Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8EH79

Protein Details
Accession S8EH79    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-166QPQCAWDPPKKPKQPKNTRWGGYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MFSIPIGAKRKHQDADLSDDEEPSLGRQVLPVANLPASFNGIPEDGLQYLFTVRRDARSLPHITRAANPYEVKEEPRDTARDELTAEHPLLPSEQWREVFLKRFKNFRKNTLQSVVEAHGSTLSRKVIPDKRERDLWWAFLTGQPQCAWDPPKKPKQPKNTRWGGYSQGTQGYGVDTLAYSDDTEPTQHLSYSLEDGRVFSTSSTEMWRVSTDGVELTSAMNATTSLPTPSGTPAPPDRLEDQASTHKGSSSLDAILPPEPTPTLMRQINHPYALHLLMYFTYWVNLHLERGSAPSPYPISETHSRWIFVLLSRVEDYVSADEMSLLRNLARACIALIEENRTRENPSVVRPGEDGPHPIGEPTCWMVVTAVVGVWGQKDLWMDAEAMLRRLPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.52
4 0.49
5 0.42
6 0.39
7 0.35
8 0.27
9 0.23
10 0.16
11 0.15
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.16
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.17
24 0.2
25 0.18
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.18
40 0.18
41 0.22
42 0.25
43 0.27
44 0.29
45 0.35
46 0.41
47 0.38
48 0.45
49 0.44
50 0.43
51 0.47
52 0.46
53 0.42
54 0.4
55 0.38
56 0.33
57 0.35
58 0.35
59 0.32
60 0.33
61 0.32
62 0.29
63 0.33
64 0.32
65 0.3
66 0.33
67 0.31
68 0.27
69 0.25
70 0.25
71 0.23
72 0.24
73 0.22
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.14
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.19
83 0.22
84 0.25
85 0.27
86 0.36
87 0.39
88 0.44
89 0.44
90 0.54
91 0.6
92 0.67
93 0.68
94 0.69
95 0.73
96 0.68
97 0.71
98 0.68
99 0.61
100 0.51
101 0.5
102 0.42
103 0.33
104 0.27
105 0.2
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.22
114 0.27
115 0.34
116 0.43
117 0.46
118 0.49
119 0.53
120 0.54
121 0.53
122 0.48
123 0.44
124 0.35
125 0.31
126 0.27
127 0.24
128 0.25
129 0.18
130 0.17
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.17
135 0.19
136 0.22
137 0.3
138 0.38
139 0.48
140 0.56
141 0.65
142 0.7
143 0.78
144 0.84
145 0.85
146 0.85
147 0.85
148 0.78
149 0.7
150 0.64
151 0.58
152 0.49
153 0.42
154 0.33
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.18
159 0.13
160 0.1
161 0.08
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.11
220 0.13
221 0.15
222 0.2
223 0.21
224 0.23
225 0.23
226 0.23
227 0.25
228 0.22
229 0.23
230 0.25
231 0.27
232 0.26
233 0.24
234 0.21
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.18
252 0.21
253 0.21
254 0.26
255 0.34
256 0.36
257 0.36
258 0.34
259 0.29
260 0.28
261 0.28
262 0.22
263 0.14
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.14
279 0.14
280 0.12
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.15
287 0.2
288 0.26
289 0.29
290 0.32
291 0.33
292 0.33
293 0.31
294 0.32
295 0.27
296 0.22
297 0.25
298 0.2
299 0.2
300 0.21
301 0.21
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.13
306 0.14
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.07
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.2
326 0.23
327 0.25
328 0.27
329 0.27
330 0.3
331 0.28
332 0.33
333 0.31
334 0.34
335 0.41
336 0.39
337 0.4
338 0.39
339 0.38
340 0.36
341 0.34
342 0.32
343 0.25
344 0.26
345 0.24
346 0.23
347 0.22
348 0.18
349 0.2
350 0.19
351 0.17
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.11
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.21
373 0.2
374 0.2
375 0.2