FuNGI

S8DRR7

Protein Details

Accession

S8DRR7

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MDLLFHPKKKQVKVAPKPKPKEASP	Hydrophilic
94-116	DIATWRPPVKLNRKEPRREADDG	Hydrophilic
162-187	GGDKGKDRAGQKKRFQKKTRQVFLVP	Hydrophilic
239-258	VPAHRWYKFQKKPKYHVPTL	Hydrophilic
580-614	NSSAKSSDKKRKASDDPNAKPKKRKPLPSLPQGAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-28	PKKKQVKVAPKPKPKEASPQKE
160-179	SAGGDKGKDRAGQKKRFQKK
587-605	DKKRKASDDPNAKPKKRKP

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MDLLFHPKKKQVKVAPKPKPKEASPQKEGAPNGTPSLTKATAARPRPPPKSQDNDDDLRFPPPEGDFQEFKLVSSQLNGWKYDVMKFDSRKAVDIATWRPPVKLNRKEPRREADDGAVDEGPTPVGPMLGPDGKPVVGPDGRIVMVDAEGRPIRPGEGGSAGGDKGKDRAGQKKRFQKKTRQVFLVPDEVRKLRREERYPWVMEDSAGDEVWVGKMEEVSKSETHCMLMPADNFTFKLVPAHRWYKFQKKPKYHVPTLEEAEKMMSNIKKNQDPERWLLRKRNGQGPSAETAALFKAERSGSTGPIPSASLGPGGRRLKTVDNGMNGLFGDDEDEDEDGEGRKRRTKRELGAEGDVDEMDFEEQFADDEEKMEPDDRDDEEAKELEERLKKEYKNANKTREGYVDESEDEDEPTLTRAGKGLRKTLQKLEKDGGYDESDDDENPYASEVEEEEEEPIPVYTGPAIIAPEPKPGRQPSQTNGTKTPTSSQSPTQAKAEPSDSRPTSPVIPNHGGHSALAKRAMSPKMPKLDGNGMSRATSPLAGSSAISLNGSRAVSPAHGGSRAGSPTSPTSPTPANGVNSSAKSSDKKRKASDDPNAKPKKRKPLPSLPQGAALDDRTVIEWLRQTPNATTRDCIHHFQPYLTDDEKKHRFTTLVKEVAQLKDGVLVLRPAYQSVGAPSPSQTNTSTAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.86
3	0.89
4	0.89
5	0.89
6	0.86
7	0.79
8	0.79
9	0.79
10	0.79
11	0.74
12	0.73
13	0.67
14	0.66
15	0.63
16	0.57
17	0.51
18	0.43
19	0.39
20	0.35
21	0.31
22	0.26
23	0.32
24	0.27
25	0.23
26	0.24
27	0.3
28	0.37
29	0.43
30	0.49
31	0.53
32	0.62
33	0.68
34	0.73
35	0.72
36	0.72
37	0.76
38	0.74
39	0.73
40	0.71
41	0.69
42	0.64
43	0.6
44	0.52
45	0.46
46	0.41
47	0.31
48	0.28
49	0.23
50	0.27
51	0.27
52	0.32
53	0.29
54	0.31
55	0.39
56	0.36
57	0.34
58	0.32
59	0.29
60	0.23
61	0.24
62	0.26
63	0.25
64	0.28
65	0.29
66	0.26
67	0.29
68	0.3
69	0.32
70	0.31
71	0.29
72	0.34
73	0.36
74	0.41
75	0.46
76	0.46
77	0.43
78	0.41
79	0.37
80	0.32
81	0.35
82	0.34
83	0.34
84	0.39
85	0.37
86	0.37
87	0.42
88	0.49
89	0.53
90	0.58
91	0.61
92	0.66
93	0.75
94	0.83
95	0.86
96	0.85
97	0.81
98	0.75
99	0.69
100	0.64
101	0.59
102	0.51
103	0.46
104	0.37
105	0.3
106	0.25
107	0.21
108	0.15
109	0.09
110	0.08
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.06
115	0.1
116	0.14
117	0.14
118	0.15
119	0.16
120	0.16
121	0.16
122	0.16
123	0.17
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.16
128	0.16
129	0.16
130	0.16
131	0.1
132	0.1
133	0.12
134	0.1
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.14
140	0.14
141	0.13
142	0.13
143	0.11
144	0.13
145	0.13
146	0.13
147	0.14
148	0.13
149	0.14
150	0.14
151	0.12
152	0.11
153	0.13
154	0.17
155	0.2
156	0.3
157	0.39
158	0.49
159	0.57
160	0.66
161	0.74
162	0.81
163	0.84
164	0.86
165	0.86
166	0.87
167	0.87
168	0.83
169	0.75
170	0.71
171	0.67
172	0.65
173	0.56
174	0.47
175	0.42
176	0.39
177	0.38
178	0.35
179	0.36
180	0.35
181	0.42
182	0.46
183	0.48
184	0.54
185	0.59
186	0.58
187	0.55
188	0.5
189	0.41
190	0.35
191	0.3
192	0.23
193	0.16
194	0.14
195	0.12
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.06
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.09
205	0.1
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.17
210	0.17
211	0.17
212	0.16
213	0.16
214	0.14
215	0.16
216	0.15
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.15
221	0.16
222	0.14
223	0.11
224	0.16
225	0.14
226	0.18
227	0.24
228	0.32
229	0.32
230	0.39
231	0.45
232	0.5
233	0.58
234	0.63
235	0.67
236	0.69
237	0.75
238	0.79
239	0.82
240	0.76
241	0.75
242	0.7
243	0.66
244	0.6
245	0.55
246	0.44
247	0.35
248	0.31
249	0.23
250	0.18
251	0.17
252	0.16
253	0.16
254	0.21
255	0.26
256	0.29
257	0.32
258	0.4
259	0.42
260	0.43
261	0.46
262	0.51
263	0.53
264	0.54
265	0.58
266	0.58
267	0.59
268	0.59
269	0.62
270	0.54
271	0.51
272	0.48
273	0.43
274	0.38
275	0.32
276	0.27
277	0.19
278	0.16
279	0.14
280	0.12
281	0.09
282	0.06
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.13
287	0.14
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.14
292	0.14
293	0.14
294	0.1
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.16
301	0.17
302	0.17
303	0.18
304	0.2
305	0.21
306	0.23
307	0.28
308	0.24
309	0.23
310	0.24
311	0.23
312	0.21
313	0.18
314	0.15
315	0.1
316	0.06
317	0.06
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.07
327	0.1
328	0.11
329	0.18
330	0.22
331	0.28
332	0.36
333	0.43
334	0.47
335	0.54
336	0.59
337	0.56
338	0.54
339	0.49
340	0.41
341	0.33
342	0.27
343	0.17
344	0.1
345	0.06
346	0.04
347	0.04
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.1
363	0.1
364	0.13
365	0.14
366	0.14
367	0.14
368	0.15
369	0.14
370	0.12
371	0.12
372	0.14
373	0.17
374	0.17
375	0.2
376	0.26
377	0.26
378	0.34
379	0.42
380	0.47
381	0.54
382	0.61
383	0.63
384	0.64
385	0.67
386	0.62
387	0.57
388	0.5
389	0.42
390	0.36
391	0.3
392	0.23
393	0.22
394	0.19
395	0.16
396	0.13
397	0.1
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.13
406	0.17
407	0.19
408	0.25
409	0.3
410	0.36
411	0.4
412	0.46
413	0.5
414	0.49
415	0.5
416	0.47
417	0.43
418	0.38
419	0.36
420	0.3
421	0.23
422	0.2
423	0.17
424	0.15
425	0.14
426	0.12
427	0.13
428	0.1
429	0.09
430	0.08
431	0.09
432	0.07
433	0.06
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.11
454	0.11
455	0.19
456	0.2
457	0.21
458	0.26
459	0.29
460	0.34
461	0.37
462	0.42
463	0.38
464	0.47
465	0.52
466	0.5
467	0.51
468	0.49
469	0.44
470	0.4
471	0.4
472	0.35
473	0.34
474	0.33
475	0.32
476	0.37
477	0.4
478	0.41
479	0.4
480	0.38
481	0.35
482	0.35
483	0.36
484	0.31
485	0.31
486	0.37
487	0.35
488	0.33
489	0.33
490	0.33
491	0.33
492	0.34
493	0.34
494	0.33
495	0.37
496	0.35
497	0.36
498	0.36
499	0.31
500	0.26
501	0.27
502	0.22
503	0.19
504	0.21
505	0.18
506	0.19
507	0.25
508	0.28
509	0.28
510	0.33
511	0.38
512	0.43
513	0.45
514	0.44
515	0.43
516	0.48
517	0.48
518	0.46
519	0.42
520	0.35
521	0.34
522	0.34
523	0.3
524	0.22
525	0.17
526	0.13
527	0.11
528	0.11
529	0.1
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.09
537	0.12
538	0.12
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.11
543	0.12
544	0.14
545	0.13
546	0.13
547	0.14
548	0.15
549	0.17
550	0.18
551	0.18
552	0.16
553	0.17
554	0.2
555	0.23
556	0.24
557	0.21
558	0.24
559	0.25
560	0.26
561	0.27
562	0.27
563	0.27
564	0.25
565	0.28
566	0.29
567	0.28
568	0.29
569	0.26
570	0.26
571	0.28
572	0.36
573	0.43
574	0.48
575	0.55
576	0.6
577	0.68
578	0.74
579	0.79
580	0.81
581	0.81
582	0.81
583	0.83
584	0.86
585	0.83
586	0.84
587	0.81
588	0.82
589	0.81
590	0.82
591	0.81
592	0.82
593	0.86
594	0.86
595	0.86
596	0.76
597	0.74
598	0.64
599	0.56
600	0.47
601	0.38
602	0.29
603	0.21
604	0.2
605	0.13
606	0.14
607	0.13
608	0.13
609	0.16
610	0.2
611	0.25
612	0.27
613	0.28
614	0.32
615	0.4
616	0.42
617	0.4
618	0.38
619	0.37
620	0.43
621	0.45
622	0.44
623	0.4
624	0.43
625	0.43
626	0.41
627	0.42
628	0.35
629	0.37
630	0.36
631	0.38
632	0.33
633	0.42
634	0.48
635	0.47
636	0.47
637	0.43
638	0.44
639	0.43
640	0.51
641	0.51
642	0.5
643	0.47
644	0.5
645	0.53
646	0.51
647	0.48
648	0.38
649	0.28
650	0.25
651	0.25
652	0.21
653	0.17
654	0.17
655	0.16
656	0.2
657	0.2
658	0.17
659	0.18
660	0.18
661	0.17
662	0.2
663	0.24
664	0.2
665	0.21
666	0.22
667	0.26
668	0.27
669	0.29
670	0.26

S8DRR7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer