FuNGI

S8ECM8

Protein Details

Accession

S8ECM8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
131-151	HPDFLPKKLPNFKKNKSANSG	Hydrophilic
231-254	PDFSQKTPRPTSQRPRPRPAYKGA	Hydrophilic
270-293	DMDGKGDTRRSKRRKPAIQQSDSD	Hydrophilic
828-850	GTDPSGSRPKPRRRLRPEATLTE	Hydrophilic
862-884	ATQPSRKAKGKAKSSRSREPTDT	Hydrophilic
922-945	EMDVQPPPRPKPRPKRAYVGPTAT	Hydrophilic
990-1009	DPTPRPKKVSRLPLQLARER	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-284	RRSKRRK
300-314	RRGAVEKAKQKGKGK
343-348	GKALKK
502-509	RRARKKRR
835-842	RPKPRRRL
867-877	RKAKGKAKSSR
930-936	RPKPRPK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MRMDRFEDTLRSRKTDLYSDTSGAVRLQHRPMHGKGFVGSENTFARASQSKVGSLGTNRPGNPLVRRRASPVPSELDGSDDELLLSSPPRSQDSRVQKSTTDRVMRTKGIDEESMHTRKGAVMLEKPLEFHPDFLPKKLPNFKKNKSANSGSPAGSQSSQGSVTSTKATVGRATTPRSPPRRRAASPDQAAATTSKQATKPRGRLLPLNELNSNDRRDPPGIVDIDSEPDPDFSQKTPRPTSQRPRPRPAYKGASKSKQAEDVIDIPSEDMDGKGDTRRSKRRKPAIQQSDSDDENLTRRRGAVEKAKQKGKGKANEPTNPIDRLSPVHHSSDEEPPQRSNKGKALKKARQPAQFPELPPLSNPSSSRRTKKSRQLEDFPMDFVSPVSSQKSSLSRQESQLRDFPQLPPLSSSPDDGGSRSRSNKAKSSSQPSSQKSRIHKGTVLSSAESDDDDDDDDVRPFSMQKQLQPFPMQTQLLESIGRSPPKRLDGHSSDLEDEQTRRARKKRRADADPDERLADILRDGEGPEFDEDDMVLLGRGVDPHTLCPWCDERLPATPSPHLQSLIQTARRNSACNPRPTNPLGLRAPVGMFVSVCQRHRFETHQVPKAQLRGWPTTIDWDRVPLRVRALQSRWKAIIDDVDEDFLPGAPRSRGKEDDAPIDWEDSPRRSSVFWQDVVKSVRKDGSRKATGVAGQLANFSKTQPGYYGELGYMIMSQTMYDMFPPVSFPPDSTLPLTPADFIQLILIPEAAVSLIMEDMGQTREEAIVTLRESAEYGVAMFPDDQPEDANEAERGEQIAKRRAQARRRELEVEERAEKMLLASSSQGTDPSGSRPKPRRRLRPEATLTEAESERSEVELVATQPSRKAKGKAKSSRSREPTDTEASDAPSLPRGAHNSGNIGRVTRSRSRAPMPVASSDVEMDVQPPPRPKPRPKRAYVGPTATHCDDGREPYRPSTPTLILEGRSDLDGDTPMKHTSPSRDRRVADEDPTPRPKKVSRLPLQLARERRDKRATSDQWGGGRSEGVTEDDYSTSGTRRGAERSGYRSSTRAGGNSTSWLLSDTDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.5
4	0.47
5	0.47
6	0.44
7	0.44
8	0.39
9	0.36
10	0.29
11	0.28
12	0.25
13	0.27
14	0.32
15	0.35
16	0.4
17	0.46
18	0.49
19	0.52
20	0.5
21	0.46
22	0.41
23	0.41
24	0.37
25	0.35
26	0.31
27	0.27
28	0.26
29	0.26
30	0.24
31	0.2
32	0.23
33	0.23
34	0.25
35	0.28
36	0.29
37	0.28
38	0.29
39	0.3
40	0.3
41	0.29
42	0.35
43	0.36
44	0.39
45	0.38
46	0.41
47	0.43
48	0.44
49	0.5
50	0.51
51	0.53
52	0.53
53	0.55
54	0.58
55	0.63
56	0.63
57	0.59
58	0.56
59	0.52
60	0.47
61	0.48
62	0.41
63	0.35
64	0.31
65	0.27
66	0.21
67	0.15
68	0.14
69	0.11
70	0.11
71	0.09
72	0.1
73	0.08
74	0.1
75	0.13
76	0.17
77	0.2
78	0.24
79	0.34
80	0.44
81	0.53
82	0.56
83	0.56
84	0.56
85	0.61
86	0.64
87	0.64
88	0.6
89	0.54
90	0.56
91	0.6
92	0.59
93	0.55
94	0.51
95	0.46
96	0.42
97	0.42
98	0.36
99	0.35
100	0.39
101	0.39
102	0.34
103	0.3
104	0.26
105	0.24
106	0.25
107	0.25
108	0.22
109	0.24
110	0.3
111	0.34
112	0.33
113	0.34
114	0.31
115	0.34
116	0.29
117	0.27
118	0.25
119	0.32
120	0.33
121	0.35
122	0.41
123	0.38
124	0.47
125	0.55
126	0.6
127	0.6
128	0.69
129	0.73
130	0.76
131	0.81
132	0.81
133	0.79
134	0.77
135	0.73
136	0.69
137	0.66
138	0.57
139	0.52
140	0.44
141	0.38
142	0.32
143	0.27
144	0.22
145	0.19
146	0.19
147	0.15
148	0.16
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.15
153	0.15
154	0.16
155	0.18
156	0.18
157	0.19
158	0.25
159	0.28
160	0.33
161	0.38
162	0.45
163	0.53
164	0.61
165	0.67
166	0.68
167	0.74
168	0.78
169	0.74
170	0.75
171	0.75
172	0.75
173	0.72
174	0.67
175	0.58
176	0.48
177	0.46
178	0.38
179	0.3
180	0.24
181	0.21
182	0.21
183	0.24
184	0.3
185	0.39
186	0.47
187	0.53
188	0.57
189	0.62
190	0.61
191	0.64
192	0.64
193	0.65
194	0.6
195	0.57
196	0.5
197	0.46
198	0.48
199	0.46
200	0.43
201	0.35
202	0.33
203	0.32
204	0.32
205	0.31
206	0.29
207	0.31
208	0.29
209	0.27
210	0.26
211	0.22
212	0.24
213	0.22
214	0.2
215	0.14
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.14
220	0.13
221	0.22
222	0.26
223	0.33
224	0.38
225	0.45
226	0.52
227	0.61
228	0.71
229	0.72
230	0.79
231	0.81
232	0.84
233	0.87
234	0.86
235	0.81
236	0.79
237	0.78
238	0.75
239	0.76
240	0.75
241	0.72
242	0.71
243	0.7
244	0.64
245	0.6
246	0.53
247	0.45
248	0.4
249	0.36
250	0.31
251	0.25
252	0.22
253	0.16
254	0.15
255	0.13
256	0.1
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.11
262	0.16
263	0.22
264	0.31
265	0.42
266	0.5
267	0.6
268	0.69
269	0.76
270	0.82
271	0.86
272	0.89
273	0.89
274	0.86
275	0.79
276	0.74
277	0.68
278	0.58
279	0.48
280	0.38
281	0.28
282	0.26
283	0.27
284	0.22
285	0.18
286	0.18
287	0.2
288	0.22
289	0.28
290	0.33
291	0.39
292	0.47
293	0.54
294	0.59
295	0.63
296	0.67
297	0.69
298	0.68
299	0.67
300	0.64
301	0.65
302	0.67
303	0.67
304	0.64
305	0.61
306	0.55
307	0.48
308	0.43
309	0.35
310	0.28
311	0.25
312	0.24
313	0.25
314	0.23
315	0.24
316	0.24
317	0.25
318	0.27
319	0.33
320	0.37
321	0.35
322	0.34
323	0.35
324	0.38
325	0.4
326	0.4
327	0.37
328	0.37
329	0.43
330	0.46
331	0.52
332	0.6
333	0.63
334	0.68
335	0.74
336	0.74
337	0.72
338	0.71
339	0.68
340	0.64
341	0.6
342	0.52
343	0.49
344	0.42
345	0.35
346	0.31
347	0.3
348	0.25
349	0.24
350	0.24
351	0.23
352	0.3
353	0.37
354	0.43
355	0.47
356	0.54
357	0.6
358	0.69
359	0.74
360	0.76
361	0.78
362	0.78
363	0.77
364	0.74
365	0.66
366	0.56
367	0.46
368	0.36
369	0.28
370	0.21
371	0.15
372	0.09
373	0.1
374	0.12
375	0.11
376	0.12
377	0.15
378	0.2
379	0.21
380	0.27
381	0.32
382	0.32
383	0.37
384	0.44
385	0.44
386	0.43
387	0.45
388	0.41
389	0.38
390	0.37
391	0.32
392	0.31
393	0.3
394	0.27
395	0.24
396	0.23
397	0.24
398	0.23
399	0.23
400	0.17
401	0.18
402	0.18
403	0.16
404	0.18
405	0.18
406	0.21
407	0.22
408	0.28
409	0.31
410	0.34
411	0.4
412	0.42
413	0.46
414	0.49
415	0.55
416	0.54
417	0.56
418	0.61
419	0.59
420	0.62
421	0.59
422	0.59
423	0.56
424	0.6
425	0.57
426	0.52
427	0.5
428	0.45
429	0.43
430	0.41
431	0.37
432	0.28
433	0.24
434	0.21
435	0.18
436	0.16
437	0.12
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.15
451	0.16
452	0.2
453	0.27
454	0.29
455	0.32
456	0.34
457	0.33
458	0.28
459	0.31
460	0.27
461	0.2
462	0.19
463	0.17
464	0.16
465	0.15
466	0.13
467	0.11
468	0.14
469	0.17
470	0.16
471	0.17
472	0.19
473	0.25
474	0.27
475	0.25
476	0.31
477	0.32
478	0.36
479	0.36
480	0.34
481	0.3
482	0.28
483	0.27
484	0.2
485	0.16
486	0.15
487	0.18
488	0.2
489	0.25
490	0.32
491	0.41
492	0.5
493	0.6
494	0.66
495	0.7
496	0.74
497	0.76
498	0.78
499	0.78
500	0.72
501	0.62
502	0.52
503	0.43
504	0.36
505	0.28
506	0.18
507	0.09
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.04
523	0.03
524	0.02
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.04
529	0.05
530	0.06
531	0.07
532	0.09
533	0.1
534	0.1
535	0.12
536	0.14
537	0.14
538	0.14
539	0.14
540	0.15
541	0.2
542	0.23
543	0.23
544	0.23
545	0.23
546	0.24
547	0.25
548	0.24
549	0.19
550	0.16
551	0.15
552	0.19
553	0.22
554	0.26
555	0.25
556	0.25
557	0.3
558	0.3
559	0.31
560	0.29
561	0.34
562	0.35
563	0.42
564	0.46
565	0.44
566	0.48
567	0.48
568	0.52
569	0.43
570	0.43
571	0.36
572	0.32
573	0.29
574	0.24
575	0.23
576	0.16
577	0.15
578	0.08
579	0.07
580	0.06
581	0.12
582	0.14
583	0.15
584	0.17
585	0.18
586	0.2
587	0.22
588	0.26
589	0.27
590	0.36
591	0.42
592	0.47
593	0.47
594	0.48
595	0.47
596	0.46
597	0.4
598	0.32
599	0.29
600	0.25
601	0.25
602	0.24
603	0.22
604	0.27
605	0.27
606	0.26
607	0.22
608	0.22
609	0.22
610	0.24
611	0.25
612	0.19
613	0.2
614	0.22
615	0.24
616	0.26
617	0.3
618	0.35
619	0.36
620	0.39
621	0.37
622	0.34
623	0.32
624	0.27
625	0.26
626	0.2
627	0.19
628	0.15
629	0.15
630	0.14
631	0.13
632	0.13
633	0.09
634	0.08
635	0.06
636	0.08
637	0.08
638	0.12
639	0.15
640	0.2
641	0.22
642	0.25
643	0.32
644	0.33
645	0.36
646	0.35
647	0.35
648	0.31
649	0.3
650	0.26
651	0.21
652	0.21
653	0.18
654	0.18
655	0.15
656	0.15
657	0.14
658	0.17
659	0.24
660	0.26
661	0.27
662	0.29
663	0.29
664	0.34
665	0.37
666	0.37
667	0.29
668	0.27
669	0.29
670	0.3
671	0.33
672	0.34
673	0.41
674	0.4
675	0.4
676	0.4
677	0.37
678	0.35
679	0.34
680	0.29
681	0.2
682	0.16
683	0.18
684	0.17
685	0.16
686	0.14
687	0.12
688	0.12
689	0.12
690	0.12
691	0.12
692	0.15
693	0.17
694	0.18
695	0.18
696	0.15
697	0.15
698	0.14
699	0.13
700	0.1
701	0.06
702	0.05
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.08
713	0.08
714	0.11
715	0.11
716	0.11
717	0.14
718	0.16
719	0.18
720	0.19
721	0.19
722	0.18
723	0.19
724	0.19
725	0.15
726	0.13
727	0.13
728	0.11
729	0.1
730	0.09
731	0.09
732	0.09
733	0.08
734	0.08
735	0.06
736	0.06
737	0.06
738	0.05
739	0.03
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.04
747	0.05
748	0.06
749	0.05
750	0.06
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.08
756	0.09
757	0.11
758	0.1
759	0.1
760	0.1
761	0.1
762	0.1
763	0.07
764	0.07
765	0.06
766	0.06
767	0.07
768	0.07
769	0.07
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.09
774	0.1
775	0.12
776	0.12
777	0.13
778	0.1
779	0.11
780	0.11
781	0.11
782	0.11
783	0.11
784	0.13
785	0.18
786	0.25
787	0.27
788	0.31
789	0.38
790	0.46
791	0.52
792	0.61
793	0.65
794	0.65
795	0.68
796	0.67
797	0.63
798	0.64
799	0.61
800	0.56
801	0.47
802	0.41
803	0.36
804	0.31
805	0.28
806	0.19
807	0.16
808	0.11
809	0.1
810	0.1
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.09
816	0.11
817	0.11
818	0.17
819	0.25
820	0.26
821	0.35
822	0.45
823	0.55
824	0.64
825	0.74
826	0.78
827	0.8
828	0.88
829	0.86
830	0.87
831	0.84
832	0.79
833	0.74
834	0.65
835	0.56
836	0.49
837	0.42
838	0.32
839	0.25
840	0.2
841	0.14
842	0.13
843	0.12
844	0.08
845	0.09
846	0.11
847	0.11
848	0.15
849	0.16
850	0.16
851	0.2
852	0.24
853	0.29
854	0.32
855	0.39
856	0.43
857	0.51
858	0.62
859	0.67
860	0.74
861	0.78
862	0.81
863	0.84
864	0.82
865	0.8
866	0.73
867	0.68
868	0.64
869	0.6
870	0.53
871	0.46
872	0.4
873	0.35
874	0.32
875	0.28
876	0.22
877	0.19
878	0.18
879	0.16
880	0.18
881	0.2
882	0.23
883	0.26
884	0.27
885	0.3
886	0.33
887	0.35
888	0.32
889	0.29
890	0.28
891	0.27
892	0.32
893	0.33
894	0.36
895	0.38
896	0.44
897	0.47
898	0.52
899	0.54
900	0.54
901	0.5
902	0.48
903	0.45
904	0.39
905	0.35
906	0.29
907	0.24
908	0.17
909	0.14
910	0.12
911	0.13
912	0.16
913	0.19
914	0.24
915	0.29
916	0.39
917	0.48
918	0.58
919	0.65
920	0.73
921	0.8
922	0.81
923	0.85
924	0.85
925	0.85
926	0.83
927	0.79
928	0.73
929	0.66
930	0.66
931	0.58
932	0.52
933	0.41
934	0.37
935	0.32
936	0.35
937	0.36
938	0.35
939	0.37
940	0.38
941	0.44
942	0.41
943	0.42
944	0.41
945	0.4
946	0.36
947	0.39
948	0.38
949	0.33
950	0.33
951	0.3
952	0.25
953	0.22
954	0.2
955	0.14
956	0.12
957	0.14
958	0.14
959	0.14
960	0.16
961	0.17
962	0.17
963	0.19
964	0.22
965	0.3
966	0.39
967	0.47
968	0.54
969	0.61
970	0.62
971	0.66
972	0.69
973	0.65
974	0.59
975	0.58
976	0.54
977	0.55
978	0.63
979	0.6
980	0.54
981	0.55
982	0.55
983	0.56
984	0.6
985	0.63
986	0.63
987	0.7
988	0.76
989	0.78
990	0.81
991	0.79
992	0.77
993	0.72
994	0.73
995	0.67
996	0.68
997	0.69
998	0.65
999	0.65
1000	0.68
1001	0.68
1002	0.66
1003	0.69
1004	0.66
1005	0.61
1006	0.59
1007	0.52
1008	0.42
1009	0.36
1010	0.28
1011	0.22
1012	0.17
1013	0.16
1014	0.15
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.16
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.17
1021	0.16
1022	0.17
1023	0.17
1024	0.19
1025	0.22
1026	0.26
1027	0.29
1028	0.36
1029	0.41
1030	0.44
1031	0.5
1032	0.51
1033	0.5
1034	0.48
1035	0.46
1036	0.44
1037	0.4
1038	0.37
1039	0.34
1040	0.33
1041	0.32
1042	0.34
1043	0.34
1044	0.28
1045	0.24
1046	0.23

S8ECM8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer