Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8BGM2

Protein Details
Accession S8BGM2    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-25DETPASPRPPRRRNLAGNAGGRHydrophilic
58-78ASSSRPSQPRQSQPPASPRNIHydrophilic
749-768AQLLSKRKALRKKLNDPAATHydrophilic
993-1019ANILRRDMTLKKRKAKAYMERQKQQGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-15RR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MQLDETPASPRPPRRRNLAGNAGGRRVEGDPEFRRPSRGDNSASKLYDHRSDSIKPAASSSRPSQPRQSQPPASPRNIPQRPYQRPSVPPGQPGAPVLLRKPGALPPPPTQSAPTFTSPPPSSNTNVPPQLHDEDEPEPQPELILQPETRPISQEQLVAEVKGIYAGLVMVEAKCIEVDSKQAAAATQGGVKDAPRLNNDQWQALIALHRTLLHEHHDFFLASQHPSAAPSLRKLATKYAMPARMWRHGIHSFLELLRHRLPDSFEHMLAFIYLAYSMMALLYETVPAFADTWVECLGDLGRYRMAIEEGDPRDREVWMNVSRFWYSKGTDRQPHVGRLYHHLAILARPNILQQLFFYCKALAVSQPFSAARESILTLFDPTALKEQDIEGNQSADAVFVLLHSICFTLVNQDAFAEKKGEYLDLLESKIKVLKLKFKIPGAHIAICGISSLFQYNLKEGRMKMSTTMKENQKATSDAEAAYKAAQAQKSEPDNTLPPGAVIDNYDPKMALSVPLPELDPSVNHDISLSHAQELAFDILSLAFDRGADAACQPHIHIWLVFLDYLKQYPEGMALIVKNFPWEQMTQYATDLLKKRKNDEAAMARIHDSNIFPVVQKGFRPLPEEYMLRGLEIARRYFPYGYFSKIQVDDDERLIELPSMNLVREEKILWLMVRFAAYGPWIKYDAARLSFSVSAELKSLLQEYTLQPSYNQEPLTAMEDSDVDMEMSPATLADEDDESSVDEIDHPELAQLLSKRKALRKKLNDPAATVEEEKQAKKPAPFSSESFKPGFTTVVVDTNSLVKHLDTFKKMLDSNQWNIVLPYSVVTELRGLQRNDGKVSLTSELALNLLSQALQEKRNLRIITAKGSTIASLSGQFYELIDDYYEDGRKNLDDIIIETAKSQGVISESRASSPGVKPVVLITDDAVMRVKAVTRGVASVATKQWIKYISPPDEATQRKIANTYHSLMIKNPTYNQDHVYKAARDAAGDESSAANILRRDMTLKKRKAKAYMERQKQQGLIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.74
3 0.79
4 0.82
5 0.82
6 0.8
7 0.79
8 0.77
9 0.72
10 0.62
11 0.52
12 0.45
13 0.35
14 0.31
15 0.26
16 0.3
17 0.31
18 0.39
19 0.47
20 0.45
21 0.49
22 0.46
23 0.51
24 0.51
25 0.53
26 0.52
27 0.53
28 0.59
29 0.62
30 0.61
31 0.55
32 0.5
33 0.48
34 0.48
35 0.44
36 0.41
37 0.38
38 0.4
39 0.43
40 0.47
41 0.46
42 0.39
43 0.4
44 0.42
45 0.4
46 0.43
47 0.43
48 0.45
49 0.47
50 0.51
51 0.57
52 0.61
53 0.68
54 0.71
55 0.76
56 0.74
57 0.76
58 0.82
59 0.8
60 0.75
61 0.72
62 0.7
63 0.72
64 0.71
65 0.65
66 0.65
67 0.67
68 0.73
69 0.71
70 0.72
71 0.69
72 0.67
73 0.72
74 0.72
75 0.66
76 0.6
77 0.58
78 0.52
79 0.45
80 0.41
81 0.38
82 0.32
83 0.29
84 0.26
85 0.3
86 0.28
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.33
91 0.37
92 0.41
93 0.4
94 0.47
95 0.49
96 0.48
97 0.46
98 0.41
99 0.4
100 0.39
101 0.37
102 0.34
103 0.32
104 0.39
105 0.37
106 0.36
107 0.35
108 0.34
109 0.34
110 0.37
111 0.42
112 0.41
113 0.46
114 0.45
115 0.44
116 0.46
117 0.46
118 0.41
119 0.37
120 0.33
121 0.28
122 0.32
123 0.3
124 0.26
125 0.23
126 0.2
127 0.19
128 0.16
129 0.15
130 0.13
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.23
135 0.25
136 0.25
137 0.26
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.29
142 0.23
143 0.26
144 0.27
145 0.24
146 0.23
147 0.17
148 0.15
149 0.12
150 0.12
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.17
180 0.19
181 0.22
182 0.24
183 0.3
184 0.32
185 0.39
186 0.4
187 0.35
188 0.32
189 0.28
190 0.26
191 0.2
192 0.2
193 0.14
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.18
201 0.2
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.19
207 0.22
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.23
219 0.25
220 0.27
221 0.28
222 0.33
223 0.32
224 0.32
225 0.35
226 0.37
227 0.4
228 0.39
229 0.43
230 0.42
231 0.45
232 0.46
233 0.41
234 0.4
235 0.37
236 0.39
237 0.34
238 0.3
239 0.25
240 0.23
241 0.28
242 0.22
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.26
249 0.24
250 0.3
251 0.29
252 0.26
253 0.25
254 0.24
255 0.22
256 0.19
257 0.16
258 0.08
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.17
296 0.19
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.23
301 0.23
302 0.22
303 0.16
304 0.2
305 0.22
306 0.23
307 0.23
308 0.25
309 0.26
310 0.25
311 0.26
312 0.23
313 0.2
314 0.26
315 0.33
316 0.39
317 0.44
318 0.47
319 0.53
320 0.53
321 0.57
322 0.52
323 0.47
324 0.41
325 0.41
326 0.42
327 0.35
328 0.31
329 0.27
330 0.24
331 0.22
332 0.26
333 0.2
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.1
341 0.15
342 0.18
343 0.18
344 0.19
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.13
350 0.13
351 0.15
352 0.14
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.15
375 0.16
376 0.18
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.09
383 0.07
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.24
421 0.28
422 0.34
423 0.37
424 0.39
425 0.42
426 0.4
427 0.45
428 0.4
429 0.37
430 0.3
431 0.27
432 0.23
433 0.19
434 0.17
435 0.09
436 0.05
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.12
444 0.13
445 0.15
446 0.14
447 0.18
448 0.18
449 0.18
450 0.2
451 0.25
452 0.26
453 0.28
454 0.35
455 0.35
456 0.39
457 0.4
458 0.37
459 0.32
460 0.32
461 0.29
462 0.24
463 0.2
464 0.16
465 0.16
466 0.14
467 0.12
468 0.11
469 0.09
470 0.08
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.16
476 0.19
477 0.2
478 0.2
479 0.19
480 0.19
481 0.2
482 0.19
483 0.14
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.09
508 0.13
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.14
514 0.18
515 0.15
516 0.11
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.13
521 0.11
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.16
575 0.15
576 0.19
577 0.22
578 0.26
579 0.3
580 0.31
581 0.34
582 0.38
583 0.41
584 0.38
585 0.4
586 0.4
587 0.39
588 0.38
589 0.36
590 0.31
591 0.27
592 0.26
593 0.19
594 0.13
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.09
599 0.11
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.16
604 0.17
605 0.18
606 0.22
607 0.21
608 0.23
609 0.25
610 0.25
611 0.22
612 0.24
613 0.22
614 0.18
615 0.18
616 0.14
617 0.14
618 0.16
619 0.16
620 0.14
621 0.15
622 0.17
623 0.18
624 0.18
625 0.19
626 0.18
627 0.21
628 0.22
629 0.21
630 0.23
631 0.23
632 0.24
633 0.21
634 0.23
635 0.2
636 0.19
637 0.18
638 0.15
639 0.14
640 0.13
641 0.12
642 0.08
643 0.06
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.1
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.11
665 0.11
666 0.12
667 0.13
668 0.13
669 0.14
670 0.18
671 0.21
672 0.2
673 0.2
674 0.19
675 0.2
676 0.21
677 0.21
678 0.2
679 0.16
680 0.14
681 0.14
682 0.14
683 0.12
684 0.11
685 0.12
686 0.08
687 0.08
688 0.1
689 0.11
690 0.16
691 0.17
692 0.17
693 0.16
694 0.2
695 0.23
696 0.24
697 0.23
698 0.17
699 0.17
700 0.18
701 0.21
702 0.18
703 0.14
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.1
708 0.09
709 0.06
710 0.05
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.05
720 0.06
721 0.06
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.1
737 0.12
738 0.16
739 0.19
740 0.24
741 0.29
742 0.36
743 0.45
744 0.52
745 0.6
746 0.65
747 0.72
748 0.78
749 0.83
750 0.77
751 0.7
752 0.65
753 0.57
754 0.49
755 0.41
756 0.32
757 0.29
758 0.3
759 0.29
760 0.27
761 0.29
762 0.31
763 0.32
764 0.36
765 0.36
766 0.39
767 0.42
768 0.42
769 0.44
770 0.44
771 0.45
772 0.4
773 0.35
774 0.3
775 0.27
776 0.25
777 0.18
778 0.17
779 0.14
780 0.18
781 0.18
782 0.17
783 0.16
784 0.18
785 0.18
786 0.15
787 0.14
788 0.09
789 0.13
790 0.19
791 0.25
792 0.25
793 0.27
794 0.28
795 0.33
796 0.34
797 0.33
798 0.36
799 0.36
800 0.37
801 0.42
802 0.41
803 0.36
804 0.36
805 0.33
806 0.24
807 0.18
808 0.15
809 0.1
810 0.1
811 0.09
812 0.1
813 0.1
814 0.13
815 0.19
816 0.25
817 0.24
818 0.29
819 0.34
820 0.37
821 0.38
822 0.36
823 0.31
824 0.27
825 0.29
826 0.25
827 0.2
828 0.17
829 0.15
830 0.14
831 0.13
832 0.11
833 0.08
834 0.06
835 0.06
836 0.05
837 0.05
838 0.09
839 0.12
840 0.14
841 0.2
842 0.23
843 0.27
844 0.35
845 0.36
846 0.33
847 0.38
848 0.38
849 0.41
850 0.39
851 0.35
852 0.29
853 0.29
854 0.28
855 0.2
856 0.18
857 0.11
858 0.11
859 0.12
860 0.11
861 0.11
862 0.11
863 0.1
864 0.12
865 0.12
866 0.11
867 0.1
868 0.1
869 0.11
870 0.15
871 0.17
872 0.14
873 0.14
874 0.15
875 0.15
876 0.16
877 0.15
878 0.13
879 0.12
880 0.14
881 0.2
882 0.19
883 0.19
884 0.18
885 0.18
886 0.16
887 0.16
888 0.14
889 0.08
890 0.11
891 0.12
892 0.15
893 0.22
894 0.22
895 0.23
896 0.24
897 0.24
898 0.26
899 0.27
900 0.3
901 0.25
902 0.25
903 0.24
904 0.24
905 0.27
906 0.22
907 0.21
908 0.14
909 0.17
910 0.17
911 0.17
912 0.17
913 0.13
914 0.12
915 0.13
916 0.14
917 0.13
918 0.14
919 0.16
920 0.16
921 0.17
922 0.18
923 0.21
924 0.2
925 0.22
926 0.23
927 0.25
928 0.25
929 0.24
930 0.27
931 0.27
932 0.28
933 0.31
934 0.39
935 0.4
936 0.43
937 0.45
938 0.44
939 0.51
940 0.52
941 0.49
942 0.47
943 0.44
944 0.4
945 0.42
946 0.41
947 0.4
948 0.42
949 0.4
950 0.38
951 0.39
952 0.38
953 0.37
954 0.42
955 0.39
956 0.37
957 0.38
958 0.39
959 0.42
960 0.43
961 0.45
962 0.43
963 0.41
964 0.42
965 0.44
966 0.39
967 0.36
968 0.4
969 0.36
970 0.3
971 0.3
972 0.29
973 0.24
974 0.23
975 0.21
976 0.15
977 0.15
978 0.15
979 0.13
980 0.12
981 0.11
982 0.14
983 0.14
984 0.15
985 0.19
986 0.26
987 0.37
988 0.45
989 0.54
990 0.62
991 0.69
992 0.75
993 0.8
994 0.82
995 0.83
996 0.83
997 0.84
998 0.85
999 0.85
1000 0.83
1001 0.79