Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8ETP7

Protein Details
Accession S8ETP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-85MSSRNDYRRRERSPVRERDRLDRHRDARRSRSRSPPRRGERDRRDYDRRDYGRDRPDDRRDRDRRDDRRRDDRDRRDHDRERDRGBasic
205-224GVDIKKMRTWRQYMNRRGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-120RRRERSPVRERDRLDRHRDARRSRSRSPPRRGERDRRDYDRRDYGRDRPDDRRDRDRRDDRRRDDRDRRDHDRERDRGDKREPPPPPRERESHRESDRARDKDAKPRDRPDNR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRNDYRRRERSPVRERDRLDRHRDARRSRSRSPPRRGERDRRDYDRRDYGRDRPDDRRDRDRRDDRRRDDRDRRDHDRERDRGDKREPPPPPRERESHRESDRARDKDAKPRDRPDNRDGRHDQRREAVDAGTSGSHAAPITRDTPDTRSRHTSEMPTEDGEEGEATDADATNDDDAAMMAMMGMGGFGSTKGKHVDGNQEGGVDIKKMRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.83
4 0.8
5 0.8
6 0.81
7 0.79
8 0.77
9 0.76
10 0.76
11 0.77
12 0.83
13 0.81
14 0.82
15 0.83
16 0.82
17 0.79
18 0.83
19 0.84
20 0.85
21 0.86
22 0.86
23 0.85
24 0.88
25 0.9
26 0.9
27 0.9
28 0.9
29 0.89
30 0.87
31 0.86
32 0.81
33 0.79
34 0.79
35 0.71
36 0.68
37 0.65
38 0.65
39 0.65
40 0.66
41 0.64
42 0.62
43 0.69
44 0.71
45 0.72
46 0.74
47 0.74
48 0.75
49 0.8
50 0.82
51 0.82
52 0.83
53 0.88
54 0.85
55 0.87
56 0.87
57 0.87
58 0.87
59 0.87
60 0.86
61 0.84
62 0.84
63 0.82
64 0.82
65 0.82
66 0.8
67 0.76
68 0.72
69 0.73
70 0.68
71 0.65
72 0.63
73 0.62
74 0.56
75 0.58
76 0.57
77 0.55
78 0.61
79 0.62
80 0.62
81 0.57
82 0.6
83 0.58
84 0.6
85 0.59
86 0.58
87 0.54
88 0.55
89 0.51
90 0.55
91 0.58
92 0.52
93 0.49
94 0.48
95 0.48
96 0.5
97 0.59
98 0.59
99 0.55
100 0.6
101 0.67
102 0.66
103 0.7
104 0.68
105 0.69
106 0.61
107 0.64
108 0.62
109 0.61
110 0.63
111 0.58
112 0.52
113 0.47
114 0.48
115 0.41
116 0.37
117 0.29
118 0.2
119 0.18
120 0.17
121 0.11
122 0.09
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.17
135 0.26
136 0.28
137 0.31
138 0.35
139 0.37
140 0.39
141 0.41
142 0.41
143 0.37
144 0.38
145 0.35
146 0.3
147 0.28
148 0.24
149 0.21
150 0.17
151 0.12
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.03
178 0.05
179 0.06
180 0.09
181 0.11
182 0.13
183 0.16
184 0.19
185 0.29
186 0.3
187 0.34
188 0.32
189 0.3
190 0.29
191 0.27
192 0.25
193 0.16
194 0.14
195 0.12
196 0.15
197 0.2
198 0.28
199 0.35
200 0.41
201 0.5
202 0.59
203 0.68
204 0.75
205 0.81
206 0.79
207 0.76
208 0.74
209 0.73
210 0.7
211 0.68
212 0.66