Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8C1Q6

Protein Details
Accession S8C1Q6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
851-873NSPRIRSRYRDDRDSRRERDRERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
865-883SRRERDRERYREKEGDRDR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR002939  DnaJ_C  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR008971  HSP40/DnaJ_pept-bd  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0051082  F:unfolded protein binding  
GO:0006457  P:protein folding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01556  DnaJ_C  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50076  DNAJ_2  
PS51526  RFX_DBD  
CDD cd06257  DnaJ  
cd10747  DnaJ_C  
Amino Acid Sequences MSQSPEYDQFRHSPMPMAHPMQHVMQVPTAMHFSTSAYAADMASFGKTGPDAGSAFAAFQAAGARSRSVSQASPELQMSPGLDYDDYGNMMSQGMPGSKRQKQVDEHEDALRLLSLEVREQTLGELAGKVRQADGTSRAERERQGFGMGWLHKYCKRTNEETAAIPRNRVYTHYVTACGDARIKCLNPASFGKLVRIVFPDIKTRRLGIRGHSKYHYCGITLISGKEKMDEDLKNSVAIDPKVPILPSNNVGQDILSHDPEGGEWTALLHDSDPTLALTAKDDGKATAAALLETPIPADSNENESPDDLVNKMASFLTPAEEERPFGICVPDITQYMPAGTDMDNAKTLEATYRTHAVALFEAFKTMHMKMFYNLYTQFQGSFTAPVLKLLAEPSMVNWVEDTDWEIYKELLGLVNNCVKTAIPPKIFEQFKKLVSSLEDLVRKSLQPLPDHVIEARLRPVSAFCRLVDQALRTNMTCHAAASILNNDADVKTMESDWVKMVEAERIVRRELPCKSALAIQLLRTEIVNLVRGREPTALPGSQEVADENGIFENWIRWLDRLPSRFPEITARSFLIGTSAVASAAIRDITLSGGEGFGGWWVLVTFVEEYLRWNAERGGFLRRAASGPVQAAGTVVDTSAQASFFQRTGANLDGTDDSGISIRDDSYDSIMIGDKHSGVLDHQLHLTANKDDETAAEKFKDLSQAYEIISDVEKRKTYDQYGLDFILRGGGSSPSNDEKNDENVKNKDHPPPPPGGPSGTPKFRRHNTDGYAFQSSGAGIPHGTPSRTYTYSSRPGGGGYAGFDEFKIFNTFMASFGEDYGGGPPLYAGMGGMHSMPGSPMPRGEHMADGNSPRIRSRYRDDRDSRRERDRERYREKEGDRDRERGSERERERYASDTVNGRTIERDSYRDSTHRDGHRERDSKHGKSNGRAKDATVVERPLLISLEEIFKGVQKKLLIKRKAYDSDGKMVQEEKILDIAVRPGMKAGSKFKFTGVGDEISEGGMQDLHIILEEKPHERFHRDGDDLVTTLDITLKEALTGWSNKVVNIEGFSIPVAHAGPTPPNWSTTFPDHGMPKSKSKDRGNLVVKVNIKFPTTLTAEQKDKLKEIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.41
3 0.45
4 0.46
5 0.45
6 0.44
7 0.45
8 0.39
9 0.42
10 0.37
11 0.32
12 0.29
13 0.26
14 0.24
15 0.23
16 0.23
17 0.18
18 0.15
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.15
41 0.13
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.08
46 0.08
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.17
54 0.2
55 0.2
56 0.21
57 0.22
58 0.28
59 0.29
60 0.31
61 0.3
62 0.29
63 0.26
64 0.26
65 0.23
66 0.17
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.13
83 0.2
84 0.28
85 0.34
86 0.42
87 0.46
88 0.51
89 0.56
90 0.65
91 0.67
92 0.65
93 0.62
94 0.57
95 0.53
96 0.46
97 0.39
98 0.29
99 0.2
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.18
121 0.23
122 0.27
123 0.29
124 0.32
125 0.34
126 0.36
127 0.39
128 0.39
129 0.38
130 0.32
131 0.32
132 0.29
133 0.28
134 0.33
135 0.3
136 0.31
137 0.29
138 0.32
139 0.33
140 0.37
141 0.39
142 0.4
143 0.46
144 0.48
145 0.54
146 0.57
147 0.56
148 0.57
149 0.61
150 0.61
151 0.55
152 0.5
153 0.43
154 0.39
155 0.36
156 0.33
157 0.32
158 0.28
159 0.33
160 0.34
161 0.35
162 0.32
163 0.35
164 0.33
165 0.28
166 0.28
167 0.22
168 0.24
169 0.26
170 0.26
171 0.27
172 0.31
173 0.31
174 0.3
175 0.34
176 0.36
177 0.36
178 0.36
179 0.34
180 0.34
181 0.33
182 0.31
183 0.3
184 0.29
185 0.28
186 0.29
187 0.37
188 0.34
189 0.37
190 0.36
191 0.36
192 0.36
193 0.38
194 0.39
195 0.37
196 0.46
197 0.48
198 0.52
199 0.54
200 0.52
201 0.5
202 0.53
203 0.45
204 0.34
205 0.3
206 0.26
207 0.26
208 0.26
209 0.24
210 0.22
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.22
215 0.19
216 0.23
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.26
221 0.25
222 0.24
223 0.25
224 0.23
225 0.22
226 0.2
227 0.16
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.19
234 0.2
235 0.23
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.2
240 0.17
241 0.17
242 0.18
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.11
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.11
329 0.1
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.14
356 0.15
357 0.15
358 0.2
359 0.19
360 0.19
361 0.2
362 0.19
363 0.19
364 0.18
365 0.18
366 0.14
367 0.15
368 0.13
369 0.13
370 0.11
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.13
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.1
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.14
406 0.12
407 0.14
408 0.2
409 0.25
410 0.23
411 0.25
412 0.27
413 0.35
414 0.37
415 0.35
416 0.36
417 0.33
418 0.33
419 0.34
420 0.32
421 0.25
422 0.25
423 0.26
424 0.22
425 0.22
426 0.23
427 0.2
428 0.21
429 0.21
430 0.19
431 0.19
432 0.2
433 0.19
434 0.18
435 0.21
436 0.24
437 0.24
438 0.25
439 0.23
440 0.24
441 0.2
442 0.2
443 0.2
444 0.16
445 0.14
446 0.13
447 0.15
448 0.14
449 0.18
450 0.18
451 0.15
452 0.19
453 0.19
454 0.2
455 0.2
456 0.19
457 0.19
458 0.19
459 0.2
460 0.16
461 0.17
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.12
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.11
492 0.13
493 0.14
494 0.15
495 0.18
496 0.19
497 0.23
498 0.24
499 0.25
500 0.24
501 0.23
502 0.23
503 0.23
504 0.23
505 0.21
506 0.2
507 0.18
508 0.18
509 0.18
510 0.17
511 0.14
512 0.13
513 0.1
514 0.09
515 0.12
516 0.11
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.14
524 0.17
525 0.15
526 0.13
527 0.14
528 0.13
529 0.12
530 0.12
531 0.09
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.13
547 0.18
548 0.2
549 0.22
550 0.23
551 0.27
552 0.27
553 0.27
554 0.29
555 0.27
556 0.27
557 0.26
558 0.24
559 0.2
560 0.2
561 0.19
562 0.13
563 0.1
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.05
572 0.04
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.02
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.13
604 0.13
605 0.16
606 0.17
607 0.17
608 0.17
609 0.17
610 0.16
611 0.16
612 0.16
613 0.12
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.09
618 0.09
619 0.07
620 0.07
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.08
631 0.07
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.12
636 0.13
637 0.12
638 0.11
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.08
644 0.06
645 0.06
646 0.07
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.13
670 0.14
671 0.14
672 0.15
673 0.16
674 0.1
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.09
679 0.1
680 0.13
681 0.12
682 0.13
683 0.12
684 0.12
685 0.13
686 0.14
687 0.2
688 0.16
689 0.16
690 0.16
691 0.18
692 0.18
693 0.18
694 0.17
695 0.11
696 0.12
697 0.13
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.17
702 0.21
703 0.24
704 0.26
705 0.31
706 0.31
707 0.31
708 0.32
709 0.31
710 0.28
711 0.24
712 0.21
713 0.17
714 0.13
715 0.1
716 0.08
717 0.09
718 0.09
719 0.1
720 0.13
721 0.13
722 0.15
723 0.15
724 0.17
725 0.17
726 0.23
727 0.31
728 0.3
729 0.33
730 0.35
731 0.39
732 0.43
733 0.45
734 0.48
735 0.45
736 0.48
737 0.46
738 0.48
739 0.47
740 0.44
741 0.42
742 0.35
743 0.33
744 0.35
745 0.37
746 0.4
747 0.44
748 0.46
749 0.53
750 0.56
751 0.62
752 0.6
753 0.62
754 0.59
755 0.58
756 0.56
757 0.51
758 0.49
759 0.4
760 0.34
761 0.26
762 0.22
763 0.16
764 0.13
765 0.09
766 0.06
767 0.07
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.15
773 0.21
774 0.22
775 0.24
776 0.24
777 0.3
778 0.38
779 0.38
780 0.36
781 0.31
782 0.3
783 0.28
784 0.25
785 0.18
786 0.11
787 0.11
788 0.1
789 0.1
790 0.09
791 0.1
792 0.1
793 0.11
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.13
798 0.14
799 0.13
800 0.14
801 0.13
802 0.11
803 0.11
804 0.12
805 0.09
806 0.09
807 0.09
808 0.09
809 0.08
810 0.07
811 0.07
812 0.06
813 0.06
814 0.06
815 0.05
816 0.04
817 0.04
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.08
825 0.09
826 0.09
827 0.11
828 0.14
829 0.16
830 0.2
831 0.21
832 0.21
833 0.21
834 0.23
835 0.23
836 0.23
837 0.26
838 0.25
839 0.24
840 0.23
841 0.26
842 0.27
843 0.3
844 0.37
845 0.43
846 0.47
847 0.57
848 0.64
849 0.7
850 0.78
851 0.82
852 0.8
853 0.79
854 0.81
855 0.76
856 0.79
857 0.79
858 0.79
859 0.79
860 0.79
861 0.77
862 0.78
863 0.75
864 0.74
865 0.73
866 0.73
867 0.67
868 0.66
869 0.6
870 0.58
871 0.58
872 0.55
873 0.52
874 0.51
875 0.5
876 0.54
877 0.54
878 0.5
879 0.49
880 0.45
881 0.43
882 0.36
883 0.35
884 0.32
885 0.31
886 0.33
887 0.31
888 0.28
889 0.27
890 0.25
891 0.28
892 0.24
893 0.26
894 0.27
895 0.3
896 0.34
897 0.36
898 0.4
899 0.4
900 0.46
901 0.49
902 0.52
903 0.53
904 0.58
905 0.64
906 0.66
907 0.61
908 0.64
909 0.66
910 0.63
911 0.67
912 0.67
913 0.62
914 0.64
915 0.72
916 0.69
917 0.67
918 0.63
919 0.55
920 0.54
921 0.52
922 0.48
923 0.43
924 0.37
925 0.3
926 0.3
927 0.29
928 0.22
929 0.19
930 0.14
931 0.11
932 0.1
933 0.13
934 0.12
935 0.12
936 0.11
937 0.14
938 0.18
939 0.18
940 0.21
941 0.21
942 0.3
943 0.39
944 0.49
945 0.53
946 0.56
947 0.61
948 0.66
949 0.69
950 0.66
951 0.65
952 0.6
953 0.6
954 0.58
955 0.52
956 0.44
957 0.4
958 0.35
959 0.29
960 0.25
961 0.19
962 0.16
963 0.15
964 0.14
965 0.13
966 0.15
967 0.15
968 0.15
969 0.13
970 0.13
971 0.15
972 0.18
973 0.22
974 0.29
975 0.3
976 0.34
977 0.35
978 0.35
979 0.41
980 0.38
981 0.4
982 0.35
983 0.31
984 0.27
985 0.28
986 0.26
987 0.19
988 0.19
989 0.12
990 0.09
991 0.07
992 0.06
993 0.06
994 0.06
995 0.05
996 0.06
997 0.08
998 0.08
999 0.13
1000 0.16
1001 0.18
1002 0.21
1003 0.27
1004 0.31
1005 0.34
1006 0.37
1007 0.39
1008 0.45
1009 0.44
1010 0.44
1011 0.41
1012 0.4
1013 0.35
1014 0.32
1015 0.25
1016 0.16
1017 0.14
1018 0.15
1019 0.11
1020 0.1
1021 0.12
1022 0.11
1023 0.11
1024 0.12
1025 0.13
1026 0.16
1027 0.19
1028 0.19
1029 0.24
1030 0.25
1031 0.25
1032 0.27
1033 0.28
1034 0.24
1035 0.23
1036 0.24
1037 0.17
1038 0.17
1039 0.17
1040 0.16
1041 0.13
1042 0.13
1043 0.12
1044 0.09
1045 0.1
1046 0.12
1047 0.16
1048 0.18
1049 0.23
1050 0.22
1051 0.25
1052 0.26
1053 0.29
1054 0.33
1055 0.35
1056 0.38
1057 0.35
1058 0.39
1059 0.41
1060 0.44
1061 0.49
1062 0.48
1063 0.51
1064 0.54
1065 0.6
1066 0.64
1067 0.69
1068 0.72
1069 0.71
1070 0.77
1071 0.74
1072 0.73
1073 0.7
1074 0.68
1075 0.65
1076 0.57
1077 0.54
1078 0.47
1079 0.42
1080 0.35
1081 0.31
1082 0.3
1083 0.31
1084 0.35
1085 0.38
1086 0.42
1087 0.45
1088 0.48
1089 0.54
1090 0.51