Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RXW5

Protein Details
Accession F4RXW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-78ADDEPSGGPRRKKRRGDSEQVTTNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-69PRRKKRRG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038729  Rad50/SbcC_AAA  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
KEGG mlr:MELLADRAFT_49722  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13476  AAA_23  
Amino Acid Sequences MAKRTLRIMDPDDESPTPNRSGEASTRGTNGRHENRHHSDEEDEEAELSAEDDADDEPSGGPRRKKRRGDSEQVTTNGRGNKGKSRASTQRADTVGLSDDVGSDEDGQLETVEEASYAVRHPDGFLPGSIVRLSATNFMTYTEVEFHFGSHLNMIIGPNGTGKSAFMCALALGLGYSPATVLQRVNEVKLYVKNGTNEGSVEIELKGKPGEENIVIKLHLNVETSSRVFEINGKRSTHTKVQEIIRSFNIQVDNLCCFIPQERLREFAAMDPIHTLKATEKCAGHSGLVPWHDVLIEKGRKKISEEAQLERLQEDKQHHDKRLQNMKRDVEILLERQAHQARVSHAVVRSGVMSPIDFFHLSRSKFSSMLYVNANTEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.33
4 0.3
5 0.26
6 0.25
7 0.22
8 0.26
9 0.28
10 0.32
11 0.33
12 0.32
13 0.35
14 0.38
15 0.37
16 0.38
17 0.44
18 0.46
19 0.5
20 0.54
21 0.61
22 0.65
23 0.7
24 0.65
25 0.57
26 0.51
27 0.45
28 0.43
29 0.34
30 0.27
31 0.21
32 0.19
33 0.17
34 0.14
35 0.11
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.11
46 0.17
47 0.22
48 0.3
49 0.38
50 0.49
51 0.59
52 0.69
53 0.75
54 0.8
55 0.85
56 0.88
57 0.87
58 0.85
59 0.82
60 0.74
61 0.68
62 0.58
63 0.52
64 0.46
65 0.41
66 0.36
67 0.32
68 0.38
69 0.42
70 0.46
71 0.45
72 0.5
73 0.56
74 0.58
75 0.61
76 0.55
77 0.55
78 0.51
79 0.49
80 0.4
81 0.33
82 0.28
83 0.21
84 0.18
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.09
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.15
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.02
165 0.03
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.15
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.16
217 0.22
218 0.27
219 0.31
220 0.32
221 0.33
222 0.36
223 0.41
224 0.42
225 0.38
226 0.35
227 0.36
228 0.4
229 0.45
230 0.44
231 0.42
232 0.37
233 0.35
234 0.31
235 0.29
236 0.25
237 0.19
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.15
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.19
247 0.21
248 0.26
249 0.26
250 0.29
251 0.3
252 0.31
253 0.3
254 0.23
255 0.27
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.18
261 0.17
262 0.15
263 0.13
264 0.19
265 0.21
266 0.24
267 0.24
268 0.26
269 0.29
270 0.3
271 0.26
272 0.23
273 0.21
274 0.21
275 0.22
276 0.2
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.13
281 0.14
282 0.19
283 0.25
284 0.27
285 0.32
286 0.35
287 0.36
288 0.4
289 0.46
290 0.44
291 0.47
292 0.49
293 0.48
294 0.52
295 0.53
296 0.49
297 0.41
298 0.36
299 0.26
300 0.27
301 0.26
302 0.29
303 0.38
304 0.44
305 0.47
306 0.54
307 0.6
308 0.66
309 0.72
310 0.71
311 0.7
312 0.71
313 0.72
314 0.67
315 0.62
316 0.52
317 0.47
318 0.43
319 0.36
320 0.34
321 0.31
322 0.29
323 0.34
324 0.37
325 0.33
326 0.31
327 0.32
328 0.29
329 0.33
330 0.34
331 0.32
332 0.31
333 0.32
334 0.31
335 0.28
336 0.26
337 0.2
338 0.2
339 0.16
340 0.15
341 0.13
342 0.14
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.21
347 0.28
348 0.29
349 0.32
350 0.36
351 0.35
352 0.35
353 0.36
354 0.36
355 0.31
356 0.34
357 0.35
358 0.32