Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1J9Z1

Protein Details
Accession N1J9Z1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-34IVEKSSSKRKTAPIKNNSSKENKKAKTHydrophilic
37-65ELETKSKSKTKSTPPKKIKDNVKENSHEPHydrophilic
138-158LARTKKIWERLRRKSHVPLDEHydrophilic
701-720TGKNEKKSLSSKKQVQTGNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-55KRKTAPIKNNSSKENKKAKTTSELETKSKSKTKSTPPKKIK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MPSATATIVEKSSSKRKTAPIKNNSSKENKKAKTTSELETKSKSKTKSTPPKKIKDNVKENSHEPTLRRANHNNEASKALSEDDENFDEESLPKAEDGLHPDRVKAVAQNNQSSREAHAKQKQLALERKAAKPLADDLARTKKIWERLRRKSHVPLDERKQLVTELFAIITGKVKDFVLKHDSVRVVQTAIKYANQEQKRTIAKELAGTYRQLAESRYAKFLIGKLLVQGDDTIRDVIVPEFFGHVRHLIKHSEASWILDDIYRGIATKQQKASLLREWYGAEFVLFRNISDQTTDELSKILEADPGKRSPIMRSLTEMINQLIQKKMTGFTLLHDAMLQYYLNIKSGTTEATEFIEMITGDEGDLCKNLAFTKSGSRLMALILAHTTAKDRRRILKAYKETFQAMATDQHGHIVILAAYEVIDDTVLTAKSIFPELLSKDTDKQVENIVSFVNDLNARTTILYLYQGRSKALFPNSHSSDLDILTEIDVARSSTSKKDPIIRRAELAKSLSPYVLKAIENAASDLVQTSFGCQFITEVLFGADGDKSAALESVAYTAVGDPSSLYSDAGDDMETNATNSETIGHIGTRSHGAKMLRSLIAGGRFDPGRKAINPIVPALNFPDILYPHIKNHIVEWATGPASFVILALIESNNFSHKEKVMALLRSATEKLQKASSDETLGQKASRSAAEEGSTKNKNSVTGKNEKKSLSSKKQVQTGNKGSQLILGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.43
3 0.52
4 0.61
5 0.69
6 0.74
7 0.75
8 0.81
9 0.86
10 0.86
11 0.85
12 0.85
13 0.83
14 0.82
15 0.82
16 0.76
17 0.76
18 0.75
19 0.73
20 0.72
21 0.68
22 0.65
23 0.64
24 0.65
25 0.6
26 0.61
27 0.59
28 0.58
29 0.6
30 0.56
31 0.55
32 0.58
33 0.64
34 0.69
35 0.76
36 0.79
37 0.83
38 0.89
39 0.89
40 0.9
41 0.89
42 0.89
43 0.88
44 0.86
45 0.85
46 0.8
47 0.73
48 0.71
49 0.66
50 0.59
51 0.5
52 0.51
53 0.51
54 0.52
55 0.57
56 0.58
57 0.61
58 0.66
59 0.73
60 0.67
61 0.6
62 0.58
63 0.51
64 0.44
65 0.36
66 0.28
67 0.2
68 0.18
69 0.18
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.15
84 0.22
85 0.24
86 0.31
87 0.31
88 0.31
89 0.32
90 0.32
91 0.3
92 0.28
93 0.29
94 0.29
95 0.35
96 0.43
97 0.44
98 0.48
99 0.48
100 0.44
101 0.41
102 0.43
103 0.41
104 0.42
105 0.47
106 0.49
107 0.51
108 0.55
109 0.55
110 0.55
111 0.6
112 0.55
113 0.56
114 0.55
115 0.54
116 0.55
117 0.52
118 0.44
119 0.38
120 0.36
121 0.34
122 0.29
123 0.28
124 0.28
125 0.37
126 0.38
127 0.36
128 0.36
129 0.35
130 0.43
131 0.51
132 0.55
133 0.57
134 0.66
135 0.76
136 0.79
137 0.8
138 0.81
139 0.8
140 0.79
141 0.76
142 0.74
143 0.71
144 0.74
145 0.68
146 0.59
147 0.51
148 0.42
149 0.35
150 0.27
151 0.21
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.15
163 0.15
164 0.21
165 0.24
166 0.25
167 0.26
168 0.3
169 0.32
170 0.29
171 0.3
172 0.26
173 0.21
174 0.21
175 0.2
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.24
181 0.32
182 0.34
183 0.35
184 0.33
185 0.39
186 0.43
187 0.44
188 0.41
189 0.36
190 0.33
191 0.35
192 0.36
193 0.34
194 0.29
195 0.27
196 0.25
197 0.23
198 0.23
199 0.19
200 0.17
201 0.18
202 0.22
203 0.23
204 0.25
205 0.23
206 0.23
207 0.24
208 0.24
209 0.23
210 0.2
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.13
233 0.13
234 0.15
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.19
240 0.21
241 0.2
242 0.2
243 0.18
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.12
254 0.15
255 0.21
256 0.23
257 0.24
258 0.29
259 0.32
260 0.36
261 0.37
262 0.37
263 0.31
264 0.31
265 0.29
266 0.25
267 0.23
268 0.18
269 0.12
270 0.09
271 0.08
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.1
281 0.13
282 0.13
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.12
292 0.15
293 0.16
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.24
299 0.24
300 0.21
301 0.24
302 0.26
303 0.25
304 0.26
305 0.25
306 0.18
307 0.18
308 0.18
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.1
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.16
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.04
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.13
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.17
368 0.11
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.11
376 0.15
377 0.2
378 0.24
379 0.3
380 0.35
381 0.42
382 0.47
383 0.52
384 0.58
385 0.56
386 0.56
387 0.51
388 0.47
389 0.42
390 0.35
391 0.26
392 0.17
393 0.16
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.06
403 0.04
404 0.04
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.02
410 0.02
411 0.02
412 0.03
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.14
426 0.15
427 0.17
428 0.2
429 0.22
430 0.19
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.19
435 0.17
436 0.14
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.16
454 0.16
455 0.17
456 0.18
457 0.18
458 0.21
459 0.25
460 0.27
461 0.27
462 0.35
463 0.38
464 0.4
465 0.38
466 0.34
467 0.3
468 0.26
469 0.23
470 0.15
471 0.11
472 0.08
473 0.09
474 0.08
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.13
482 0.16
483 0.2
484 0.23
485 0.32
486 0.39
487 0.47
488 0.54
489 0.51
490 0.5
491 0.51
492 0.5
493 0.45
494 0.41
495 0.34
496 0.28
497 0.27
498 0.25
499 0.2
500 0.19
501 0.17
502 0.17
503 0.14
504 0.13
505 0.14
506 0.16
507 0.16
508 0.16
509 0.14
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.09
514 0.08
515 0.07
516 0.09
517 0.09
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.1
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.06
531 0.05
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.05
549 0.06
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.08
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.11
575 0.15
576 0.16
577 0.16
578 0.19
579 0.2
580 0.23
581 0.27
582 0.3
583 0.25
584 0.24
585 0.24
586 0.24
587 0.27
588 0.25
589 0.21
590 0.19
591 0.2
592 0.21
593 0.22
594 0.22
595 0.22
596 0.22
597 0.28
598 0.3
599 0.34
600 0.35
601 0.36
602 0.37
603 0.32
604 0.32
605 0.29
606 0.26
607 0.2
608 0.19
609 0.2
610 0.16
611 0.19
612 0.23
613 0.21
614 0.22
615 0.28
616 0.3
617 0.27
618 0.28
619 0.33
620 0.29
621 0.27
622 0.27
623 0.25
624 0.23
625 0.23
626 0.22
627 0.14
628 0.13
629 0.12
630 0.1
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.07
638 0.08
639 0.11
640 0.13
641 0.15
642 0.18
643 0.19
644 0.22
645 0.23
646 0.3
647 0.34
648 0.34
649 0.34
650 0.34
651 0.34
652 0.34
653 0.34
654 0.3
655 0.3
656 0.3
657 0.31
658 0.32
659 0.32
660 0.32
661 0.36
662 0.36
663 0.33
664 0.33
665 0.35
666 0.34
667 0.34
668 0.31
669 0.28
670 0.27
671 0.25
672 0.23
673 0.22
674 0.22
675 0.23
676 0.25
677 0.27
678 0.29
679 0.35
680 0.37
681 0.34
682 0.36
683 0.34
684 0.38
685 0.41
686 0.46
687 0.46
688 0.52
689 0.62
690 0.64
691 0.69
692 0.64
693 0.65
694 0.66
695 0.69
696 0.69
697 0.69
698 0.72
699 0.72
700 0.79
701 0.8
702 0.8
703 0.79
704 0.78
705 0.76
706 0.72
707 0.66
708 0.58
709 0.53