Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8DT27

Protein Details
Accession S8DT27    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-248VSPSTPRRRPRGPKQVRSTLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-238RRPR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MLIFLATAMKDPQALAVLEQFIPWADLSAFTVIPHRVMFREQQKERSESVVLLTSGCKPLPEGWCLRGLGWGGKRVYPMGFWGKEANVEDHHNVEVEVPDKSEGGGQMDRIIEDEREENEAVNELGKRWVRVARAGLNIAKHVEGVLASKVAWWQEEERRAREEEEKRLRGRCWDEDSMDADDEDGLAAEDPADETEDDETDTPEIKALKDCRWYLQSLLDSSSQGHVSPSTPRRRPRGPKQVRSTLRVVPGYTTLVFDTNIHLSSLSIFSSLVECLQWTVVVPLPVIMELNGLASNASPLGEATTAASEYITSHIRSHSTSLKVQTSRGNYISSLNIRTEQVNFAGDEAPWERSMDDLILRAAIWQEEHWIDQSAMLQSDGVSRNTSSAAKVVLLSFDCMLRLKARSRQLSAANEQDMVSILTPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.15
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.08
13 0.09
14 0.11
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.16
19 0.15
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.2
25 0.29
26 0.34
27 0.44
28 0.47
29 0.54
30 0.59
31 0.61
32 0.6
33 0.56
34 0.47
35 0.37
36 0.35
37 0.31
38 0.25
39 0.22
40 0.21
41 0.2
42 0.21
43 0.2
44 0.17
45 0.15
46 0.21
47 0.24
48 0.28
49 0.29
50 0.29
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.29
55 0.27
56 0.28
57 0.27
58 0.32
59 0.28
60 0.3
61 0.31
62 0.29
63 0.28
64 0.22
65 0.24
66 0.26
67 0.25
68 0.25
69 0.27
70 0.25
71 0.28
72 0.3
73 0.27
74 0.21
75 0.24
76 0.24
77 0.23
78 0.23
79 0.19
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.14
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.18
116 0.21
117 0.21
118 0.25
119 0.29
120 0.29
121 0.31
122 0.33
123 0.32
124 0.29
125 0.29
126 0.25
127 0.21
128 0.15
129 0.12
130 0.09
131 0.07
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.12
142 0.18
143 0.26
144 0.3
145 0.31
146 0.33
147 0.34
148 0.35
149 0.4
150 0.4
151 0.42
152 0.48
153 0.52
154 0.52
155 0.55
156 0.53
157 0.51
158 0.51
159 0.46
160 0.43
161 0.4
162 0.38
163 0.36
164 0.38
165 0.32
166 0.27
167 0.21
168 0.14
169 0.11
170 0.1
171 0.07
172 0.05
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.12
195 0.14
196 0.17
197 0.22
198 0.23
199 0.24
200 0.26
201 0.26
202 0.23
203 0.25
204 0.23
205 0.18
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.15
217 0.22
218 0.3
219 0.36
220 0.41
221 0.48
222 0.57
223 0.66
224 0.69
225 0.73
226 0.75
227 0.79
228 0.81
229 0.85
230 0.8
231 0.75
232 0.68
233 0.61
234 0.55
235 0.47
236 0.39
237 0.3
238 0.27
239 0.24
240 0.2
241 0.16
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.05
297 0.06
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.2
306 0.24
307 0.26
308 0.29
309 0.33
310 0.39
311 0.38
312 0.4
313 0.42
314 0.41
315 0.42
316 0.39
317 0.36
318 0.29
319 0.3
320 0.33
321 0.3
322 0.27
323 0.24
324 0.24
325 0.24
326 0.24
327 0.24
328 0.2
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.13
335 0.15
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.15
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.18
362 0.16
363 0.16
364 0.15
365 0.13
366 0.11
367 0.18
368 0.2
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.19
373 0.21
374 0.22
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.15
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.17
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.17
390 0.21
391 0.26
392 0.33
393 0.42
394 0.49
395 0.53
396 0.58
397 0.62
398 0.64
399 0.64
400 0.63
401 0.56
402 0.49
403 0.44
404 0.38
405 0.31
406 0.24
407 0.18