Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PDB2

Protein Details
Accession A0A1D8PDB2    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-435GINGVRKRYPPRKNMAYKTPPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 3, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011671  tRNA_uracil_MeTrfase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016300  F:tRNA (uracil) methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
GO:0002128  P:tRNA nucleoside ribose methylation  
KEGG cal:CAALFM_C104530CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07757  AdoMet_MTase  
Amino Acid Sequences MEHSDKNFLTANVSKLGPCWVPIYESPVGFNVQHFEAAMLNIIHQPNINSTVIMRADILRENVFDPDEGDTTFTSKIANEIPEFQTDDDSKLLLRDLKDIKVRQIPDVPDIQFTKRHEIVRRVIPRNPFKDYIINQTCLMLTDNKKNSLVVYIPHIDSVEETPYYLPPVYGIGILYNDFKVSVHYLPFGFETPNGKEFTLLKSMTEQDRPIRIALRLLSTATKHSQGRKAGYEKRVNHDLVVPQTNFQNQYITLKKKYSDYFMNNWGESTDPRKHVFEDIAIAAFIIEYWKLNSFEPEKFEFRDLGCGNGLLVHILISEGYKGKGIDARARKSWALYPSEVQNCLLEQIIVPQILLDQQPMPSDVAASIQKQQISTTAEFPKNTFIIGNHSDELSCWVPLLGYPFIVIPCCSFGINGVRKRYPPRKNMAYKTPPSTYKALVDHVEDIALMNGWLVQKEMLRIPSTRNAAIMSCKKIPVLTNEPEHIKRIRLLDIIALEGGADGWVENSINLMKSEPKMH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.3
4 0.23
5 0.21
6 0.21
7 0.18
8 0.22
9 0.22
10 0.29
11 0.28
12 0.27
13 0.27
14 0.26
15 0.28
16 0.24
17 0.24
18 0.2
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.15
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.11
27 0.11
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.22
35 0.21
36 0.16
37 0.16
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.18
42 0.15
43 0.17
44 0.2
45 0.22
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.18
66 0.17
67 0.22
68 0.24
69 0.25
70 0.27
71 0.25
72 0.26
73 0.23
74 0.24
75 0.2
76 0.18
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.21
83 0.24
84 0.29
85 0.36
86 0.38
87 0.42
88 0.45
89 0.46
90 0.43
91 0.46
92 0.43
93 0.39
94 0.43
95 0.37
96 0.35
97 0.36
98 0.34
99 0.33
100 0.33
101 0.38
102 0.37
103 0.42
104 0.44
105 0.48
106 0.53
107 0.58
108 0.64
109 0.61
110 0.61
111 0.65
112 0.67
113 0.65
114 0.65
115 0.57
116 0.5
117 0.54
118 0.51
119 0.53
120 0.48
121 0.45
122 0.39
123 0.37
124 0.34
125 0.27
126 0.26
127 0.21
128 0.2
129 0.27
130 0.31
131 0.33
132 0.33
133 0.33
134 0.31
135 0.28
136 0.26
137 0.18
138 0.19
139 0.2
140 0.19
141 0.19
142 0.19
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.13
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.11
177 0.11
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.21
186 0.22
187 0.2
188 0.17
189 0.18
190 0.21
191 0.22
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.18
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.17
208 0.16
209 0.19
210 0.19
211 0.23
212 0.29
213 0.31
214 0.34
215 0.37
216 0.43
217 0.46
218 0.51
219 0.55
220 0.53
221 0.54
222 0.56
223 0.51
224 0.44
225 0.39
226 0.33
227 0.28
228 0.3
229 0.24
230 0.19
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.15
236 0.11
237 0.16
238 0.21
239 0.24
240 0.25
241 0.25
242 0.26
243 0.29
244 0.3
245 0.29
246 0.31
247 0.31
248 0.32
249 0.38
250 0.39
251 0.35
252 0.33
253 0.29
254 0.23
255 0.19
256 0.21
257 0.18
258 0.19
259 0.21
260 0.22
261 0.23
262 0.24
263 0.23
264 0.18
265 0.16
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.12
281 0.15
282 0.17
283 0.21
284 0.24
285 0.24
286 0.24
287 0.25
288 0.23
289 0.2
290 0.26
291 0.22
292 0.2
293 0.18
294 0.17
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.06
299 0.06
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.11
312 0.12
313 0.2
314 0.26
315 0.3
316 0.32
317 0.35
318 0.34
319 0.33
320 0.37
321 0.34
322 0.31
323 0.28
324 0.28
325 0.32
326 0.34
327 0.33
328 0.28
329 0.24
330 0.19
331 0.18
332 0.16
333 0.1
334 0.07
335 0.08
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.15
356 0.17
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.2
361 0.23
362 0.23
363 0.25
364 0.3
365 0.32
366 0.33
367 0.33
368 0.33
369 0.28
370 0.27
371 0.22
372 0.15
373 0.19
374 0.22
375 0.25
376 0.21
377 0.21
378 0.21
379 0.2
380 0.24
381 0.18
382 0.14
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.15
388 0.1
389 0.09
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.08
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.13
401 0.21
402 0.29
403 0.34
404 0.39
405 0.41
406 0.45
407 0.56
408 0.63
409 0.63
410 0.64
411 0.68
412 0.72
413 0.79
414 0.82
415 0.83
416 0.83
417 0.8
418 0.77
419 0.74
420 0.67
421 0.61
422 0.57
423 0.49
424 0.45
425 0.41
426 0.38
427 0.34
428 0.33
429 0.3
430 0.26
431 0.23
432 0.17
433 0.15
434 0.11
435 0.09
436 0.07
437 0.05
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.1
444 0.13
445 0.17
446 0.19
447 0.21
448 0.22
449 0.27
450 0.34
451 0.37
452 0.35
453 0.32
454 0.3
455 0.3
456 0.37
457 0.39
458 0.37
459 0.36
460 0.36
461 0.36
462 0.37
463 0.38
464 0.38
465 0.39
466 0.4
467 0.42
468 0.46
469 0.52
470 0.51
471 0.52
472 0.46
473 0.41
474 0.39
475 0.37
476 0.37
477 0.33
478 0.32
479 0.32
480 0.3
481 0.28
482 0.23
483 0.19
484 0.14
485 0.12
486 0.11
487 0.06
488 0.05
489 0.03
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.07
495 0.09
496 0.11
497 0.11
498 0.13
499 0.17