Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8EDL0

Protein Details
Accession S8EDL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29IPSSRPKQPAQSQGKGKQKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-37GKGKQKAQEPPKSKE
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MHTAWTSDRIPSSRPKQPAQSQGKGKQKAQEPPKSKEVRRLEHLRDGLRYATGRERDPKGGCFCQARMHTLSTYTPICRNCGLILCELQQPRYACPHCASPLLTPEARRALEARLDTQIDETLAKEEEERQQAVEQARAAAGAFPTLSARAPGLSPSSTSDALAAHPTNQTHKVLSLNSKTKKVTVASFHSSPVVSRSASRERNLKDNAKPDEKRVPPPPAEVPFVKGHRDSGRPWANLRGGAVTYVPPPKPITTHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.6
4 0.66
5 0.73
6 0.73
7 0.74
8 0.75
9 0.78
10 0.82
11 0.79
12 0.74
13 0.71
14 0.69
15 0.69
16 0.7
17 0.71
18 0.68
19 0.68
20 0.75
21 0.76
22 0.71
23 0.71
24 0.71
25 0.68
26 0.69
27 0.72
28 0.68
29 0.68
30 0.71
31 0.64
32 0.56
33 0.51
34 0.43
35 0.37
36 0.31
37 0.25
38 0.28
39 0.28
40 0.3
41 0.34
42 0.37
43 0.41
44 0.43
45 0.46
46 0.45
47 0.44
48 0.44
49 0.41
50 0.38
51 0.39
52 0.38
53 0.37
54 0.33
55 0.32
56 0.29
57 0.27
58 0.27
59 0.23
60 0.23
61 0.2
62 0.23
63 0.21
64 0.23
65 0.22
66 0.22
67 0.2
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.19
72 0.18
73 0.23
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.21
79 0.28
80 0.27
81 0.24
82 0.26
83 0.29
84 0.26
85 0.27
86 0.27
87 0.21
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.2
92 0.21
93 0.23
94 0.22
95 0.21
96 0.18
97 0.16
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.13
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.07
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.12
152 0.1
153 0.12
154 0.12
155 0.15
156 0.18
157 0.18
158 0.16
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.26
163 0.3
164 0.36
165 0.39
166 0.43
167 0.43
168 0.42
169 0.43
170 0.39
171 0.36
172 0.33
173 0.36
174 0.38
175 0.38
176 0.37
177 0.34
178 0.32
179 0.27
180 0.23
181 0.19
182 0.13
183 0.14
184 0.2
185 0.28
186 0.33
187 0.36
188 0.41
189 0.42
190 0.49
191 0.55
192 0.56
193 0.53
194 0.57
195 0.62
196 0.64
197 0.63
198 0.6
199 0.63
200 0.61
201 0.62
202 0.61
203 0.61
204 0.54
205 0.58
206 0.59
207 0.53
208 0.54
209 0.47
210 0.43
211 0.42
212 0.42
213 0.41
214 0.35
215 0.36
216 0.37
217 0.4
218 0.38
219 0.42
220 0.48
221 0.46
222 0.48
223 0.5
224 0.47
225 0.45
226 0.44
227 0.36
228 0.28
229 0.26
230 0.25
231 0.19
232 0.2
233 0.25
234 0.24
235 0.24
236 0.27
237 0.28