FuNGI

N1JLX0

Protein Details

Accession

N1JLX0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
67-96	DDEEPDDRERRRRKDKKRRRAEREEEEAIL	Acidic
109-139	PEFQRKTSSAQPKLKRLKRGHRGNGEERSKR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
74-88	RERRRRKDKKRRRAE
120-139	PKLKRLKRGHRGNGEERSKR
465-472	KRRPGSKP

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000791 C:euchromatin GO:0005634 C:nucleus GO:0005721 C:pericentric heterochromatin GO:0003677 F:DNA binding GO:0042393 F:histone binding GO:0031491 F:nucleosome binding GO:0001073 F:transcription antitermination factor activity, DNA binding GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0000433 P:carbon catabolite repression of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006334 P:nucleosome assembly GO:0016973 P:poly(A)+ mRNA export from nucleus GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0071931 P:positive regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle GO:0031440 P:regulation of mRNA 3'-end processing GO:0001178 P:regulation of transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter GO:0140673 P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling
Pfam	View protein in Pfam PF14641 HTH_44 PF14632 SPT6_acidic

Amino Acid Sequences

MSMQDLIHGEAELDEEENEDSFDEENGEVRTKKRIPNGDLDDSSEEEDDDDEEAARAIREGFIIDDDDEEPDDRERRRRKDKKRRRAEREEEEAILDEEDLDLIGEANPEFQRKTSSAQPKLKRLKRGHRGNGEERSKRGLEEIFSDDEELDGPPATESRFARSDHHRVDEFADFIEEDDLEDEDERQRHQEEMEVARPREKNYAVGSDATGLDKDALEDMEAIFGNGEDYDWALALEDEAEAREAGDHTLELKDVFEPSQLSEKLLTDADNTIRWADEPERFQLDRNPYKHVIISEEQFKEENRWITSLIWPKKQLPNDLQVPFTKAIGKVLEFFVVDEVEVPYVFQHRKDYLIHATKTLVHGNNGADQDEFQVSAQKLLNQDDLWRILELDLKFRALVEKRNVIEKTYENLKSRAGVEDKTVEDMIPAAATMEELQDIQDYIYFHYSLELKDLNIMNNDSKEKRRPGSKPSIFDRIRKGKVYGLLRAYGITPNQVAQNALREGRKQFTEDASESPIDLADAIVTESEFSTGEQVLSAARQMYAEELFASPRMRKHFRMSYYMMGAVHCYRTEKGLRKIDEQHPYYELKYLRNKTFSDIANKPEIFLKMLKAEEEGLVEVKVLLQHERDFKKQLFSEFASDNYSELADAWNDERQKVLELAFTKLERIITKGVKESMRTECQDSILKICREEYSKKLDQAPYQPAGMSLGTVPRVLALSSGNGDPGRDAVCWAWVEEDGRVVENGKINNILKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.09
4	0.09
5	0.09
6	0.08
7	0.08
8	0.08
9	0.09
10	0.09
11	0.09
12	0.11
13	0.13
14	0.17
15	0.18
16	0.19
17	0.29
18	0.33
19	0.4
20	0.47
21	0.54
22	0.55
23	0.64
24	0.7
25	0.7
26	0.65
27	0.62
28	0.56
29	0.48
30	0.44
31	0.34
32	0.25
33	0.17
34	0.16
35	0.13
36	0.11
37	0.09
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.1
50	0.12
51	0.11
52	0.12
53	0.12
54	0.13
55	0.14
56	0.14
57	0.14
58	0.16
59	0.21
60	0.23
61	0.33
62	0.41
63	0.5
64	0.61
65	0.71
66	0.78
67	0.85
68	0.92
69	0.93
70	0.95
71	0.96
72	0.95
73	0.96
74	0.95
75	0.93
76	0.9
77	0.83
78	0.73
79	0.63
80	0.54
81	0.43
82	0.33
83	0.23
84	0.14
85	0.09
86	0.08
87	0.06
88	0.05
89	0.04
90	0.04
91	0.05
92	0.06
93	0.05
94	0.09
95	0.1
96	0.12
97	0.13
98	0.13
99	0.18
100	0.19
101	0.24
102	0.3
103	0.4
104	0.48
105	0.57
106	0.64
107	0.7
108	0.79
109	0.81
110	0.82
111	0.81
112	0.82
113	0.83
114	0.87
115	0.86
116	0.86
117	0.87
118	0.86
119	0.86
120	0.84
121	0.78
122	0.7
123	0.66
124	0.56
125	0.48
126	0.42
127	0.34
128	0.26
129	0.26
130	0.28
131	0.24
132	0.23
133	0.24
134	0.2
135	0.17
136	0.16
137	0.12
138	0.09
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.07
143	0.08
144	0.13
145	0.13
146	0.18
147	0.21
148	0.22
149	0.28
150	0.35
151	0.44
152	0.43
153	0.48
154	0.44
155	0.42
156	0.44
157	0.41
158	0.33
159	0.24
160	0.2
161	0.14
162	0.14
163	0.13
164	0.09
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.14
175	0.15
176	0.16
177	0.16
178	0.19
179	0.21
180	0.25
181	0.31
182	0.35
183	0.35
184	0.4
185	0.42
186	0.39
187	0.4
188	0.36
189	0.33
190	0.3
191	0.34
192	0.29
193	0.29
194	0.27
195	0.22
196	0.22
197	0.18
198	0.14
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.03
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.09
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.17
252	0.17
253	0.17
254	0.16
255	0.11
256	0.12
257	0.13
258	0.12
259	0.12
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.12
264	0.13
265	0.16
266	0.17
267	0.19
268	0.24
269	0.24
270	0.25
271	0.29
272	0.35
273	0.39
274	0.39
275	0.42
276	0.38
277	0.39
278	0.4
279	0.35
280	0.3
281	0.24
282	0.25
283	0.26
284	0.25
285	0.25
286	0.24
287	0.23
288	0.22
289	0.23
290	0.24
291	0.18
292	0.18
293	0.18
294	0.19
295	0.25
296	0.31
297	0.32
298	0.32
299	0.34
300	0.38
301	0.42
302	0.45
303	0.45
304	0.39
305	0.41
306	0.44
307	0.43
308	0.4
309	0.35
310	0.35
311	0.3
312	0.27
313	0.22
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.14
318	0.12
319	0.12
320	0.13
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.08
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.12
336	0.13
337	0.15
338	0.17
339	0.2
340	0.25
341	0.31
342	0.3
343	0.28
344	0.28
345	0.27
346	0.28
347	0.29
348	0.21
349	0.15
350	0.17
351	0.16
352	0.2
353	0.19
354	0.17
355	0.13
356	0.12
357	0.13
358	0.11
359	0.1
360	0.06
361	0.1
362	0.1
363	0.12
364	0.12
365	0.13
366	0.14
367	0.16
368	0.17
369	0.13
370	0.14
371	0.13
372	0.14
373	0.13
374	0.11
375	0.1
376	0.09
377	0.14
378	0.13
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.16
385	0.13
386	0.19
387	0.2
388	0.26
389	0.26
390	0.32
391	0.33
392	0.29
393	0.31
394	0.26
395	0.26
396	0.26
397	0.31
398	0.27
399	0.27
400	0.27
401	0.26
402	0.25
403	0.26
404	0.21
405	0.17
406	0.16
407	0.18
408	0.18
409	0.18
410	0.17
411	0.13
412	0.11
413	0.11
414	0.09
415	0.05
416	0.05
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.09
433	0.08
434	0.1
435	0.11
436	0.09
437	0.11
438	0.11
439	0.09
440	0.13
441	0.15
442	0.14
443	0.14
444	0.16
445	0.15
446	0.16
447	0.2
448	0.19
449	0.23
450	0.28
451	0.32
452	0.35
453	0.43
454	0.45
455	0.51
456	0.59
457	0.61
458	0.61
459	0.6
460	0.66
461	0.6
462	0.6
463	0.6
464	0.58
465	0.56
466	0.52
467	0.49
468	0.42
469	0.46
470	0.45
471	0.41
472	0.34
473	0.31
474	0.29
475	0.28
476	0.25
477	0.2
478	0.17
479	0.13
480	0.11
481	0.1
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.14
487	0.15
488	0.18
489	0.18
490	0.2
491	0.22
492	0.25
493	0.25
494	0.23
495	0.23
496	0.23
497	0.27
498	0.26
499	0.25
500	0.25
501	0.23
502	0.21
503	0.19
504	0.16
505	0.1
506	0.09
507	0.07
508	0.03
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.1
537	0.12
538	0.13
539	0.17
540	0.24
541	0.28
542	0.32
543	0.4
544	0.46
545	0.49
546	0.54
547	0.54
548	0.51
549	0.48
550	0.46
551	0.38
552	0.3
553	0.28
554	0.22
555	0.19
556	0.15
557	0.15
558	0.14
559	0.18
560	0.25
561	0.31
562	0.39
563	0.46
564	0.49
565	0.52
566	0.61
567	0.64
568	0.66
569	0.6
570	0.53
571	0.48
572	0.46
573	0.41
574	0.39
575	0.33
576	0.31
577	0.38
578	0.43
579	0.45
580	0.48
581	0.48
582	0.47
583	0.51
584	0.48
585	0.47
586	0.43
587	0.41
588	0.45
589	0.44
590	0.4
591	0.38
592	0.35
593	0.29
594	0.27
595	0.26
596	0.21
597	0.22
598	0.22
599	0.19
600	0.19
601	0.17
602	0.17
603	0.15
604	0.11
605	0.11
606	0.1
607	0.09
608	0.08
609	0.09
610	0.09
611	0.1
612	0.11
613	0.16
614	0.24
615	0.29
616	0.33
617	0.37
618	0.38
619	0.44
620	0.45
621	0.45
622	0.42
623	0.41
624	0.41
625	0.37
626	0.36
627	0.32
628	0.29
629	0.25
630	0.19
631	0.17
632	0.12
633	0.11
634	0.11
635	0.07
636	0.09
637	0.1
638	0.15
639	0.16
640	0.16
641	0.17
642	0.17
643	0.19
644	0.19
645	0.18
646	0.19
647	0.19
648	0.23
649	0.25
650	0.24
651	0.23
652	0.23
653	0.25
654	0.2
655	0.22
656	0.27
657	0.27
658	0.3
659	0.34
660	0.38
661	0.38
662	0.4
663	0.42
664	0.42
665	0.45
666	0.45
667	0.45
668	0.4
669	0.41
670	0.44
671	0.4
672	0.39
673	0.4
674	0.39
675	0.36
676	0.36
677	0.37
678	0.37
679	0.41
680	0.4
681	0.41
682	0.46
683	0.49
684	0.55
685	0.56
686	0.57
687	0.6
688	0.62
689	0.55
690	0.5
691	0.45
692	0.38
693	0.34
694	0.27
695	0.2
696	0.14
697	0.14
698	0.14
699	0.14
700	0.14
701	0.12
702	0.13
703	0.12
704	0.12
705	0.09
706	0.11
707	0.13
708	0.14
709	0.16
710	0.16
711	0.16
712	0.15
713	0.16
714	0.15
715	0.13
716	0.15
717	0.12
718	0.16
719	0.17
720	0.17
721	0.16
722	0.16
723	0.18
724	0.16
725	0.19
726	0.16
727	0.16
728	0.17
729	0.16
730	0.18
731	0.22
732	0.23
733	0.21
734	0.27
735	0.29

N1JLX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer