Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8DPC8

Protein Details
Accession S8DPC8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-119GETRAQWRERHDRERDRERNPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 7, mito_nucl 7, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025742  CSTF2_hinge  
IPR026896  CSTF_C  
IPR038192  CSTF_C_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF14327  CSTF2_hinge  
PF14304  CSTF_C  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12398  RRM_CSTF2_RNA15_like  
Amino Acid Sequences MSKVVFVGNIPYTIGEDQLIDVFKKVGEVVGFRLVYDRDTGKPKGYGFCEFSDHETAESAVRNLNGHDLGGRPLRIDLADSDPFLEGKTTVRGELLDGGETRAQWRERHDRERDRERNPNAFLQSLPTGVPIPPGSTALDTISTMLARADPSQILEVLAQMKAFVITHPDQARALLMAHPQLGYALFQALLLNNIVDPAILQRMLNATSGGPASQAKAPPPPPAAVPPMHQPAPQQAVHLPPLATPYSQGSMAQPPPYAHLAPSVPQTHTPVHHPTPPAPPPAAMYPPASAHLSHTQGQAPPYYRPPPMPGMPQVSTPAPPPPLAQQQPPSGAQAPPPPPALDPAQRDMLMQVLSLTQEQINSLPPTEREQIQQLRKQFGIAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.12
3 0.11
4 0.11
5 0.13
6 0.15
7 0.12
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.16
17 0.22
18 0.22
19 0.21
20 0.24
21 0.22
22 0.21
23 0.23
24 0.23
25 0.2
26 0.27
27 0.29
28 0.3
29 0.34
30 0.36
31 0.39
32 0.4
33 0.42
34 0.4
35 0.39
36 0.4
37 0.37
38 0.39
39 0.36
40 0.32
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.19
45 0.19
46 0.15
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.16
57 0.19
58 0.19
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.14
65 0.17
66 0.18
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.14
73 0.09
74 0.09
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.18
82 0.17
83 0.14
84 0.13
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.18
91 0.18
92 0.26
93 0.35
94 0.42
95 0.51
96 0.6
97 0.65
98 0.71
99 0.81
100 0.81
101 0.78
102 0.8
103 0.77
104 0.75
105 0.68
106 0.64
107 0.55
108 0.48
109 0.4
110 0.34
111 0.28
112 0.22
113 0.18
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.09
153 0.1
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.12
161 0.12
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.16
205 0.18
206 0.21
207 0.23
208 0.22
209 0.2
210 0.22
211 0.25
212 0.21
213 0.21
214 0.22
215 0.25
216 0.25
217 0.24
218 0.22
219 0.23
220 0.27
221 0.26
222 0.22
223 0.19
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.18
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.16
239 0.19
240 0.2
241 0.19
242 0.18
243 0.2
244 0.23
245 0.21
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.16
250 0.21
251 0.21
252 0.19
253 0.2
254 0.24
255 0.23
256 0.24
257 0.27
258 0.29
259 0.3
260 0.33
261 0.34
262 0.34
263 0.4
264 0.42
265 0.41
266 0.35
267 0.32
268 0.3
269 0.32
270 0.31
271 0.24
272 0.22
273 0.2
274 0.2
275 0.22
276 0.2
277 0.17
278 0.18
279 0.22
280 0.24
281 0.24
282 0.26
283 0.26
284 0.27
285 0.29
286 0.29
287 0.26
288 0.26
289 0.3
290 0.33
291 0.32
292 0.32
293 0.35
294 0.37
295 0.39
296 0.41
297 0.4
298 0.42
299 0.41
300 0.4
301 0.39
302 0.34
303 0.31
304 0.27
305 0.27
306 0.22
307 0.22
308 0.22
309 0.25
310 0.33
311 0.35
312 0.4
313 0.4
314 0.43
315 0.47
316 0.46
317 0.45
318 0.38
319 0.35
320 0.33
321 0.36
322 0.35
323 0.34
324 0.35
325 0.31
326 0.29
327 0.32
328 0.34
329 0.33
330 0.34
331 0.35
332 0.38
333 0.37
334 0.36
335 0.33
336 0.3
337 0.23
338 0.18
339 0.14
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.13
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.16
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.21
353 0.26
354 0.3
355 0.31
356 0.3
357 0.37
358 0.45
359 0.52
360 0.57
361 0.57
362 0.59
363 0.57