Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8FVS2

Protein Details
Accession S8FVS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-40PSSSPNSKARAREKEKRQKGDPKSQTERLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-32KARAREKEKRQKGDPK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSAATESLRPSSSPNSKARAREKEKRQKGDPKSQTERLKTVVRRLPPNLPENIFWQSVQQWVTGDTVQWKAFYQGKFRTRINKENIPSRAYIAFRNEEQLAIFSRDYDGHVFRDKAGNESIAIVEFAPFQKIPVEKKKPDSKIGTIEIEEDFQSFLKSLEEGASKPVEVDSLETLIAASQPPPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.48
3 0.53
4 0.61
5 0.67
6 0.69
7 0.7
8 0.73
9 0.78
10 0.83
11 0.87
12 0.87
13 0.86
14 0.86
15 0.86
16 0.87
17 0.84
18 0.83
19 0.81
20 0.81
21 0.8
22 0.75
23 0.69
24 0.63
25 0.62
26 0.56
27 0.57
28 0.54
29 0.52
30 0.53
31 0.54
32 0.57
33 0.55
34 0.56
35 0.51
36 0.47
37 0.42
38 0.4
39 0.39
40 0.32
41 0.26
42 0.23
43 0.19
44 0.2
45 0.19
46 0.16
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.14
54 0.13
55 0.14
56 0.13
57 0.14
58 0.19
59 0.2
60 0.24
61 0.29
62 0.34
63 0.37
64 0.4
65 0.46
66 0.47
67 0.54
68 0.55
69 0.54
70 0.52
71 0.56
72 0.56
73 0.48
74 0.43
75 0.36
76 0.32
77 0.26
78 0.25
79 0.2
80 0.19
81 0.17
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.11
118 0.14
119 0.21
120 0.31
121 0.39
122 0.42
123 0.51
124 0.61
125 0.62
126 0.67
127 0.67
128 0.61
129 0.59
130 0.59
131 0.53
132 0.44
133 0.4
134 0.32
135 0.27
136 0.22
137 0.16
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.13
148 0.12
149 0.16
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.09