Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8F4U1

Protein Details
Accession S8F4U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-160YSMKTEYSKEKYKKRKEAKFSKSFCVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-150KKRK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 12.833, nucl 8.5, mito_nucl 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MTMNTGEGPSQASKNTREDTIQLGNTLLLKLPSGDIKTWKLEKDSTANLGKFGSFYANELVGQPFGLTYEIADKKLKAVPPRTLQEVEDTEATNELINDGEFVQPLTAEEIETLKKSGVHASEIIKRQIEQHANYSMKTEYSKEKYKKRKEAKFSKSFCVIDPTVFNVCEYWFNKDQSRLRDIRPDALGQMLNLANIRPGGRYLAVDDASGIVVAGILERLGGNGRLITICDVDSPPAYPAMVHMNFKKEVIQALSSLNWATADEEYTPIVPPVEASTSKARSDAQKARLNKRKAVNDTLTSTREELFAGEFDGLVVASQFDPFSILQKLLPYLAGSANIVVHSPYVQIVTDLQNQLRELPQYLGPAVTEMWLRRYQVLPGRTHPMMNMSGSGGFILHTIRIYDDPTAQSIVAHRQKKKAKLDADTAGSSRQDSVMSETSTPGKVDVIVSSSSSPGVAQPDSSADAVTRTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.37
4 0.36
5 0.37
6 0.38
7 0.41
8 0.38
9 0.31
10 0.29
11 0.27
12 0.26
13 0.24
14 0.19
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.16
20 0.18
21 0.2
22 0.24
23 0.28
24 0.35
25 0.39
26 0.41
27 0.4
28 0.4
29 0.42
30 0.44
31 0.44
32 0.43
33 0.46
34 0.44
35 0.4
36 0.38
37 0.33
38 0.27
39 0.23
40 0.2
41 0.13
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.13
49 0.13
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.15
57 0.17
58 0.19
59 0.21
60 0.21
61 0.24
62 0.29
63 0.33
64 0.33
65 0.38
66 0.44
67 0.5
68 0.54
69 0.57
70 0.53
71 0.5
72 0.48
73 0.43
74 0.37
75 0.31
76 0.27
77 0.22
78 0.2
79 0.2
80 0.14
81 0.11
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.19
108 0.23
109 0.3
110 0.33
111 0.35
112 0.31
113 0.29
114 0.3
115 0.35
116 0.37
117 0.32
118 0.32
119 0.38
120 0.38
121 0.38
122 0.37
123 0.29
124 0.24
125 0.24
126 0.22
127 0.22
128 0.27
129 0.37
130 0.43
131 0.52
132 0.62
133 0.71
134 0.79
135 0.81
136 0.85
137 0.86
138 0.89
139 0.9
140 0.89
141 0.83
142 0.78
143 0.74
144 0.65
145 0.55
146 0.51
147 0.41
148 0.32
149 0.28
150 0.26
151 0.21
152 0.21
153 0.2
154 0.13
155 0.13
156 0.18
157 0.18
158 0.21
159 0.23
160 0.26
161 0.28
162 0.36
163 0.4
164 0.39
165 0.45
166 0.42
167 0.4
168 0.46
169 0.45
170 0.42
171 0.39
172 0.35
173 0.28
174 0.27
175 0.25
176 0.16
177 0.17
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.06
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.19
233 0.19
234 0.2
235 0.21
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.09
262 0.08
263 0.11
264 0.17
265 0.19
266 0.19
267 0.2
268 0.21
269 0.22
270 0.3
271 0.35
272 0.38
273 0.43
274 0.49
275 0.58
276 0.65
277 0.66
278 0.64
279 0.64
280 0.64
281 0.63
282 0.64
283 0.58
284 0.53
285 0.53
286 0.5
287 0.44
288 0.36
289 0.32
290 0.25
291 0.2
292 0.17
293 0.13
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.06
310 0.06
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.11
318 0.12
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.09
337 0.12
338 0.18
339 0.2
340 0.2
341 0.21
342 0.22
343 0.23
344 0.23
345 0.2
346 0.16
347 0.16
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.16
352 0.14
353 0.14
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.14
359 0.17
360 0.18
361 0.2
362 0.21
363 0.25
364 0.31
365 0.36
366 0.36
367 0.37
368 0.43
369 0.41
370 0.4
371 0.35
372 0.32
373 0.28
374 0.25
375 0.22
376 0.16
377 0.16
378 0.15
379 0.14
380 0.1
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.1
389 0.12
390 0.13
391 0.16
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.17
396 0.17
397 0.18
398 0.26
399 0.31
400 0.38
401 0.41
402 0.49
403 0.58
404 0.66
405 0.73
406 0.72
407 0.72
408 0.71
409 0.73
410 0.71
411 0.68
412 0.61
413 0.53
414 0.46
415 0.39
416 0.33
417 0.26
418 0.2
419 0.16
420 0.14
421 0.19
422 0.22
423 0.23
424 0.23
425 0.24
426 0.26
427 0.27
428 0.26
429 0.21
430 0.16
431 0.15
432 0.15
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.12
443 0.15
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.17
448 0.2
449 0.2
450 0.18
451 0.14