.32
737	0.32
738	0.33
739	0.29
740	0.28
741	0.23
742	0.22
743	0.21
744	0.25
745	0.23
746	0.21
747	0.22
748	0.18
749	0.19
750	0.18
751	0.17
752	0.13
753	0.11
754	0.15
755	0.15
756	0.16
757	0.14
758	0.19
759	0.25
760	0.28
761	0.33
762	0.32
763	0.39
764	0.41
765	0.45
766	0.49
767	0.47
768	0.48
769	0.47
770	0.52
771	0.46
772	0.46
773	0.43
774	0.34
775	0.32
776	0.29
777	0.3
778	0.24
779	0.25
780	0.23
781	0.25
782	0.24
783	0.22
784	0.21
785	0.17
786	0.14
787	0.12
788	0.12
789	0.09
790	0.09
791	0.08
792	0.07
793	0.07
794	0.08
795	0.08
796	0.09
797	0.08
798	0.08
799	0.1
800	0.12
801	0.13
802	0.13
803	0.12
804	0.11
805	0.14
806	0.17
807	0.17
808	0.21
809	0.21
810	0.24
811	0.27
812	0.29
813	0.35
814	0.38
815	0.38
816	0.43
817	0.46
818	0.51
819	0.59
820	0.66
821	0.6
822	0.58
823	0.58
824	0.53
825	0.59
826	0.57
827	0.53
828	0.54
829	0.57
830	0.63

N1JIP2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer