FuNGI

S8EDB1

Protein Details

Accession

S8EDB1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-65	EERELFEDPYKRKRRRKNGKEDAIYGVF	Basic
347-370	HEERTQAWKKPRKAKTRIAHKTYE	Basic
856-879	AAVAGKQKATPKPRPARTQEITFR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
48-57	KRKRRRKNGK
335-364	PASKLGRKAAKAHEERTQAWKKPRKAKTRI

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000467 G_patch_dom IPR022783 GCFC_dom IPR022159 STIP/TFIP11_N IPR045211 TFP11/STIP/Ntr1
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000390 P:spliceosomal complex disassembly
Pfam	View protein in Pfam PF01585 G-patch PF07842 GCFC PF12457 TIP_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50174 G_PATCH

Amino Acid Sequences

MARRKRQFLDDDDDSSSVSDADDYNDTNIHPNDPDAREERELFEDPYKRKRRRKNGKEDAIYGVFADDDEDEGFGGRSGGKPEKRRDWAKAPAFVSGEKVELDKVTDVDVEMKDAVAEDGGESSGDSDEEAADDALQTDDSGPSNAPSPRIREEEEESEARPRFGGIGIGASKSQASSASSGFNKGGLGFTRGGIGSSVRSSTPPAGAGLEPTPVPETSEDLPSAFGGSRPRRSFLRDERSKSGTPQQAPKLSAAERQHFSKLGGTFGARMLEKMGWQAGTGLGVTGEGIVAPVESKLRPKGMGLAFKGFTEKTEQSRAEARRRGEVVSDDEEKPASKLGRKAAKAHEERTQAWKKPRKAKTRIAHKTYEEIVAEAGQEAAPTGIGQIIDATGATPREVSSLADVSLASWTPTADPMRLPEVRHNLRLITEACKGDLDGLAREAKTLEERKKWVRAEDARLRKKVEEEAELIYRLQQVNLVVGDINSQAKELASSYEPSLETFSPNFEKLLGQFSTEFDRYRLDEVIVAAIAPIVRRMLAQWHPLHDPCAFTRLFRIWRNALKMAVPDEKPQDQVSVYGISTVISSAPAPMTPYESLLWNAWLPKVRSSINNDWSPDDPQPAVRLYEAWSSFLPPFVRDNFFDQLVLPKVAKAVDAWSPRLSKVSLQTLVFPWLPHVGLRLDEVLGDARRKVKSILRHWAVADGMPDDLGAWKDVFDVGDWDAMLLKYVVPKLGSRLREDFRVNPRNQDMAPLQDAMLWENLLAPPVMSRILETEFFPKWLDVLHVWLIQPSPSLEEVARWYSEWKGTFSDNVQSMPGVAQGFTRGLQLMNKAIELGPNAPTQLPRPEHHRSPSPAAVAGKQKATPKPRPARTQEITFRSIVEDYASSHNLLFMPAGRAHEKSRMPLFRVSPTADGKGGLLVYIQDDAVWAPNGDDYQAISLENMVLRATKEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.34
3	0.27
4	0.18
5	0.13
6	0.11
7	0.08
8	0.11
9	0.12
10	0.13
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.21
15	0.22
16	0.21
17	0.2
18	0.22
19	0.28
20	0.29
21	0.34
22	0.32
23	0.36
24	0.38
25	0.39
26	0.4
27	0.37
28	0.38
29	0.36
30	0.4
31	0.42
32	0.43
33	0.52
34	0.59
35	0.64
36	0.72
37	0.8
38	0.83
39	0.87
40	0.93
41	0.93
42	0.94
43	0.95
44	0.92
45	0.85
46	0.81
47	0.71
48	0.6
49	0.48
50	0.37
51	0.26
52	0.18
53	0.15
54	0.08
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.08
60	0.08
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.09
65	0.14
66	0.23
67	0.31
68	0.39
69	0.48
70	0.58
71	0.66
72	0.71
73	0.74
74	0.74
75	0.77
76	0.76
77	0.75
78	0.66
79	0.62
80	0.57
81	0.49
82	0.44
83	0.35
84	0.28
85	0.21
86	0.2
87	0.16
88	0.15
89	0.16
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.13
94	0.13
95	0.16
96	0.15
97	0.15
98	0.14
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.07
104	0.07
105	0.05
106	0.05
107	0.06
108	0.06
109	0.05
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.06
117	0.07
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.08
128	0.09
129	0.09
130	0.1
131	0.15
132	0.16
133	0.2
134	0.22
135	0.26
136	0.31
137	0.35
138	0.37
139	0.38
140	0.42
141	0.43
142	0.45
143	0.41
144	0.37
145	0.4
146	0.37
147	0.33
148	0.26
149	0.22
150	0.17
151	0.16
152	0.16
153	0.09
154	0.14
155	0.15
156	0.16
157	0.15
158	0.15
159	0.14
160	0.12
161	0.12
162	0.08
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.17
167	0.17
168	0.2
169	0.19
170	0.18
171	0.17
172	0.15
173	0.17
174	0.13
175	0.16
176	0.14
177	0.14
178	0.16
179	0.15
180	0.15
181	0.13
182	0.12
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.11
187	0.12
188	0.14
189	0.16
190	0.16
191	0.15
192	0.15
193	0.15
194	0.15
195	0.17
196	0.14
197	0.14
198	0.12
199	0.12
200	0.13
201	0.11
202	0.13
203	0.11
204	0.14
205	0.14
206	0.17
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.14
212	0.11
213	0.11
214	0.18
215	0.24
216	0.32
217	0.34
218	0.37
219	0.38
220	0.44
221	0.51
222	0.53
223	0.58
224	0.58
225	0.62
226	0.65
227	0.69
228	0.65
229	0.59
230	0.58
231	0.54
232	0.5
233	0.52
234	0.53
235	0.52
236	0.52
237	0.5
238	0.45
239	0.39
240	0.41
241	0.38
242	0.37
243	0.35
244	0.36
245	0.37
246	0.33
247	0.33
248	0.31
249	0.27
250	0.22
251	0.2
252	0.18
253	0.17
254	0.17
255	0.19
256	0.13
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.13
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.06
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.03
275	0.02
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.09
284	0.12
285	0.14
286	0.15
287	0.15
288	0.23
289	0.26
290	0.32
291	0.31
292	0.33
293	0.32
294	0.32
295	0.33
296	0.25
297	0.21
298	0.21
299	0.21
300	0.21
301	0.27
302	0.27
303	0.28
304	0.36
305	0.41
306	0.43
307	0.46
308	0.44
309	0.43
310	0.44
311	0.42
312	0.36
313	0.33
314	0.29
315	0.28
316	0.3
317	0.25
318	0.24
319	0.23
320	0.22
321	0.19
322	0.18
323	0.16
324	0.16
325	0.19
326	0.26
327	0.34
328	0.36
329	0.41
330	0.45
331	0.53
332	0.54
333	0.52
334	0.52
335	0.48
336	0.48
337	0.52
338	0.52
339	0.48
340	0.54
341	0.59
342	0.61
343	0.67
344	0.74
345	0.75
346	0.77
347	0.81
348	0.81
349	0.83
350	0.85
351	0.8
352	0.76
353	0.67
354	0.63
355	0.54
356	0.48
357	0.36
358	0.26
359	0.21
360	0.15
361	0.14
362	0.09
363	0.08
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.11
404	0.15
405	0.17
406	0.18
407	0.21
408	0.29
409	0.32
410	0.34
411	0.32
412	0.28
413	0.27
414	0.29
415	0.25
416	0.19
417	0.2
418	0.18
419	0.17
420	0.17
421	0.16
422	0.14
423	0.14
424	0.11
425	0.07
426	0.08
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.12
433	0.18
434	0.22
435	0.25
436	0.29
437	0.34
438	0.41
439	0.42
440	0.39
441	0.41
442	0.42
443	0.46
444	0.51
445	0.58
446	0.57
447	0.58
448	0.57
449	0.49
450	0.46
451	0.42
452	0.35
453	0.28
454	0.23
455	0.23
456	0.22
457	0.22
458	0.2
459	0.16
460	0.15
461	0.12
462	0.1
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.08
482	0.08
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.13
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.11
495	0.11
496	0.1
497	0.15
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.13
502	0.16
503	0.17
504	0.17
505	0.13
506	0.14
507	0.14
508	0.16
509	0.15
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.09
515	0.08
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.1
526	0.13
527	0.2
528	0.21
529	0.24
530	0.26
531	0.27
532	0.28
533	0.24
534	0.22
535	0.16
536	0.19
537	0.16
538	0.14
539	0.16
540	0.19
541	0.24
542	0.25
543	0.29
544	0.31
545	0.35
546	0.4
547	0.38
548	0.35
549	0.3
550	0.28
551	0.27
552	0.28
553	0.24
554	0.23
555	0.25
556	0.25
557	0.25
558	0.24
559	0.22
560	0.16
561	0.16
562	0.15
563	0.13
564	0.11
565	0.1
566	0.09
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.06
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.06
578	0.1
579	0.09
580	0.11
581	0.11
582	0.12
583	0.13
584	0.13
585	0.14
586	0.11
587	0.12
588	0.12
589	0.16
590	0.16
591	0.18
592	0.21
593	0.22
594	0.26
595	0.33
596	0.4
597	0.42
598	0.45
599	0.43
600	0.41
601	0.41
602	0.4
603	0.33
604	0.27
605	0.2
606	0.17
607	0.18
608	0.17
609	0.16
610	0.13
611	0.12
612	0.12
613	0.18
614	0.17
615	0.17
616	0.16
617	0.18
618	0.18
619	0.2
620	0.19
621	0.14
622	0.17
623	0.19
624	0.21
625	0.21
626	0.25
627	0.24
628	0.24
629	0.23
630	0.2
631	0.21
632	0.2
633	0.2
634	0.15
635	0.13
636	0.13
637	0.13
638	0.13
639	0.1
640	0.1
641	0.15
642	0.18
643	0.2
644	0.23
645	0.24
646	0.24
647	0.26
648	0.24
649	0.2
650	0.23
651	0.27
652	0.28
653	0.27
654	0.29
655	0.28
656	0.31
657	0.28
658	0.23
659	0.17
660	0.15
661	0.15
662	0.13
663	0.14
664	0.11
665	0.11
666	0.12
667	0.11
668	0.1
669	0.09
670	0.1
671	0.11
672	0.12
673	0.12
674	0.13
675	0.17
676	0.18
677	0.19
678	0.22
679	0.24
680	0.32
681	0.39
682	0.48
683	0.47
684	0.49
685	0.48
686	0.47
687	0.42
688	0.33
689	0.26
690	0.16
691	0.13
692	0.1
693	0.09
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.07
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.09
707	0.08
708	0.08
709	0.09
710	0.08
711	0.09
712	0.07
713	0.07
714	0.09
715	0.1
716	0.11
717	0.11
718	0.12
719	0.17
720	0.24
721	0.26
722	0.29
723	0.35
724	0.36
725	0.41
726	0.44
727	0.46
728	0.5
729	0.57
730	0.53
731	0.53
732	0.54
733	0.52
734	0.48
735	0.46
736	0.38
737	0.33
738	0.33
739	0.27
740	0.23
741	0.21
742	0.21
743	0.17
744	0.15
745	0.11
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.08
750	0.08
751	0.06
752	0.06
753	0.07
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.09
758	0.12
759	0.13
760	0.14
761	0.18
762	0.17
763	0.19
764	0.19
765	0.17
766	0.14
767	0.14
768	0.16
769	0.12
770	0.15
771	0.17
772	0.18
773	0.18
774	0.19
775	0.19
776	0.16
777	0.16
778	0.13
779	0.13
780	0.11
781	0.13
782	0.12
783	0.14
784	0.17
785	0.19
786	0.19
787	0.16
788	0.18
789	0.19
790	0.24
791	0.24
792	0.22
793	0.22
794	0.23
795	0.26
796	0.26
797	0.3
798	0.26
799	0.25
800	0.24
801	0.21
802	0.2
803	0.17
804	0.18
805	0.11
806	0.1
807	0.09
808	0.11
809	0.12
810	0.12
811	0.13
812	0.1
813	0.11
814	0.13
815	0.16
816	0.18
817	0.18
818	0.18
819	0.18
820	0.17
821	0.18
822	0.18
823	0.17
824	0.15
825	0.15
826	0.16
827	0.17
828	0.18
829	0.19
830	0.26
831	0.29
832	0.29
833	0.36
834	0.43
835	0.49
836	0.55
837	0.6
838	0.58
839	0.61
840	0.63
841	0.58
842	0.55
843	0.5
844	0.48
845	0.47
846	0.44
847	0.4
848	0.38
849	0.43
850	0.46
851	0.53
852	0.58
853	0.61
854	0.68
855	0.74
856	0.8
857	0.81
858	0.83
859	0.8
860	0.8
861	0.79
862	0.74
863	0.69
864	0.59
865	0.52
866	0.44
867	0.38
868	0.29
869	0.22
870	0.16
871	0.16
872	0.21
873	0.21
874	0.19
875	0.19
876	0.2
877	0.18
878	0.17
879	0.15
880	0.12
881	0.15
882	0.17
883	0.21
884	0.22
885	0.25
886	0.27
887	0.35
888	0.35
889	0.38
890	0.46
891	0.48
892	0.49
893	0.54
894	0.54
895	0.53
896	0.55
897	0.52
898	0.48
899	0.46
900	0.45
901	0.39
902	0.35
903	0.29
904	0.26
905	0.22
906	0.16
907	0.12
908	0.09
909	0.1
910	0.1
911	0.09
912	0.07
913	0.07
914	0.08
915	0.1
916	0.11
917	0.1
918	0.09
919	0.11
920	0.12
921	0.12
922	0.12
923	0.1
924	0.11
925	0.12
926	0.12
927	0.1
928	0.1
929	0.12
930	0.12
931	0.11
932	0.1
933	0.11

S8EDB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer