Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8DY15

Protein Details
Accession S8DY15    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-142SAKPAPRRTRSVSRGRPHTPRTRSMSRGRRSTPARGRKPTPSPEHydrophilic
281-304VPPAVPLKRPRGRPRKNPLPPAAAHydrophilic
366-387AAPPKRRGRPPGSKNRRKSEGDBasic
525-544ASSPRQQRGRGRPRKEEAKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-140AKPAPRRTRSVSRGRPHTPRTRSMSRGRRSTPARGRKPTPS
151-159ARTRKRGRS
287-385LKRPRGRPRKNPLPPAAAPAPGPVTAPAAKRPPGRPRIHPLPAPAHPLPPAPAPATTAPPAKRPPGRPRIHPLPAPAPDAAPPKRRGRPPGSKNRRKSE
528-568PRQQRGRGRPRKEEAKGKARAAAEEPPAKRQRTARSQSARR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MSESRVSSPTPEPGARAPVVPSSEDEIDPPARTTSIRVNGAKPSSARTKQNGAGRDELEEEDVAASAREEVRVWQDTYQDFRVPVPDDDDDDDDTPAPSAKPAPRRTRSVSRGRPHTPRTRSMSRGRRSTPARGRKPTPSPEVPLLDATPARTRKRGRSSTARIESGPTTTRRGRSASRPAATVAAPVPMILPGQPARVGPPRGVSKTRAASTARRASAPEALPSRSKSVGRPSSAHPATRTVLPSTHPAARIHAPVASGSATTATTTTTFRPNFGTNTAVPPAVPLKRPRGRPRKNPLPPAAAPAPGPVTAPAAKRPPGRPRIHPLPAPAHPLPPAPAPATTAPPAKRPPGRPRIHPLPAPAPDAAPPKRRGRPPGSKNRRKSEGDRPSTATAAEGPRAAGGYVRTMVDALEGRGSPSAKAPARATKMYVEIPRAPYALHSRARRINEEDEDERELPVAPYDEDDVYDDDYDDKDDDDGKDDDYEPQGTSTESVVERHGWVAFQTDEESDEETQVEAALSPRSASSPRQQRGRGRPRKEEAKGKARAAAEEPPAKRQRTARSQSARRSAPLPAPVPAAAPALTFVNVAGTTPVGSAKKQQQGGFYKFRVSLDAPARAAPPSTPVPVPARPPSSPAMMGGGPPSPGVPVYESVDRMYDDLAVMVARWRAARAEFRFKAAWVLWVAGEVLDEPFVRGAAQDVVDTVGMPFSTDRDTNTVTLSGLHAEIHLRCTCAKEWGRSMACGGRLSLSLNLRRAPLADAGQDGDALDELHVTLTVSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.34
4 0.3
5 0.29
6 0.3
7 0.28
8 0.27
9 0.26
10 0.28
11 0.26
12 0.25
13 0.25
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.2
18 0.19
19 0.19
20 0.22
21 0.26
22 0.32
23 0.39
24 0.41
25 0.42
26 0.49
27 0.52
28 0.52
29 0.44
30 0.42
31 0.44
32 0.48
33 0.52
34 0.5
35 0.55
36 0.57
37 0.63
38 0.63
39 0.58
40 0.57
41 0.51
42 0.47
43 0.42
44 0.36
45 0.32
46 0.25
47 0.2
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.12
58 0.18
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.27
63 0.3
64 0.35
65 0.37
66 0.33
67 0.3
68 0.29
69 0.32
70 0.31
71 0.29
72 0.28
73 0.26
74 0.26
75 0.28
76 0.29
77 0.27
78 0.25
79 0.24
80 0.2
81 0.18
82 0.16
83 0.14
84 0.12
85 0.1
86 0.16
87 0.22
88 0.31
89 0.41
90 0.51
91 0.56
92 0.63
93 0.7
94 0.74
95 0.77
96 0.78
97 0.79
98 0.78
99 0.81
100 0.81
101 0.82
102 0.8
103 0.82
104 0.77
105 0.76
106 0.75
107 0.74
108 0.74
109 0.75
110 0.76
111 0.74
112 0.77
113 0.72
114 0.72
115 0.7
116 0.73
117 0.74
118 0.74
119 0.76
120 0.75
121 0.77
122 0.77
123 0.8
124 0.77
125 0.75
126 0.7
127 0.66
128 0.63
129 0.61
130 0.53
131 0.46
132 0.38
133 0.32
134 0.27
135 0.24
136 0.25
137 0.29
138 0.31
139 0.36
140 0.42
141 0.49
142 0.59
143 0.65
144 0.65
145 0.69
146 0.75
147 0.79
148 0.8
149 0.72
150 0.62
151 0.57
152 0.5
153 0.43
154 0.39
155 0.3
156 0.3
157 0.32
158 0.35
159 0.35
160 0.38
161 0.4
162 0.44
163 0.52
164 0.55
165 0.52
166 0.5
167 0.48
168 0.46
169 0.41
170 0.33
171 0.23
172 0.15
173 0.13
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.16
185 0.22
186 0.24
187 0.22
188 0.27
189 0.32
190 0.36
191 0.39
192 0.38
193 0.39
194 0.44
195 0.44
196 0.42
197 0.39
198 0.4
199 0.46
200 0.51
201 0.45
202 0.39
203 0.39
204 0.37
205 0.41
206 0.36
207 0.33
208 0.27
209 0.28
210 0.3
211 0.3
212 0.32
213 0.28
214 0.28
215 0.27
216 0.34
217 0.39
218 0.39
219 0.4
220 0.41
221 0.48
222 0.49
223 0.48
224 0.39
225 0.36
226 0.34
227 0.35
228 0.33
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.25
233 0.24
234 0.26
235 0.25
236 0.24
237 0.26
238 0.28
239 0.28
240 0.24
241 0.21
242 0.18
243 0.15
244 0.16
245 0.12
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.22
260 0.23
261 0.24
262 0.24
263 0.26
264 0.19
265 0.22
266 0.23
267 0.19
268 0.17
269 0.16
270 0.19
271 0.18
272 0.21
273 0.21
274 0.3
275 0.36
276 0.46
277 0.55
278 0.62
279 0.69
280 0.76
281 0.82
282 0.84
283 0.86
284 0.87
285 0.82
286 0.78
287 0.69
288 0.64
289 0.55
290 0.45
291 0.36
292 0.28
293 0.24
294 0.16
295 0.16
296 0.1
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.16
301 0.19
302 0.23
303 0.27
304 0.33
305 0.4
306 0.47
307 0.51
308 0.53
309 0.58
310 0.63
311 0.63
312 0.59
313 0.54
314 0.5
315 0.48
316 0.49
317 0.4
318 0.33
319 0.29
320 0.27
321 0.24
322 0.19
323 0.19
324 0.13
325 0.12
326 0.13
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.2
331 0.19
332 0.23
333 0.25
334 0.29
335 0.34
336 0.39
337 0.47
338 0.52
339 0.56
340 0.57
341 0.64
342 0.66
343 0.65
344 0.6
345 0.54
346 0.49
347 0.48
348 0.44
349 0.35
350 0.27
351 0.25
352 0.29
353 0.28
354 0.28
355 0.31
356 0.35
357 0.41
358 0.45
359 0.5
360 0.53
361 0.6
362 0.64
363 0.71
364 0.75
365 0.79
366 0.83
367 0.82
368 0.8
369 0.74
370 0.7
371 0.7
372 0.69
373 0.65
374 0.59
375 0.56
376 0.5
377 0.45
378 0.39
379 0.28
380 0.2
381 0.16
382 0.14
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.15
407 0.15
408 0.17
409 0.19
410 0.24
411 0.28
412 0.28
413 0.28
414 0.24
415 0.26
416 0.27
417 0.27
418 0.24
419 0.23
420 0.25
421 0.25
422 0.23
423 0.21
424 0.19
425 0.22
426 0.25
427 0.28
428 0.27
429 0.31
430 0.37
431 0.4
432 0.41
433 0.4
434 0.38
435 0.36
436 0.39
437 0.35
438 0.32
439 0.34
440 0.3
441 0.26
442 0.21
443 0.18
444 0.13
445 0.12
446 0.1
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.09
479 0.1
480 0.09
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.12
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.09
502 0.07
503 0.07
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.08
511 0.1
512 0.13
513 0.21
514 0.3
515 0.36
516 0.43
517 0.5
518 0.58
519 0.67
520 0.75
521 0.77
522 0.74
523 0.78
524 0.79
525 0.82
526 0.8
527 0.79
528 0.76
529 0.76
530 0.74
531 0.66
532 0.63
533 0.54
534 0.49
535 0.42
536 0.39
537 0.34
538 0.35
539 0.35
540 0.38
541 0.44
542 0.43
543 0.44
544 0.45
545 0.49
546 0.52
547 0.59
548 0.6
549 0.64
550 0.71
551 0.76
552 0.78
553 0.71
554 0.62
555 0.57
556 0.51
557 0.45
558 0.44
559 0.37
560 0.3
561 0.29
562 0.27
563 0.26
564 0.23
565 0.19
566 0.13
567 0.11
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.17
584 0.25
585 0.31
586 0.36
587 0.38
588 0.43
589 0.5
590 0.56
591 0.58
592 0.51
593 0.48
594 0.46
595 0.44
596 0.39
597 0.33
598 0.34
599 0.32
600 0.35
601 0.32
602 0.31
603 0.32
604 0.28
605 0.27
606 0.19
607 0.19
608 0.17
609 0.19
610 0.18
611 0.21
612 0.25
613 0.28
614 0.33
615 0.36
616 0.38
617 0.36
618 0.39
619 0.38
620 0.37
621 0.34
622 0.29
623 0.25
624 0.2
625 0.2
626 0.18
627 0.16
628 0.13
629 0.12
630 0.11
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.11
636 0.14
637 0.17
638 0.18
639 0.18
640 0.19
641 0.19
642 0.17
643 0.15
644 0.12
645 0.09
646 0.08
647 0.08
648 0.06
649 0.06
650 0.08
651 0.08
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.12
656 0.16
657 0.25
658 0.3
659 0.4
660 0.4
661 0.44
662 0.45
663 0.43
664 0.44
665 0.36
666 0.33
667 0.23
668 0.24
669 0.19
670 0.18
671 0.18
672 0.12
673 0.12
674 0.08
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.08
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.09
692 0.08
693 0.07
694 0.08
695 0.07
696 0.08
697 0.12
698 0.13
699 0.15
700 0.19
701 0.22
702 0.22
703 0.24
704 0.23
705 0.19
706 0.2
707 0.18
708 0.15
709 0.13
710 0.12
711 0.11
712 0.13
713 0.14
714 0.18
715 0.19
716 0.19
717 0.19
718 0.23
719 0.24
720 0.31
721 0.36
722 0.38
723 0.42
724 0.5
725 0.51
726 0.48
727 0.51
728 0.46
729 0.44
730 0.38
731 0.34
732 0.26
733 0.24
734 0.25
735 0.27
736 0.29
737 0.31
738 0.34
739 0.35
740 0.35
741 0.35
742 0.34
743 0.31
744 0.29
745 0.26
746 0.24
747 0.23
748 0.24
749 0.23
750 0.22
751 0.19
752 0.14
753 0.11
754 0.09
755 0.08
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.07