FuNGI

S8DUP4

Protein Details

Accession

S8DUP4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1035-1054	WESSLPPPVLRKKRNDDTED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MEAAQNGSMPPKVDDEQAKRLRRAQLKELNETQAGQAPAKALDSSLKRHTALIKRIRQSVGVENRDQIIKDIETLSLEKYVDELAGAALEGISRCKTEKDVWSAAEIISMLHRRFPKTFTPGLVSALSAALAPPNRAALAALAPEQREKEDAARVTRQRPVLRVCAELALVGIIRDAPGRSGGEWMIKVIKDLLSLDPTLSSLPLLSTFLKSFARPYLGITPPATSKQISASSEPGTLSSTTTDEANARVNGAFPALTKEEDELVEKEIRDRFKRMCEGYFESVAKKLVNEHTRLQEQDKRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLASCQTLSELLYVPMPELKTASQKSESILIGAHTGISVNGGDAESVTGGKWEDEEERRFFEEIPDLKDYVPKSVLGLEGDSDEAADADSKEKEKERVQEEVRKLEEELAELKVGEDGQVNGDAADGDANAKADEGEDEDDAPTPTAGTPKTSPPTTPQLAPQGPSQMLTALLARLPDATNRTMIDQAAVEFAFLNSKAARKRLAKFMTQIPKSRTDLLPHYSRLIATLNKYMLDIGRDVVDLLDEEFRYLQRKKKVVIELAEVRLRNLTFISNLTKFRVIPPHVILHMFKVCLDDFHGTNVDNFAILLEGCGRFLLRSDETMEPFSKMLELMRRKQSMQHFDQRQQMVLENAYYQCNPPERTARQEKERTPMELFIRHLIYDVLTKKTIDKVLKLIRKLDWNDDAVLRTLHKVFTKPWKVKWGSIALLAMLTYDLQRYHPAFAVAVVDQVLEDIRRGLEQNVYNINQRRVATVKYLGELYIYRLISSGIIFDTLWTLVTFGHPEGRPSPGLPCAIDMPDDFFRVRLVCVILDTVGMCFDRGTQLKKLDNFLAFFQMYVLSKEPLPMDVEFMLTDSLEAVRPKLTLFKTYEDAAAVVDEMFLTALQNAGIMTAEDSGDDSDGEGEEGEEGGRTKADDEDGEEHSQAASPVDERAPSPEAVVLKANQENMGPSPEDDADFLRELAKMEADTSADSRKVDKKTALAMWESSLPPPVLRKKRNDDTEDEENLATNGAEHPGTMNFTLFTKRGNKPQARALAIPAESALAVQTRTAQMQDKVEQQHLKRLVLQYEQREESEELRGKSLP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.39
3	0.48
4	0.56
5	0.62
6	0.61
7	0.67
8	0.7
9	0.69
10	0.7
11	0.7
12	0.7
13	0.69
14	0.74
15	0.72
16	0.68
17	0.6
18	0.54
19	0.45
20	0.41
21	0.36
22	0.28
23	0.24
24	0.2
25	0.2
26	0.2
27	0.18
28	0.13
29	0.19
30	0.22
31	0.27
32	0.32
33	0.36
34	0.35
35	0.39
36	0.47
37	0.49
38	0.55
39	0.59
40	0.62
41	0.63
42	0.69
43	0.68
44	0.62
45	0.57
46	0.57
47	0.57
48	0.54
49	0.51
50	0.46
51	0.47
52	0.46
53	0.41
54	0.33
55	0.27
56	0.22
57	0.22
58	0.21
59	0.19
60	0.19
61	0.2
62	0.19
63	0.18
64	0.17
65	0.15
66	0.14
67	0.14
68	0.12
69	0.1
70	0.09
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.05
75	0.04
76	0.05
77	0.06
78	0.08
79	0.09
80	0.1
81	0.11
82	0.13
83	0.18
84	0.24
85	0.31
86	0.37
87	0.42
88	0.42
89	0.43
90	0.42
91	0.38
92	0.32
93	0.24
94	0.16
95	0.17
96	0.21
97	0.18
98	0.23
99	0.27
100	0.3
101	0.33
102	0.37
103	0.4
104	0.42
105	0.46
106	0.44
107	0.47
108	0.43
109	0.44
110	0.4
111	0.31
112	0.25
113	0.2
114	0.17
115	0.1
116	0.09
117	0.1
118	0.1
119	0.11
120	0.11
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.1
126	0.11
127	0.12
128	0.14
129	0.15
130	0.16
131	0.18
132	0.19
133	0.19
134	0.19
135	0.19
136	0.2
137	0.25
138	0.28
139	0.32
140	0.4
141	0.44
142	0.47
143	0.51
144	0.55
145	0.51
146	0.53
147	0.53
148	0.53
149	0.5
150	0.48
151	0.43
152	0.38
153	0.33
154	0.27
155	0.21
156	0.13
157	0.11
158	0.08
159	0.07
160	0.05
161	0.05
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.14
169	0.15
170	0.17
171	0.17
172	0.18
173	0.2
174	0.19
175	0.19
176	0.18
177	0.18
178	0.15
179	0.17
180	0.17
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.14
185	0.14
186	0.13
187	0.11
188	0.09
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.09
193	0.1
194	0.12
195	0.13
196	0.16
197	0.17
198	0.17
199	0.19
200	0.2
201	0.23
202	0.2
203	0.24
204	0.29
205	0.3
206	0.33
207	0.31
208	0.3
209	0.28
210	0.31
211	0.29
212	0.21
213	0.19
214	0.21
215	0.25
216	0.26
217	0.26
218	0.27
219	0.27
220	0.28
221	0.27
222	0.23
223	0.19
224	0.17
225	0.15
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.11
232	0.12
233	0.15
234	0.14
235	0.14
236	0.13
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.11
241	0.08
242	0.12
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.14
247	0.15
248	0.15
249	0.17
250	0.14
251	0.16
252	0.18
253	0.17
254	0.2
255	0.23
256	0.29
257	0.29
258	0.33
259	0.34
260	0.39
261	0.47
262	0.47
263	0.45
264	0.46
265	0.48
266	0.48
267	0.48
268	0.42
269	0.35
270	0.34
271	0.32
272	0.26
273	0.2
274	0.2
275	0.24
276	0.28
277	0.31
278	0.33
279	0.38
280	0.41
281	0.43
282	0.44
283	0.44
284	0.46
285	0.51
286	0.52
287	0.53
288	0.5
289	0.51
290	0.47
291	0.43
292	0.4
293	0.38
294	0.33
295	0.27
296	0.26
297	0.24
298	0.24
299	0.22
300	0.21
301	0.21
302	0.19
303	0.2
304	0.22
305	0.22
306	0.24
307	0.28
308	0.26
309	0.23
310	0.26
311	0.27
312	0.26
313	0.31
314	0.33
315	0.29
316	0.28
317	0.29
318	0.3
319	0.3
320	0.28
321	0.22
322	0.18
323	0.17
324	0.16
325	0.13
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.08
331	0.1
332	0.1
333	0.09
334	0.1
335	0.11
336	0.17
337	0.19
338	0.22
339	0.22
340	0.23
341	0.24
342	0.27
343	0.26
344	0.19
345	0.18
346	0.14
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.11
370	0.16
371	0.2
372	0.21
373	0.24
374	0.26
375	0.26
376	0.25
377	0.22
378	0.25
379	0.23
380	0.26
381	0.25
382	0.24
383	0.23
384	0.27
385	0.25
386	0.21
387	0.19
388	0.15
389	0.13
390	0.14
391	0.15
392	0.12
393	0.12
394	0.09
395	0.08
396	0.09
397	0.08
398	0.06
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.06
405	0.07
406	0.08
407	0.11
408	0.13
409	0.17
410	0.21
411	0.27
412	0.29
413	0.36
414	0.4
415	0.47
416	0.48
417	0.5
418	0.47
419	0.41
420	0.38
421	0.32
422	0.28
423	0.2
424	0.18
425	0.13
426	0.12
427	0.11
428	0.11
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.05
434	0.06
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.08
463	0.08
464	0.1
465	0.11
466	0.16
467	0.2
468	0.2
469	0.21
470	0.23
471	0.3
472	0.29
473	0.28
474	0.27
475	0.31
476	0.31
477	0.32
478	0.28
479	0.25
480	0.23
481	0.23
482	0.2
483	0.12
484	0.11
485	0.1
486	0.09
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.1
495	0.1
496	0.11
497	0.11
498	0.13
499	0.13
500	0.12
501	0.11
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.06
507	0.05
508	0.06
509	0.06
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.09
514	0.11
515	0.13
516	0.19
517	0.24
518	0.27
519	0.35
520	0.38
521	0.38
522	0.39
523	0.46
524	0.49
525	0.47
526	0.49
527	0.43
528	0.44
529	0.44
530	0.44
531	0.37
532	0.31
533	0.32
534	0.31
535	0.32
536	0.27
537	0.27
538	0.23
539	0.22
540	0.2
541	0.18
542	0.15
543	0.13
544	0.15
545	0.14
546	0.14
547	0.14
548	0.13
549	0.11
550	0.11
551	0.09
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.05
558	0.04
559	0.05
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.11
566	0.14
567	0.19
568	0.25
569	0.28
570	0.3
571	0.37
572	0.42
573	0.42
574	0.42
575	0.41
576	0.38
577	0.38
578	0.39
579	0.31
580	0.26
581	0.23
582	0.21
583	0.15
584	0.12
585	0.09
586	0.07
587	0.09
588	0.13
589	0.14
590	0.16
591	0.17
592	0.18
593	0.17
594	0.19
595	0.25
596	0.23
597	0.24
598	0.25
599	0.26
600	0.25
601	0.27
602	0.24
603	0.2
604	0.19
605	0.16
606	0.13
607	0.13
608	0.12
609	0.11
610	0.13
611	0.11
612	0.1
613	0.12
614	0.13
615	0.11
616	0.11
617	0.12
618	0.09
619	0.07
620	0.07
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.09
633	0.09
634	0.1
635	0.14
636	0.16
637	0.17
638	0.2
639	0.19
640	0.16
641	0.16
642	0.15
643	0.11
644	0.09
645	0.1
646	0.15
647	0.2
648	0.25
649	0.32
650	0.34
651	0.34
652	0.4
653	0.46
654	0.47
655	0.48
656	0.52
657	0.5
658	0.52
659	0.59
660	0.54
661	0.47
662	0.4
663	0.34
664	0.26
665	0.21
666	0.17
667	0.11
668	0.12
669	0.12
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.16
674	0.17
675	0.19
676	0.26
677	0.27
678	0.35
679	0.44
680	0.46
681	0.51
682	0.57
683	0.57
684	0.57
685	0.57
686	0.53
687	0.45
688	0.44
689	0.38
690	0.34
691	0.32
692	0.28
693	0.26
694	0.22
695	0.21
696	0.16
697	0.14
698	0.15
699	0.16
700	0.16
701	0.16
702	0.16
703	0.17
704	0.2
705	0.26
706	0.23
707	0.22
708	0.27
709	0.36
710	0.4
711	0.41
712	0.41
713	0.38
714	0.44
715	0.44
716	0.41
717	0.36
718	0.32
719	0.32
720	0.3
721	0.28
722	0.21
723	0.19
724	0.15
725	0.13
726	0.13
727	0.14
728	0.14
729	0.15
730	0.19
731	0.29
732	0.38
733	0.41
734	0.44
735	0.52
736	0.53
737	0.54
738	0.55
739	0.5
740	0.41
741	0.38
742	0.34
743	0.24
744	0.21
745	0.18
746	0.12
747	0.07
748	0.06
749	0.04
750	0.05
751	0.05
752	0.06
753	0.1
754	0.12
755	0.13
756	0.14
757	0.15
758	0.14
759	0.14
760	0.15
761	0.11
762	0.1
763	0.08
764	0.07
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.04
769	0.04
770	0.05
771	0.05
772	0.06
773	0.07
774	0.08
775	0.14
776	0.15
777	0.19
778	0.23
779	0.25
780	0.3
781	0.34
782	0.35
783	0.33
784	0.32
785	0.31
786	0.29
787	0.29
788	0.27
789	0.28
790	0.27
791	0.23
792	0.23
793	0.2
794	0.19
795	0.18
796	0.17
797	0.17
798	0.16
799	0.15
800	0.15
801	0.15
802	0.14
803	0.14
804	0.12
805	0.06
806	0.07
807	0.06
808	0.06
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.08
817	0.08
818	0.14
819	0.14
820	0.16
821	0.17
822	0.2
823	0.2
824	0.2
825	0.22
826	0.19
827	0.21
828	0.18
829	0.18
830	0.17
831	0.17
832	0.17
833	0.15
834	0.16
835	0.16
836	0.18
837	0.16
838	0.14
839	0.15
840	0.14
841	0.15
842	0.12
843	0.11
844	0.1
845	0.1
846	0.11
847	0.1
848	0.09
849	0.09
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.06
854	0.06
855	0.06
856	0.12
857	0.15
858	0.19
859	0.23
860	0.28
861	0.34
862	0.37
863	0.4
864	0.39
865	0.39
866	0.36
867	0.32
868	0.32
869	0.26
870	0.23
871	0.2
872	0.17
873	0.15
874	0.16
875	0.16
876	0.13
877	0.13
878	0.15
879	0.15
880	0.14
881	0.16
882	0.14
883	0.15
884	0.14
885	0.14
886	0.12
887	0.12
888	0.11
889	0.08
890	0.08
891	0.06
892	0.06
893	0.08
894	0.09
895	0.09
896	0.1
897	0.1
898	0.11
899	0.18
900	0.19
901	0.23
902	0.26
903	0.29
904	0.31
905	0.32
906	0.32
907	0.25
908	0.24
909	0.17
910	0.14
911	0.11
912	0.08
913	0.06
914	0.05
915	0.04
916	0.04
917	0.04
918	0.04
919	0.04
920	0.04
921	0.04
922	0.04
923	0.04
924	0.04
925	0.05
926	0.04
927	0.05
928	0.05
929	0.06
930	0.05
931	0.06
932	0.06
933	0.07
934	0.06
935	0.06
936	0.06
937	0.06
938	0.06
939	0.06
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.06
946	0.06
947	0.07
948	0.07
949	0.08
950	0.09
951	0.11
952	0.11
953	0.15
954	0.18
955	0.22
956	0.23
957	0.22
958	0.21
959	0.19
960	0.2
961	0.16
962	0.13
963	0.09
964	0.08
965	0.1
966	0.12
967	0.12
968	0.12
969	0.16
970	0.18
971	0.18
972	0.18
973	0.19
974	0.18
975	0.19
976	0.22
977	0.18
978	0.21
979	0.23
980	0.23
981	0.21
982	0.2
983	0.21
984	0.2
985	0.22
986	0.18
987	0.16
988	0.18
989	0.18
990	0.18
991	0.17
992	0.17
993	0.17
994	0.17
995	0.17
996	0.15
997	0.14
998	0.15
999	0.15
1000	0.15
1001	0.11
1002	0.11
1003	0.12
1004	0.12
1005	0.13
1006	0.14
1007	0.16
1008	0.17
1009	0.18
1010	0.22
1011	0.28
1012	0.32
1013	0.36
1014	0.38
1015	0.38
1016	0.43
1017	0.47
1018	0.45
1019	0.41
1020	0.37
1021	0.34
1022	0.34
1023	0.31
1024	0.25
1025	0.24
1026	0.21
1027	0.2
1028	0.27
1029	0.35
1030	0.41
1031	0.48
1032	0.57
1033	0.64
1034	0.74
1035	0.82
1036	0.8
1037	0.76
1038	0.73
1039	0.74
1040	0.67
1041	0.6
1042	0.49
1043	0.4
1044	0.34
1045	0.28
1046	0.2
1047	0.12
1048	0.1
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.08
1052	0.1
1053	0.11
1054	0.14
1055	0.14
1056	0.13
1057	0.12
1058	0.14
1059	0.19
1060	0.17
1061	0.22
1062	0.28
1063	0.33
1064	0.42
1065	0.52
1066	0.58
1067	0.58
1068	0.67
1069	0.7
1070	0.67
1071	0.63
1072	0.58
1073	0.54
1074	0.47
1075	0.42
1076	0.33
1077	0.24
1078	0.19
1079	0.17
1080	0.14
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.11
1085	0.13
1086	0.15
1087	0.17
1088	0.22
1089	0.25
1090	0.31
1091	0.35
1092	0.39
1093	0.41
1094	0.48
1095	0.53
1096	0.5
1097	0.55
1098	0.54
1099	0.52
1100	0.5
1101	0.51
1102	0.49
1103	0.5
1104	0.55
1105	0.54
1106	0.57
1107	0.57
1108	0.51
1109	0.51
1110	0.48
1111	0.41
1112	0.44
1113	0.42
1114	0.35

S8DUP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer