Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8E8P1

Protein Details
Accession S8E8P1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-33VEHIARIKPRKANVRGPKSHHSRSSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-19PRKA
Subcellular Location(s) plas 10, mito 7, nucl 4, cyto 3, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences LSSFVSLVEHIARIKPRKANVRGPKSHHSRSSVVHTFQNWVSELHRRYDPLPPGTTAIIFRLLFPEEDAKRKYDMQETRLAHAISKALCMSHTLHGRGQKLATWKAQTAVGCLGHEVRKVLEDSEVSSIGAGNQLSIEEVDALLSTLASRSAFSANSVRQDSASVSSLKSRPRSDVIRALYSRLPASEACVVTQIILKDLRPLLYPLPEDEMHYTSLLMHYKSNAVEQLSKSDAMRIWDTSGRMLASYRVRALLDEAALVYEQGLCLNTPRESSLAPKVGTPIQIPKCSKGQGCAHTLRLLHGSDKVWAETKYDGERTQIHVEISSDCPRITIYSKSGRDSTMDRVAIHPIILEAIGYGTASCKVKRNIVLEAEMVAYSDALHRVDEFWRIRSLIGTTAVGPRHTRHPKQVTTSSQDTLVLCRVSSQCSLFSNASDDGARHLALVFFDVLVLDGVSLLSSPYFSRRKTLEDLLHLKPGLVMLADRIAIDMRPDGHAVDPESRLRKVFAEIIADHQEGLVLKAHEAAYNDWQMPWVKLKKDYIEGYGDALDLVLVGASWEKDRARELRVAPTVYTTFYIGALANAQAVKADARCTPHFEVFFTASYGLSREELEQLNFRIKSSDFVRYEPGKTLHGLAYTYNVFKGLPPPAVLLPVPILAEVVGGSFTKATHSKFYELRFPRITKVYRSNERSWRDGATLDEFQRIAREAVGHESSHKDVEDWCNELWGKPSSPGVKCPLKRKRTEAEWEEKLEVADRRTGKKTRTSKASAEPDDSGEEENTGGPLPESLKSPRLTRALGSMTNLLSSSPVADDCGGASPSEPSVAVVSAKVTRLPSPPSIAHPPRRGQLLDRKETLTSPSSDYAPLSPPSPPRSDVSFRVHSKRMSASEPLIDDSNIVVDTHLVRLSHKAEGSSTTITGFTSTTTTDFASTPIGRFLRDAVVWLATPGNAPRPAWRVPSKLIFPTGQQVHSLESVFQACNWGTGRDVDVCDWAKKGVIFVDDTQGSGERSWTAYPLRPLTERRSTLLHANDAASSKPIWVFSVTMLSYDVLRGCCSLPVADAMVEGRALCRFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.45
3 0.52
4 0.61
5 0.67
6 0.73
7 0.76
8 0.8
9 0.82
10 0.83
11 0.85
12 0.83
13 0.84
14 0.8
15 0.75
16 0.69
17 0.65
18 0.67
19 0.65
20 0.59
21 0.55
22 0.49
23 0.48
24 0.45
25 0.43
26 0.34
27 0.28
28 0.28
29 0.32
30 0.33
31 0.33
32 0.35
33 0.34
34 0.35
35 0.43
36 0.48
37 0.45
38 0.46
39 0.42
40 0.42
41 0.41
42 0.4
43 0.32
44 0.26
45 0.26
46 0.23
47 0.21
48 0.21
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.27
53 0.25
54 0.32
55 0.34
56 0.33
57 0.35
58 0.39
59 0.41
60 0.42
61 0.46
62 0.44
63 0.51
64 0.51
65 0.51
66 0.53
67 0.49
68 0.4
69 0.34
70 0.34
71 0.25
72 0.25
73 0.22
74 0.17
75 0.17
76 0.19
77 0.2
78 0.23
79 0.28
80 0.29
81 0.32
82 0.38
83 0.4
84 0.41
85 0.38
86 0.35
87 0.36
88 0.39
89 0.41
90 0.4
91 0.39
92 0.37
93 0.4
94 0.36
95 0.32
96 0.32
97 0.27
98 0.22
99 0.22
100 0.25
101 0.23
102 0.25
103 0.22
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.2
113 0.17
114 0.16
115 0.15
116 0.12
117 0.14
118 0.11
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.1
139 0.1
140 0.13
141 0.2
142 0.22
143 0.27
144 0.3
145 0.28
146 0.27
147 0.28
148 0.27
149 0.23
150 0.23
151 0.19
152 0.17
153 0.23
154 0.27
155 0.32
156 0.37
157 0.36
158 0.38
159 0.43
160 0.48
161 0.48
162 0.53
163 0.52
164 0.54
165 0.52
166 0.51
167 0.47
168 0.43
169 0.37
170 0.29
171 0.26
172 0.17
173 0.2
174 0.23
175 0.21
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.18
180 0.2
181 0.16
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.17
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.2
190 0.2
191 0.23
192 0.24
193 0.21
194 0.24
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.24
199 0.21
200 0.2
201 0.18
202 0.14
203 0.17
204 0.18
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.22
214 0.22
215 0.25
216 0.24
217 0.25
218 0.23
219 0.24
220 0.23
221 0.22
222 0.23
223 0.2
224 0.21
225 0.23
226 0.23
227 0.21
228 0.21
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.17
233 0.19
234 0.21
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.22
240 0.19
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.18
261 0.23
262 0.26
263 0.25
264 0.25
265 0.27
266 0.27
267 0.29
268 0.26
269 0.28
270 0.29
271 0.36
272 0.38
273 0.38
274 0.4
275 0.43
276 0.42
277 0.4
278 0.42
279 0.39
280 0.44
281 0.44
282 0.42
283 0.41
284 0.4
285 0.35
286 0.31
287 0.26
288 0.21
289 0.21
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.18
296 0.19
297 0.17
298 0.2
299 0.2
300 0.22
301 0.21
302 0.22
303 0.24
304 0.27
305 0.29
306 0.27
307 0.24
308 0.22
309 0.22
310 0.22
311 0.23
312 0.23
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.2
321 0.28
322 0.31
323 0.33
324 0.35
325 0.33
326 0.33
327 0.32
328 0.32
329 0.3
330 0.28
331 0.26
332 0.26
333 0.28
334 0.26
335 0.23
336 0.17
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.06
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.07
348 0.08
349 0.1
350 0.16
351 0.18
352 0.23
353 0.29
354 0.31
355 0.33
356 0.34
357 0.34
358 0.28
359 0.27
360 0.23
361 0.17
362 0.14
363 0.09
364 0.07
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.08
372 0.09
373 0.16
374 0.17
375 0.17
376 0.19
377 0.19
378 0.19
379 0.19
380 0.19
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.12
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.17
389 0.16
390 0.25
391 0.33
392 0.35
393 0.41
394 0.48
395 0.51
396 0.57
397 0.63
398 0.58
399 0.56
400 0.56
401 0.47
402 0.4
403 0.37
404 0.3
405 0.24
406 0.21
407 0.15
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.2
417 0.17
418 0.16
419 0.17
420 0.16
421 0.15
422 0.13
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.03
448 0.1
449 0.14
450 0.15
451 0.19
452 0.2
453 0.25
454 0.29
455 0.35
456 0.32
457 0.35
458 0.41
459 0.39
460 0.4
461 0.35
462 0.3
463 0.24
464 0.21
465 0.14
466 0.08
467 0.06
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.12
485 0.13
486 0.15
487 0.17
488 0.17
489 0.18
490 0.17
491 0.17
492 0.16
493 0.17
494 0.15
495 0.16
496 0.15
497 0.18
498 0.2
499 0.19
500 0.17
501 0.14
502 0.14
503 0.1
504 0.11
505 0.1
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.11
512 0.12
513 0.12
514 0.14
515 0.14
516 0.12
517 0.13
518 0.13
519 0.12
520 0.17
521 0.18
522 0.18
523 0.22
524 0.24
525 0.25
526 0.29
527 0.29
528 0.25
529 0.24
530 0.22
531 0.2
532 0.18
533 0.15
534 0.11
535 0.09
536 0.06
537 0.04
538 0.03
539 0.02
540 0.02
541 0.02
542 0.02
543 0.03
544 0.03
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.09
549 0.12
550 0.14
551 0.19
552 0.21
553 0.26
554 0.29
555 0.29
556 0.26
557 0.26
558 0.24
559 0.19
560 0.18
561 0.12
562 0.09
563 0.08
564 0.09
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.07
577 0.08
578 0.13
579 0.14
580 0.19
581 0.22
582 0.24
583 0.24
584 0.23
585 0.24
586 0.21
587 0.21
588 0.16
589 0.14
590 0.11
591 0.1
592 0.1
593 0.08
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.1
598 0.11
599 0.12
600 0.13
601 0.13
602 0.18
603 0.18
604 0.17
605 0.16
606 0.15
607 0.19
608 0.2
609 0.28
610 0.23
611 0.25
612 0.3
613 0.31
614 0.32
615 0.32
616 0.3
617 0.23
618 0.22
619 0.23
620 0.18
621 0.16
622 0.15
623 0.12
624 0.13
625 0.13
626 0.13
627 0.11
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.13
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.14
636 0.14
637 0.15
638 0.15
639 0.12
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.07
644 0.07
645 0.05
646 0.05
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.03
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.07
655 0.09
656 0.11
657 0.16
658 0.18
659 0.22
660 0.25
661 0.28
662 0.35
663 0.36
664 0.41
665 0.41
666 0.4
667 0.4
668 0.44
669 0.44
670 0.41
671 0.47
672 0.5
673 0.53
674 0.59
675 0.62
676 0.64
677 0.65
678 0.62
679 0.54
680 0.48
681 0.4
682 0.34
683 0.29
684 0.24
685 0.24
686 0.22
687 0.22
688 0.2
689 0.18
690 0.18
691 0.18
692 0.13
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.14
697 0.15
698 0.14
699 0.15
700 0.17
701 0.17
702 0.17
703 0.17
704 0.13
705 0.14
706 0.19
707 0.2
708 0.2
709 0.19
710 0.21
711 0.22
712 0.22
713 0.22
714 0.19
715 0.18
716 0.16
717 0.21
718 0.24
719 0.25
720 0.29
721 0.32
722 0.38
723 0.42
724 0.51
725 0.57
726 0.6
727 0.64
728 0.67
729 0.68
730 0.67
731 0.73
732 0.7
733 0.68
734 0.64
735 0.61
736 0.55
737 0.47
738 0.4
739 0.33
740 0.28
741 0.21
742 0.22
743 0.22
744 0.26
745 0.32
746 0.36
747 0.37
748 0.45
749 0.52
750 0.54
751 0.59
752 0.6
753 0.6
754 0.65
755 0.7
756 0.63
757 0.57
758 0.51
759 0.43
760 0.39
761 0.34
762 0.26
763 0.17
764 0.14
765 0.11
766 0.1
767 0.09
768 0.07
769 0.06
770 0.05
771 0.06
772 0.07
773 0.08
774 0.11
775 0.14
776 0.19
777 0.21
778 0.23
779 0.28
780 0.31
781 0.31
782 0.28
783 0.31
784 0.3
785 0.29
786 0.29
787 0.26
788 0.22
789 0.21
790 0.2
791 0.15
792 0.11
793 0.1
794 0.09
795 0.07
796 0.07
797 0.07
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.1
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.09
806 0.09
807 0.09
808 0.09
809 0.07
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.09
815 0.11
816 0.11
817 0.13
818 0.14
819 0.16
820 0.19
821 0.23
822 0.24
823 0.28
824 0.29
825 0.32
826 0.41
827 0.46
828 0.51
829 0.54
830 0.55
831 0.53
832 0.56
833 0.52
834 0.49
835 0.51
836 0.52
837 0.51
838 0.5
839 0.49
840 0.45
841 0.45
842 0.42
843 0.35
844 0.28
845 0.25
846 0.24
847 0.24
848 0.24
849 0.24
850 0.21
851 0.21
852 0.2
853 0.18
854 0.2
855 0.24
856 0.28
857 0.3
858 0.31
859 0.3
860 0.36
861 0.4
862 0.43
863 0.45
864 0.49
865 0.51
866 0.56
867 0.57
868 0.51
869 0.5
870 0.5
871 0.46
872 0.41
873 0.39
874 0.35
875 0.35
876 0.35
877 0.32
878 0.27
879 0.24
880 0.2
881 0.16
882 0.14
883 0.11
884 0.09
885 0.07
886 0.07
887 0.08
888 0.1
889 0.12
890 0.11
891 0.11
892 0.16
893 0.19
894 0.22
895 0.22
896 0.21
897 0.2
898 0.23
899 0.26
900 0.23
901 0.21
902 0.18
903 0.17
904 0.16
905 0.16
906 0.13
907 0.1
908 0.09
909 0.1
910 0.1
911 0.11
912 0.12
913 0.13
914 0.13
915 0.13
916 0.17
917 0.17
918 0.17
919 0.22
920 0.22
921 0.21
922 0.22
923 0.23
924 0.21
925 0.2
926 0.21
927 0.17
928 0.18
929 0.17
930 0.17
931 0.16
932 0.11
933 0.13
934 0.13
935 0.17
936 0.18
937 0.19
938 0.24
939 0.28
940 0.31
941 0.38
942 0.43
943 0.42
944 0.45
945 0.52
946 0.52
947 0.51
948 0.51
949 0.45
950 0.4
951 0.44
952 0.42
953 0.36
954 0.33
955 0.3
956 0.28
957 0.29
958 0.27
959 0.19
960 0.17
961 0.19
962 0.17
963 0.16
964 0.17
965 0.15
966 0.18
967 0.19
968 0.18
969 0.16
970 0.18
971 0.2
972 0.2
973 0.22
974 0.19
975 0.24
976 0.26
977 0.26
978 0.26
979 0.23
980 0.22
981 0.21
982 0.22
983 0.18
984 0.18
985 0.2
986 0.2
987 0.27
988 0.24
989 0.24
990 0.24
991 0.22
992 0.21
993 0.18
994 0.18
995 0.12
996 0.14
997 0.15
998 0.17
999 0.19
1000 0.24
1001 0.3
1002 0.34
1003 0.36
1004 0.4
1005 0.45
1006 0.49
1007 0.55
1008 0.53
1009 0.49
1010 0.49
1011 0.48
1012 0.51
1013 0.5
1014 0.47
1015 0.39
1016 0.37
1017 0.37
1018 0.33
1019 0.31
1020 0.25
1021 0.19
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.16
1025 0.15
1026 0.16
1027 0.16
1028 0.16
1029 0.23
1030 0.2
1031 0.19
1032 0.2
1033 0.19
1034 0.17
1035 0.18
1036 0.19
1037 0.14
1038 0.15
1039 0.15
1040 0.15
1041 0.16
1042 0.17
1043 0.16
1044 0.14
1045 0.15
1046 0.16
1047 0.14
1048 0.14
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.12
1052 0.11
1053 0.1