Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JIV2

Protein Details
Accession N1JIV2    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MSSNSSSPHQQKKERSSKKRVFNNQLNPEVAHydrophilic
65-85NEPLENRPSKKRKTEASKIEVHydrophilic
87-114INAPNPPSKKELRRLKKGKKIPASKTVPHydrophilic
327-355NQPKGTNSNKPIKKKLRKVWVNRINGRSLHydrophilic
361-384EDAQVRYKKRYGKKLEDKETPGPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-78KKRKT
90-109PNPPSKKELRRLKKGKKIPA
337-344PIKKKLRK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSNSSSPHQQKKERSSKKRVFNNQLNPEVAVAPNVDSSDSEVSQGEEEEEEELKPECKLGSSTNEPLENRPSKKRKTEASKIEVDINAPNPPSKKELRRLKKGKKIPASKTVPTDEIKVTKTEAEKRSEHGIWIGNLPFHVSPEDLNKFLVDNSEIKKEMITRIHMPRPHDDKSLKAEGTQKVGKTVLNKGFAYVDFSSAEAVTEALLLTEKLLNGRRVLIKDHKSFEGRITVKKPDIRSDGKAPSKRVFVGNLSFDTTEDNLKEHFEKCGPTTSIKVATFEDSGKCKGYAWIVFDKIESAESAVRGFIHREDTQSDSELDSEDENQPKGTNSNKPIKKKLRKVWVNRINGRSLRMEFAEDAQVRYKKRYGKKLEDKETPGPSQETTKHESAIVAKTIEYRQPYAPRLTGGIVESKGKKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.88
3 0.89
4 0.89
5 0.91
6 0.91
7 0.91
8 0.9
9 0.9
10 0.9
11 0.88
12 0.85
13 0.76
14 0.66
15 0.57
16 0.47
17 0.37
18 0.27
19 0.19
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.14
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.13
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.16
48 0.22
49 0.28
50 0.33
51 0.36
52 0.41
53 0.41
54 0.42
55 0.47
56 0.48
57 0.47
58 0.52
59 0.57
60 0.61
61 0.69
62 0.74
63 0.75
64 0.77
65 0.82
66 0.82
67 0.79
68 0.77
69 0.7
70 0.67
71 0.57
72 0.48
73 0.41
74 0.32
75 0.28
76 0.22
77 0.23
78 0.2
79 0.22
80 0.26
81 0.31
82 0.38
83 0.45
84 0.55
85 0.62
86 0.72
87 0.81
88 0.85
89 0.88
90 0.88
91 0.88
92 0.88
93 0.88
94 0.83
95 0.83
96 0.8
97 0.74
98 0.7
99 0.64
100 0.57
101 0.49
102 0.45
103 0.38
104 0.34
105 0.31
106 0.26
107 0.24
108 0.24
109 0.27
110 0.32
111 0.34
112 0.36
113 0.36
114 0.38
115 0.43
116 0.4
117 0.36
118 0.3
119 0.28
120 0.24
121 0.25
122 0.23
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.09
130 0.09
131 0.16
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.21
149 0.23
150 0.25
151 0.31
152 0.37
153 0.39
154 0.4
155 0.44
156 0.47
157 0.46
158 0.46
159 0.4
160 0.38
161 0.42
162 0.45
163 0.37
164 0.33
165 0.37
166 0.32
167 0.37
168 0.36
169 0.3
170 0.25
171 0.26
172 0.25
173 0.21
174 0.27
175 0.26
176 0.28
177 0.28
178 0.27
179 0.27
180 0.25
181 0.27
182 0.2
183 0.16
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.07
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.14
205 0.17
206 0.17
207 0.22
208 0.27
209 0.32
210 0.35
211 0.37
212 0.37
213 0.37
214 0.36
215 0.34
216 0.34
217 0.29
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.33
222 0.37
223 0.37
224 0.34
225 0.38
226 0.37
227 0.38
228 0.41
229 0.45
230 0.49
231 0.52
232 0.5
233 0.46
234 0.45
235 0.42
236 0.37
237 0.31
238 0.26
239 0.26
240 0.24
241 0.22
242 0.22
243 0.2
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.12
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.16
257 0.16
258 0.23
259 0.23
260 0.22
261 0.24
262 0.25
263 0.29
264 0.28
265 0.28
266 0.22
267 0.23
268 0.23
269 0.22
270 0.22
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.17
276 0.18
277 0.2
278 0.2
279 0.22
280 0.25
281 0.25
282 0.25
283 0.25
284 0.23
285 0.19
286 0.17
287 0.13
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.2
301 0.23
302 0.24
303 0.24
304 0.24
305 0.18
306 0.18
307 0.16
308 0.14
309 0.11
310 0.13
311 0.16
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.21
318 0.23
319 0.27
320 0.32
321 0.42
322 0.49
323 0.57
324 0.66
325 0.74
326 0.8
327 0.82
328 0.84
329 0.85
330 0.87
331 0.89
332 0.9
333 0.89
334 0.88
335 0.86
336 0.81
337 0.78
338 0.7
339 0.63
340 0.57
341 0.5
342 0.43
343 0.35
344 0.34
345 0.26
346 0.26
347 0.31
348 0.27
349 0.27
350 0.3
351 0.34
352 0.33
353 0.37
354 0.41
355 0.42
356 0.5
357 0.59
358 0.62
359 0.69
360 0.78
361 0.84
362 0.87
363 0.87
364 0.85
365 0.82
366 0.78
367 0.69
368 0.61
369 0.53
370 0.45
371 0.43
372 0.42
373 0.4
374 0.4
375 0.39
376 0.37
377 0.35
378 0.36
379 0.34
380 0.33
381 0.3
382 0.24
383 0.23
384 0.26
385 0.29
386 0.32
387 0.31
388 0.3
389 0.34
390 0.4
391 0.45
392 0.47
393 0.45
394 0.42
395 0.41
396 0.39
397 0.34
398 0.29
399 0.3
400 0.25
401 0.3
402 0.31
403 0.32