Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8DQD9

Protein Details
Accession S8DQD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-228RPVSAAKPKARLRTKKGPKRIQKQQQRKVVTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-219PKAAKAATKAPAPKAAASQRPVSAAKPKARLRTKKGPKRIQK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MQARPVPARLHTYHSSKKQLLGNQTHAPPAWRTAPGATKKAAAGPAAAAVKGSKILLSQLPIDVAENEVEMLFTKTVGPVKDTFLVYNSQGKSKGMAVVTFALPGGAAVARTKYHGKIVDGRRPIKIEIIKDGDDAPSAAPAAPQKPLTLFDRIAQTPQSTPKTPAAQRAPTKAQQQPKAAKAATKAPAPKAAASQRPVSAAKPKARLRTKKGPKRIQKQQQRKVVTAEELDQEMEDYRASADAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.58
4 0.62
5 0.61
6 0.61
7 0.62
8 0.6
9 0.59
10 0.57
11 0.57
12 0.53
13 0.48
14 0.44
15 0.36
16 0.32
17 0.3
18 0.24
19 0.24
20 0.26
21 0.34
22 0.37
23 0.39
24 0.36
25 0.34
26 0.33
27 0.35
28 0.33
29 0.25
30 0.19
31 0.16
32 0.19
33 0.17
34 0.16
35 0.13
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.07
41 0.06
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.11
51 0.1
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.08
63 0.11
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.16
68 0.2
69 0.2
70 0.19
71 0.17
72 0.19
73 0.18
74 0.23
75 0.21
76 0.19
77 0.2
78 0.19
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.05
97 0.05
98 0.07
99 0.09
100 0.1
101 0.14
102 0.15
103 0.17
104 0.25
105 0.31
106 0.36
107 0.41
108 0.42
109 0.4
110 0.39
111 0.38
112 0.35
113 0.31
114 0.25
115 0.24
116 0.25
117 0.24
118 0.23
119 0.23
120 0.18
121 0.15
122 0.14
123 0.09
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.22
140 0.22
141 0.23
142 0.21
143 0.2
144 0.19
145 0.25
146 0.27
147 0.24
148 0.27
149 0.31
150 0.37
151 0.37
152 0.44
153 0.44
154 0.48
155 0.5
156 0.53
157 0.54
158 0.52
159 0.57
160 0.54
161 0.56
162 0.55
163 0.59
164 0.6
165 0.57
166 0.58
167 0.52
168 0.48
169 0.43
170 0.43
171 0.39
172 0.38
173 0.39
174 0.35
175 0.4
176 0.39
177 0.38
178 0.37
179 0.4
180 0.4
181 0.4
182 0.41
183 0.36
184 0.38
185 0.38
186 0.34
187 0.36
188 0.38
189 0.41
190 0.47
191 0.52
192 0.58
193 0.67
194 0.74
195 0.74
196 0.78
197 0.82
198 0.83
199 0.88
200 0.89
201 0.9
202 0.9
203 0.93
204 0.92
205 0.92
206 0.93
207 0.92
208 0.91
209 0.87
210 0.79
211 0.74
212 0.68
213 0.61
214 0.53
215 0.46
216 0.39
217 0.33
218 0.3
219 0.24
220 0.2
221 0.16
222 0.14
223 0.11
224 0.09
225 0.08