Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8FXM4

Protein Details
Accession S8FXM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-160VSPSAPRRRPRGPKQVRSTLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RRRPRGP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MDGIIEDEREENEAANELGKRWVRVARAGLKIAKHVNGFAYYPAATEEQRGQWKVEGVLAAKGARWQEEERREREEEEKRLRGRRWDEDSMDVDDEDGLAAEDPADETEDDETDTPEIKALKDRRRYLQSLLDSSSQGHVSPSAPRRRPRGPKQVRSTLRVVPGYTTLVFDTNILLSSLSIFSSLVECLQWTVVVPLPVIMELDGLASNASPLGEAATAALVYITSHIRSHSTSLKVQTSRGNYLSSLSIRTEQVDFAGDEASWERNMDDLILRAAIWQDEHWIDRSAMLQSDGVSRDTSGAAKVVLLSFDRMLRLKARSRQLSAANEQDMASILTPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.14
4 0.13
5 0.2
6 0.22
7 0.23
8 0.25
9 0.29
10 0.29
11 0.35
12 0.42
13 0.43
14 0.46
15 0.5
16 0.5
17 0.47
18 0.5
19 0.49
20 0.44
21 0.37
22 0.33
23 0.3
24 0.29
25 0.28
26 0.23
27 0.22
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.16
34 0.19
35 0.22
36 0.29
37 0.3
38 0.3
39 0.3
40 0.32
41 0.3
42 0.28
43 0.25
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.17
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.18
53 0.2
54 0.27
55 0.37
56 0.44
57 0.45
58 0.49
59 0.5
60 0.49
61 0.54
62 0.53
63 0.53
64 0.55
65 0.59
66 0.59
67 0.65
68 0.66
69 0.66
70 0.65
71 0.64
72 0.63
73 0.62
74 0.58
75 0.56
76 0.55
77 0.48
78 0.42
79 0.33
80 0.25
81 0.18
82 0.15
83 0.1
84 0.07
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.07
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.17
107 0.24
108 0.32
109 0.4
110 0.45
111 0.5
112 0.56
113 0.59
114 0.55
115 0.55
116 0.51
117 0.45
118 0.43
119 0.37
120 0.31
121 0.29
122 0.26
123 0.18
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.15
129 0.22
130 0.3
131 0.35
132 0.4
133 0.46
134 0.55
135 0.64
136 0.67
137 0.71
138 0.73
139 0.77
140 0.8
141 0.84
142 0.79
143 0.73
144 0.67
145 0.59
146 0.53
147 0.45
148 0.37
149 0.27
150 0.25
151 0.22
152 0.18
153 0.14
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.14
218 0.19
219 0.22
220 0.25
221 0.29
222 0.35
223 0.35
224 0.36
225 0.38
226 0.37
227 0.38
228 0.36
229 0.33
230 0.26
231 0.27
232 0.28
233 0.23
234 0.2
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.18
239 0.18
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.14
278 0.13
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.17
299 0.17
300 0.19
301 0.23
302 0.29
303 0.35
304 0.42
305 0.51
306 0.55
307 0.59
308 0.63
309 0.66
310 0.67
311 0.64
312 0.63
313 0.55
314 0.48
315 0.43
316 0.37
317 0.3
318 0.24
319 0.18