Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8EDT3

Protein Details
Accession S8EDT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-105DVEGKKTRKKKDPLAPKRPPSSYBasic
216-245SSDTSEPSPPPKKRREDHTKEKEKKKKTKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-101GKRKARGDVEGKKTRKKKDPLAPKRP
225-245PPKKRREDHTKEKEKKKKTKA
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 10.333, mito_nucl 5.833, mito 5.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAGHADAGQAAAQFEFMKMQFANSLGHVAQQLRDCAAVADQLAGSVTGMPYNPALMQPLMQYAMPAGLAVATTPTGKRKARGDVEGKKTRKKKDPLAPKRPPSSYLLFQNEVRSELKKTHPGMPNNELLGMIAKQWSEMSQGEKEKYENLQKAAKERYLEEKDVYQAGGSPATAVAAAMVCPIVVATPNATKAVVAAPATSTSDDEQSSEDEEGGSSDTSEPSPPPKKRREDHTKEKEKKKKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.1
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.15
9 0.17
10 0.14
11 0.17
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.16
16 0.18
17 0.2
18 0.2
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.15
23 0.14
24 0.12
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.05
35 0.06
36 0.07
37 0.06
38 0.07
39 0.08
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.04
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.06
61 0.1
62 0.17
63 0.18
64 0.22
65 0.27
66 0.35
67 0.39
68 0.45
69 0.51
70 0.54
71 0.62
72 0.68
73 0.67
74 0.67
75 0.69
76 0.7
77 0.7
78 0.69
79 0.69
80 0.69
81 0.77
82 0.79
83 0.83
84 0.85
85 0.82
86 0.81
87 0.72
88 0.65
89 0.58
90 0.52
91 0.45
92 0.43
93 0.4
94 0.36
95 0.35
96 0.36
97 0.31
98 0.28
99 0.25
100 0.2
101 0.16
102 0.18
103 0.2
104 0.24
105 0.26
106 0.32
107 0.37
108 0.4
109 0.44
110 0.44
111 0.43
112 0.36
113 0.34
114 0.26
115 0.19
116 0.16
117 0.11
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.11
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.22
134 0.27
135 0.25
136 0.26
137 0.29
138 0.29
139 0.34
140 0.36
141 0.35
142 0.29
143 0.28
144 0.35
145 0.35
146 0.36
147 0.31
148 0.29
149 0.28
150 0.27
151 0.25
152 0.15
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.2
210 0.3
211 0.38
212 0.47
213 0.55
214 0.65
215 0.71
216 0.8
217 0.83
218 0.83
219 0.86
220 0.88
221 0.89
222 0.9
223 0.94
224 0.93
225 0.92