FuNGI

F4RKK1

Protein Details

Accession

F4RKK1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
458-483	DDELVPQRSKKDKKKKPLIEEIDSKE	Basic
502-523	ELPASEAKSKKRKNESEDVEMT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
465-474	RSKKDKKKKP
489-514	AKKAAKKAKSSNEELPASEAKSKKRK
533-537	KKSKK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14.333, cyto 13.5, nucl 11, cyto_mito 8.332

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045056 Nop56/Nop58 IPR012974 NOP58/56_N IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0017069 F:snRNA binding GO:0000494 P:box C/D RNA 3'-end processing GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:1902570 P:protein localization to nucleolus GO:0000452 P:snoRNA guided rRNA 2'-O-methylation
KEGG	mlr:MELLADRAFT_25214 -
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF08156 NOP5NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

LVLFESSLGFCLFKVADDGKLLSDDKLYKKFETPASASNLVKLQSIHRFKSTADAVEDMSAIGEGKISKNLKKFLTDEISQSKNSQETLAVVDPKLGGAITKKLGFNVISDSTTTDLFRGIRSQLAGLLGEYNVEESDLNTMNLGLSHSLSRFKLKYSTDKVDTMIVQAIALLDDLDKEVNIYAMRVKEWYGWHFPEMAKIITDNLAYAKIVKVMGVRTDHDKTDFSEILPEELEGTLKAAAAISMGTEISDTDLLHIQSLASQVISLMQYRTELFEYLRNRMTAIAPNLTAILGELVGARLIAHSGSLINLAKAPASTIQILGAEKALFRALKTKHDTPKYGLIFHSSLVGSAPGKLKGKMARMTAAKAALSIRHDALADSDTKSTEDAALIGIEARIKLESRLRRLEQSIGIQSVRKSSQSYQQLPALRMPNAGSYNPAADDIMIPAANNDTTKDDDELVPQRSKKDKKKKPLIEEIDSKEEIADEAKKAAKKAKSSNEELPASEAKSKKRKNESEDVEMTITDEVPKSEKKSKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.18
4	0.2
5	0.21
6	0.19
7	0.22
8	0.23
9	0.18
10	0.22
11	0.25
12	0.3
13	0.36
14	0.39
15	0.39
16	0.42
17	0.48
18	0.48
19	0.5
20	0.48
21	0.46
22	0.5
23	0.52
24	0.48
25	0.45
26	0.42
27	0.35
28	0.32
29	0.28
30	0.26
31	0.31
32	0.38
33	0.39
34	0.39
35	0.4
36	0.38
37	0.45
38	0.43
39	0.37
40	0.33
41	0.3
42	0.28
43	0.27
44	0.27
45	0.18
46	0.15
47	0.1
48	0.08
49	0.06
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.16
54	0.2
55	0.25
56	0.31
57	0.37
58	0.38
59	0.42
60	0.43
61	0.44
62	0.47
63	0.44
64	0.44
65	0.44
66	0.45
67	0.41
68	0.4
69	0.35
70	0.3
71	0.29
72	0.24
73	0.18
74	0.16
75	0.2
76	0.23
77	0.22
78	0.2
79	0.2
80	0.19
81	0.18
82	0.17
83	0.12
84	0.09
85	0.09
86	0.13
87	0.15
88	0.19
89	0.2
90	0.2
91	0.23
92	0.22
93	0.21
94	0.22
95	0.21
96	0.18
97	0.18
98	0.18
99	0.17
100	0.17
101	0.16
102	0.11
103	0.12
104	0.11
105	0.12
106	0.14
107	0.13
108	0.15
109	0.15
110	0.15
111	0.14
112	0.15
113	0.14
114	0.11
115	0.11
116	0.09
117	0.09
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.05
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.09
131	0.09
132	0.06
133	0.06
134	0.08
135	0.09
136	0.12
137	0.13
138	0.19
139	0.19
140	0.2
141	0.26
142	0.28
143	0.37
144	0.41
145	0.47
146	0.46
147	0.46
148	0.45
149	0.42
150	0.38
151	0.3
152	0.24
153	0.16
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.07
158	0.07
159	0.05
160	0.03
161	0.03
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.11
175	0.14
176	0.16
177	0.2
178	0.23
179	0.23
180	0.24
181	0.26
182	0.25
183	0.25
184	0.25
185	0.21
186	0.15
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.13
191	0.09
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.12
203	0.14
204	0.15
205	0.18
206	0.2
207	0.2
208	0.2
209	0.2
210	0.19
211	0.23
212	0.22
213	0.17
214	0.19
215	0.18
216	0.17
217	0.17
218	0.15
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.05
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.13
264	0.15
265	0.18
266	0.2
267	0.18
268	0.18
269	0.18
270	0.19
271	0.18
272	0.18
273	0.16
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.11
279	0.07
280	0.05
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.14
319	0.15
320	0.23
321	0.3
322	0.37
323	0.44
324	0.49
325	0.52
326	0.48
327	0.56
328	0.5
329	0.45
330	0.38
331	0.34
332	0.29
333	0.27
334	0.25
335	0.16
336	0.14
337	0.12
338	0.13
339	0.09
340	0.11
341	0.13
342	0.14
343	0.16
344	0.16
345	0.2
346	0.24
347	0.3
348	0.32
349	0.32
350	0.34
351	0.34
352	0.36
353	0.34
354	0.31
355	0.25
356	0.21
357	0.2
358	0.16
359	0.16
360	0.16
361	0.14
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.14
366	0.12
367	0.12
368	0.11
369	0.12
370	0.11
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.1
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.1
388	0.17
389	0.24
390	0.3
391	0.38
392	0.4
393	0.45
394	0.47
395	0.48
396	0.45
397	0.43
398	0.4
399	0.35
400	0.33
401	0.3
402	0.29
403	0.29
404	0.27
405	0.23
406	0.23
407	0.23
408	0.31
409	0.39
410	0.43
411	0.42
412	0.46
413	0.49
414	0.47
415	0.51
416	0.46
417	0.37
418	0.33
419	0.3
420	0.3
421	0.28
422	0.26
423	0.23
424	0.2
425	0.2
426	0.19
427	0.19
428	0.13
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.14
442	0.16
443	0.18
444	0.18
445	0.18
446	0.24
447	0.28
448	0.31
449	0.34
450	0.34
451	0.39
452	0.47
453	0.56
454	0.62
455	0.67
456	0.72
457	0.78
458	0.87
459	0.91
460	0.91
461	0.92
462	0.89
463	0.86
464	0.85
465	0.8
466	0.75
467	0.65
468	0.55
469	0.44
470	0.35
471	0.28
472	0.22
473	0.19
474	0.13
475	0.16
476	0.22
477	0.24
478	0.27
479	0.34
480	0.37
481	0.43
482	0.52
483	0.58
484	0.61
485	0.66
486	0.71
487	0.72
488	0.68
489	0.6
490	0.55
491	0.48
492	0.43
493	0.43
494	0.39
495	0.4
496	0.48
497	0.55
498	0.6
499	0.68
500	0.75
501	0.76
502	0.83
503	0.81
504	0.8
505	0.76
506	0.7
507	0.6
508	0.5
509	0.43
510	0.33
511	0.25
512	0.18
513	0.15
514	0.12
515	0.15
516	0.2
517	0.26

F4RKK1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer