Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8EF65

Protein Details
Accession S8EF65    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-87EDNPVLSHKDQRRQKKKELKQKAAAAAAHydrophilic
430-454GTRDAAGRDKKPPRARPKPGAALALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-85RRQKKKELKQKAAAA
354-399RGGNIPRSKGEGKRDGAPGANRRERQPRTERTHANGEAPRADRKRK
434-451AAGRDKKPPRARPKPGAA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSSSSSSSSVSSSNSEGPVSRKDPRAALNEGSEDESDSSASSSTTDGVTDSASEQEEDEDNPVLSHKDQRRQKKKELKQKAAAAAATLSEKQKGKQPVKNSAELAPSKLPRRQHSVWVGNLAFKTTPDALRRFFDGVGEITRIHMPMKMASGGPGGGAARKESRGFAYVDFATPDAKTVAITLSENPLDGRRLLIKDGDDFNGRPAPAADTDPGASGKPCLSGHTKTAQKILRAQKHPAGPTLFLGNLGFETTDQSVRQLFDSHRAKPPAKPQSGADSGAEEIADAETDAKPKPWIRKVRMGTFEDSGKCKGWAFVDFANAEYATDALVNPKNHFLDGRKLVIEYASPDAVRRGGNIPRSKGEGKRDGAPGANRRERQPRTERTHANGEAPRADRKRKILPEDADVEQMADHDGEDASRKKQRTEDWHGTRDAAGRDKKPPRARPKPGAALALAKRETAAIVPAQGRKIVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.23
4 0.24
5 0.26
6 0.31
7 0.34
8 0.37
9 0.4
10 0.43
11 0.46
12 0.51
13 0.53
14 0.51
15 0.49
16 0.46
17 0.42
18 0.4
19 0.37
20 0.31
21 0.26
22 0.22
23 0.19
24 0.15
25 0.13
26 0.12
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.22
54 0.28
55 0.36
56 0.45
57 0.56
58 0.66
59 0.73
60 0.82
61 0.84
62 0.87
63 0.88
64 0.91
65 0.9
66 0.88
67 0.87
68 0.82
69 0.75
70 0.65
71 0.55
72 0.44
73 0.35
74 0.28
75 0.22
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.27
81 0.36
82 0.42
83 0.46
84 0.53
85 0.59
86 0.63
87 0.67
88 0.62
89 0.56
90 0.54
91 0.49
92 0.45
93 0.41
94 0.4
95 0.39
96 0.41
97 0.43
98 0.41
99 0.49
100 0.48
101 0.5
102 0.55
103 0.57
104 0.55
105 0.56
106 0.51
107 0.46
108 0.43
109 0.35
110 0.26
111 0.19
112 0.21
113 0.16
114 0.2
115 0.22
116 0.26
117 0.27
118 0.28
119 0.31
120 0.29
121 0.27
122 0.23
123 0.19
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.14
184 0.16
185 0.18
186 0.19
187 0.17
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.18
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.14
197 0.12
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.19
212 0.25
213 0.28
214 0.27
215 0.33
216 0.33
217 0.31
218 0.37
219 0.44
220 0.45
221 0.45
222 0.47
223 0.45
224 0.47
225 0.47
226 0.42
227 0.35
228 0.27
229 0.24
230 0.22
231 0.17
232 0.13
233 0.12
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.2
250 0.24
251 0.26
252 0.31
253 0.36
254 0.37
255 0.39
256 0.48
257 0.48
258 0.47
259 0.45
260 0.4
261 0.43
262 0.44
263 0.41
264 0.31
265 0.22
266 0.2
267 0.18
268 0.17
269 0.09
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.11
280 0.15
281 0.23
282 0.31
283 0.4
284 0.45
285 0.55
286 0.6
287 0.65
288 0.69
289 0.64
290 0.58
291 0.51
292 0.49
293 0.41
294 0.38
295 0.32
296 0.25
297 0.22
298 0.2
299 0.2
300 0.17
301 0.17
302 0.18
303 0.17
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.17
309 0.14
310 0.11
311 0.1
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.08
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.24
323 0.23
324 0.27
325 0.3
326 0.31
327 0.28
328 0.27
329 0.27
330 0.25
331 0.23
332 0.16
333 0.15
334 0.13
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.16
342 0.2
343 0.29
344 0.34
345 0.37
346 0.37
347 0.43
348 0.46
349 0.47
350 0.5
351 0.51
352 0.47
353 0.5
354 0.5
355 0.46
356 0.46
357 0.47
358 0.46
359 0.48
360 0.53
361 0.49
362 0.52
363 0.61
364 0.61
365 0.63
366 0.65
367 0.66
368 0.67
369 0.74
370 0.75
371 0.7
372 0.75
373 0.68
374 0.65
375 0.58
376 0.52
377 0.49
378 0.45
379 0.48
380 0.45
381 0.5
382 0.49
383 0.52
384 0.59
385 0.61
386 0.66
387 0.67
388 0.64
389 0.64
390 0.62
391 0.57
392 0.49
393 0.41
394 0.33
395 0.23
396 0.2
397 0.14
398 0.09
399 0.08
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.12
404 0.15
405 0.2
406 0.27
407 0.28
408 0.32
409 0.38
410 0.47
411 0.52
412 0.6
413 0.65
414 0.67
415 0.71
416 0.68
417 0.63
418 0.57
419 0.52
420 0.46
421 0.44
422 0.43
423 0.41
424 0.5
425 0.57
426 0.64
427 0.69
428 0.75
429 0.78
430 0.81
431 0.87
432 0.87
433 0.89
434 0.89
435 0.84
436 0.77
437 0.68
438 0.66
439 0.6
440 0.58
441 0.48
442 0.38
443 0.33
444 0.29
445 0.28
446 0.2
447 0.19
448 0.12
449 0.17
450 0.21
451 0.25
452 0.26