Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1JCQ1

Protein Details
Accession N1JCQ1    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-246SNPSSGQKGTRKKNNKEKTTKKKQAWNHSIKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-239KGTRKKNNKEKTTKKKQA
629-637RGRGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Amino Acid Sequences MSDQENDHNTPNSETKELQTEESNISSEIRPEIKDGSADYHDHSLQKFYLGYRARRGELALKNERFCAFKSLKEYPHQYIGNTNRQKVVDSYFGQGKLYNQSWELFYIYGLNEETQTPLILITTRQLVHFLEKINTDLKIKLTIPSGSKGAFEVKFENGMPRPRYLGNAQSKDTVEKLQLNVPARDEHLTGESEILPRDNEKIKQEFKDKLVLISNPSSGQKGTRKKNNKEKTTKKKQAWNHSIKRVQRYLGIRLSRTEKSNAQNDTKHSDSNPNRQDSSKQRAEDLSSIVYFDPEKPAAFPTEDSVVFICVDVEAWERNSKIITEIGFATLDTKDIASIAPGERGTNWMKAIRPRHFRIIENKHYVNKDFVTGCADRFEFGKSEFISLKDAPQVVSSCFKHPFSKIEEIPEDDHTRRKIVLVGHDVSSDVVYLRKLGYDVFNLSNLEELIDTAEMNRYLTRQLNPQNLGAALYGLGITAWNLHNAGNDAVYTLQAMIALAIKQVTEREKKNRTDAEVTQEPASIRIEDEGWSTSGNLSDGGEPQLISLIKAKLINEQENSSNIKSPTPAKVTSEPWEKDSPIKTASISKSTWNHRSSTSKEYPHGGKTRTNNQIQSSSNRGGGQNSGRGRGRGRGRRMVVQEESGQTWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.38
4 0.38
5 0.36
6 0.34
7 0.33
8 0.33
9 0.32
10 0.31
11 0.23
12 0.24
13 0.22
14 0.21
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.22
19 0.24
20 0.23
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.25
26 0.26
27 0.27
28 0.28
29 0.3
30 0.29
31 0.27
32 0.24
33 0.25
34 0.24
35 0.2
36 0.27
37 0.31
38 0.36
39 0.41
40 0.46
41 0.45
42 0.45
43 0.47
44 0.47
45 0.47
46 0.51
47 0.52
48 0.52
49 0.52
50 0.54
51 0.53
52 0.46
53 0.4
54 0.4
55 0.32
56 0.32
57 0.38
58 0.43
59 0.47
60 0.53
61 0.57
62 0.52
63 0.58
64 0.55
65 0.48
66 0.49
67 0.52
68 0.54
69 0.54
70 0.52
71 0.49
72 0.48
73 0.49
74 0.42
75 0.4
76 0.36
77 0.32
78 0.34
79 0.34
80 0.34
81 0.33
82 0.31
83 0.29
84 0.29
85 0.29
86 0.26
87 0.22
88 0.23
89 0.24
90 0.24
91 0.23
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.19
116 0.21
117 0.22
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.21
124 0.2
125 0.19
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.25
131 0.25
132 0.26
133 0.27
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.24
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.21
143 0.21
144 0.25
145 0.23
146 0.3
147 0.31
148 0.29
149 0.31
150 0.3
151 0.33
152 0.31
153 0.37
154 0.39
155 0.41
156 0.41
157 0.42
158 0.42
159 0.4
160 0.39
161 0.31
162 0.24
163 0.23
164 0.23
165 0.23
166 0.27
167 0.29
168 0.29
169 0.28
170 0.26
171 0.25
172 0.25
173 0.22
174 0.18
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.14
186 0.17
187 0.2
188 0.24
189 0.31
190 0.35
191 0.4
192 0.45
193 0.46
194 0.44
195 0.48
196 0.43
197 0.39
198 0.38
199 0.34
200 0.31
201 0.28
202 0.27
203 0.21
204 0.21
205 0.19
206 0.16
207 0.2
208 0.25
209 0.32
210 0.4
211 0.49
212 0.58
213 0.67
214 0.78
215 0.83
216 0.85
217 0.87
218 0.89
219 0.9
220 0.91
221 0.91
222 0.87
223 0.85
224 0.83
225 0.83
226 0.83
227 0.83
228 0.8
229 0.79
230 0.79
231 0.76
232 0.75
233 0.67
234 0.57
235 0.52
236 0.48
237 0.45
238 0.45
239 0.43
240 0.36
241 0.36
242 0.4
243 0.36
244 0.35
245 0.32
246 0.31
247 0.33
248 0.38
249 0.4
250 0.39
251 0.4
252 0.4
253 0.42
254 0.38
255 0.34
256 0.29
257 0.35
258 0.35
259 0.42
260 0.46
261 0.43
262 0.43
263 0.43
264 0.49
265 0.46
266 0.5
267 0.46
268 0.4
269 0.38
270 0.38
271 0.39
272 0.34
273 0.28
274 0.21
275 0.15
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.07
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.17
338 0.23
339 0.31
340 0.35
341 0.41
342 0.43
343 0.5
344 0.51
345 0.53
346 0.57
347 0.58
348 0.59
349 0.58
350 0.57
351 0.53
352 0.52
353 0.49
354 0.41
355 0.32
356 0.27
357 0.21
358 0.19
359 0.19
360 0.18
361 0.17
362 0.16
363 0.16
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.1
368 0.11
369 0.14
370 0.12
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.18
375 0.17
376 0.18
377 0.17
378 0.17
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.13
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.23
387 0.24
388 0.25
389 0.26
390 0.29
391 0.29
392 0.35
393 0.33
394 0.35
395 0.35
396 0.35
397 0.35
398 0.35
399 0.33
400 0.27
401 0.3
402 0.26
403 0.26
404 0.23
405 0.22
406 0.22
407 0.2
408 0.26
409 0.27
410 0.28
411 0.27
412 0.27
413 0.26
414 0.23
415 0.19
416 0.13
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.11
427 0.14
428 0.14
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.15
433 0.13
434 0.11
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.11
447 0.15
448 0.17
449 0.23
450 0.3
451 0.37
452 0.39
453 0.39
454 0.37
455 0.33
456 0.32
457 0.24
458 0.17
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.03
465 0.03
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.1
492 0.16
493 0.21
494 0.28
495 0.38
496 0.46
497 0.51
498 0.59
499 0.62
500 0.61
501 0.61
502 0.58
503 0.57
504 0.53
505 0.51
506 0.43
507 0.39
508 0.33
509 0.28
510 0.26
511 0.18
512 0.14
513 0.13
514 0.13
515 0.11
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.11
523 0.11
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.14
533 0.13
534 0.13
535 0.16
536 0.15
537 0.17
538 0.19
539 0.2
540 0.23
541 0.29
542 0.34
543 0.32
544 0.34
545 0.34
546 0.36
547 0.4
548 0.34
549 0.34
550 0.29
551 0.28
552 0.28
553 0.3
554 0.34
555 0.35
556 0.36
557 0.36
558 0.41
559 0.44
560 0.49
561 0.54
562 0.48
563 0.48
564 0.5
565 0.46
566 0.47
567 0.46
568 0.42
569 0.34
570 0.34
571 0.3
572 0.35
573 0.38
574 0.36
575 0.34
576 0.37
577 0.43
578 0.5
579 0.57
580 0.51
581 0.49
582 0.5
583 0.57
584 0.55
585 0.57
586 0.58
587 0.55
588 0.56
589 0.6
590 0.59
591 0.6
592 0.62
593 0.56
594 0.55
595 0.57
596 0.63
597 0.66
598 0.68
599 0.65
600 0.62
601 0.65
602 0.62
603 0.6
604 0.58
605 0.52
606 0.48
607 0.45
608 0.42
609 0.36
610 0.39
611 0.38
612 0.39
613 0.38
614 0.42
615 0.42
616 0.44
617 0.45
618 0.47
619 0.52
620 0.54
621 0.59
622 0.62
623 0.65
624 0.7
625 0.73
626 0.72
627 0.66
628 0.6
629 0.57
630 0.5