Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S8BGM2

Protein Details
Accession S8BGM2    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-25DETPASPRPPRRRNLAGNAGGRHydrophilic
58-78ASSSRPSQPRQSQPPASPRNIHydrophilic
749-768AQLLSKRKALRKKLNDPAATHydrophilic
993-1019ANILRRDMTLKKRKAKAYMERQKQQGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-15RR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MQLDETPASPRPPRRRNLAGNAGGRRVEGDPEFRRPSRGDNSASKLYDHRSDSIKPAASSSRPSQPRQSQPPASPRNIPQRPYQRPSVPPGQPGAPVLLRKPGALPPPPTQSAPTFTSPPPSSNTNVPPQLHDEDEPEPQPELILQPETRPISQEQLVAEVKGIYAGLVMVEAKCIEVDSKQAAAATQGGVKDAPRLNNDQWQALIALHRTLLHEHHDFFLASQHPSAAPSLRKLATKYAMPARMWRHGIHSFLELLRHRLPDSFEHMLAFIYLAYSMMALLYETVPAFADTWVECLGDLGRYRMAIEEGDPRDREVWMNVSRFWYSKGTDRQPHVGRLYHHLAILARPNILQQLFFYCKALAVSQPFSAARESILTLFDPTALKEQDIEGNQSADAVFVLLHSICFTLVNQDAFAEKKGEYLDLLESKIKVLKLKFKIPGAHIAICGISSLFQYNLKEGRMKMSTTMKENQKATSDAEAAYKAAQAQKSEPDNTLPPGAVIDNYDPKMALSVPLPELDPSVNHDISLSHAQELAFDILSLAFDRGADAACQPHIHIWLVFLDYLKQYPEGMALIVKNFPWEQMTQYATDLLKKRKNDEAAMARIHDSNIFPVVQKGFRPLPEEYMLRGLEIARRYFPYGYFSKIQVDDDERLIELPSMNLVREEKILWLMVRFAAYGPWIKYDAARLSFSVSAELKSLLQEYTLQPSYNQEPLTAMEDSDVDMEMSPATLADEDDESSVDEIDHPELAQLLSKRKALRKKLNDPAATVEEEKQAKKPAPFSSESFKPGFTTVVVDTNSLVKHLDTFKKMLDSNQWNIVLPYSVVTELRGLQRNDGKVSLTSELALNLLSQALQEKRNLRIITAKGSTIASLSGQFYELIDDYYEDGRKNLDDIIIETAKSQGVISESRASSPGVKPVVLITDDAVMRVKAVTRGVASVATKQWIKYISPPDEATQRKIANTYHSLMIKNPTYNQDHVYKAARDAAGDESSAANILRRDMTLKKRKAKAYMERQKQQGLIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.74
3 0.79
4 0.82
5 0.82
6 0.8
7 0.79
8 0.77
9 0.72
10 0.62
11 0.52
12 0.45
13 0.35
14 0.31
15 0.26
16 0.3
17 0.31
18 0.39
19 0.47
20 0.45
21 0.49
22 0.46
23 0.51
24 0.51
25 0.53
26 0.52
27 0.53
28 0.59
29 0.62
30 0.61
31 0.55
32 0.5
33 0.48
34 0.48
35 0.44
36 0.41
37 0.38
38 0.4
39 0.43
40 0.47
41 0.46
42 0.39
43 0.4
44 0.42
45 0.4
46 0.43
47 0.43
48 0.45
49 0.47
50 0.51
51 0.57
52 0.61
53 0.68
54 0.71
55 0.76
56 0.74
57 0.76
58 0.82
59 0.8
60 0.75
61 0.72
62 0.7
63 0.72
64 0.71
65 0.65
66 0.65
67 0.67
68 0.73
69 0.71
70 0.72
71 0.69
72 0.67
73 0.72
74 0.72
75 0.66
76 0.6
77 0.58
78 0.52
79 0.45
80 0.41
81 0.38
82 0.32
83 0.29
84 0.26
85 0.3
86 0.28
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.33
91 0.37
92 0.41
93 0.4
94 0.47
95 0.49
96 0.48
97 0.46
98 0.41
99 0.4
100 0.39
101 0.37
102 0.34
103 0.32
104 0.39
105 0.37
106 0.36
107 0.35
108 0.34
109 0.34
110 0.37
111 0.42
112 0.41
113 0.46
114 0.45
115 0.44
116 0.46
117 0.46
118 0.41
119 0.37
120 0.33
121 0.28
122 0.32
123 0.3
124 0.26
125 0.23
126 0.2
127 0.19
128 0.16
129 0.15
130 0.13
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.23
135 0.25
136 0.25
137 0.26
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.29
142 0.23
143 0.26
144 0.27
145 0.24
146 0.23
147 0.17
148 0.15
149 0.12
150 0.12
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.17
180 0.19
181 0.22
182 0.24
183 0.3
184 0.32
185 0.39
186 0.4
187 0.35
188 0.32
189 0.28
190 0.26
191 0.2
192 0.2
193 0.14
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.18
201 0.2
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.19
207 0.22
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.23
219 0.25
220 0.27
221 0.28
222 0.33
223 0.32
224 0.32
225 0.35
226 0.37
227 0.4
228 0.39
229 0.43
230 0.42
231 0.45
232 0.46
233 0.41
234 0.4
235 0.37
236 0.39
237 0.34
238 0.3
239 0.25
240 0.23
241 0.28
242 0.22
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.26
249 0.24
250 0.3
251 0.29
252 0.26
253 0.25
254 0.24
255 0.22
256 0.19
257 0.16
258 0.08
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.17
296 0.19
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.23
301 0.23
302 0.22
303 0.16
304 0.2
305 0.22
306 0.23
307 0.23
308 0.25
309 0.26
310 0.25
311 0.26
312 0.23
313 0.2
314 0.26
315 0.33
316 0.39
317 0.44
318 0.47
319 0.53
320 0.53
321 0.57
322 0.52
323 0.47
324 0.41
325 0.41
326 0.42
327 0.35
328 0.31
329 0.27
330 0.24
331 0.22
332 0.26
333 0.2
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.1
341 0.15
342 0.18
343 0.18
344 0.19
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.13
350 0.13
351 0.15
352 0.14
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.15
375 0.16
376 0.18
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.09
383 0.07
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.24
421 0.28
422 0.34
423 0.37
424 0.39
425 0.42
426 0.4
427 0.45
428 0.4
429 0.37
430 0.3
431 0.27
432 0.23
433 0.19
434 0.17
435 0.09
436 0.05
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.07
441 0.08
442 0.1
443 0.12
444 0.13
445 0.15
446 0.14
447 0.18
448 0.18
449 0.18
450 0.2
451 0.25
452 0.26
453 0.28
454 0.35
455 0.35
456 0.39
457 0.4
458 0.37
459 0.32
460 0.32
461 0.29
462 0.24
463 0.2
464 0.16
465 0.16
466 0.14
467 0.12
468 0.11
469 0.09
470 0.08
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.16
476 0.19
477 0.2
478 0.2
479 0.19
480 0.19
481 0.2
482 0.19
483 0.14
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.09
508 0.13
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.14
514 0.18
515 0.15
516 0.11
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.13
521 0.11
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.16
575 0.15
576 0.19
577 0.22
578 0.26
579 0.3
580 0.31
581 0.34
582 0.38
583 0.41
584 0.38
585 0.4
586 0.4
587 0.39
588 0.38
589 0.36
590 0.31
591 0.27
592 0.26
593 0.19
594 0.13
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.09
599 0.11
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.16
604 0.17
605 0.18
606 0.22
607 0.21
608 0.23
609 0.25
610 0.25
611 0.22
612 0.24
613 0.22
614 0.18
615 0.18
616 0.14
617 0.14
618 0.16
619 0.16
620 0.14
621 0.15
622 0.17
623 0.18
624 0.18
625 0.19
626 0.18
627 0.21
628 0.22
629 0.21
630 0.23
631 0.23
632 0.24
633 0.21
634 0.23
635 0.2
636 0.19
637 0.18
638 0.15
639 0.14
640 0.13
641 0.12
642 0.08
643 0.06
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.1
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.11
665 0.11
666 0.12
667 0.13
668 0.13
669 0.14
670 0.18
671 0.21
672 0.2
673 0.2
674 0.19
675 0.2
676 0.21
677 0.21
678 0.2
679 0.16
680 0.14
681 0.14
682 0.14
683 0.12
684 0.11
685 0.12
686 0.08
687 0.08
688 0.1
689 0.11
690 0.16
691 0.17
692 0.17
693 0.16
694 0.2
695 0.23
696 0.24
697 0.23
698 0.17
699 0.17
700 0.18
701 0.21
702 0.18
703 0.14
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.1
708 0.09
709 0.06
710 0.05
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.05
720 0.06
721 0.06
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.1
737 0.12
738 0.16
739 0.19
740 0.24
741 0.29
742 0.36
743 0.45
744 0.52
745 0.6
746 0.65
747 0.72
748 0.78
749 0.83
750 0.77
751 0.7
752 0.65
753 0.57
754 0.49
755 0.41
756 0.32
757 0.29
758 0.3
759 0.29
760 0.27
761 0.29
762 0.31
763 0.32
764 0.36
765 0.36
766 0.39
767 0.42
768 0.42
769 0.44
770 0.44
771 0.45
772 0.4
773 0.35
774 0.3
775 0.27
776 0.25
777 0.18
778 0.17
779 0.14
780 0.18
781 0.18
782 0.17
783 0.16
784 0.18
785 0.18
786 0.15
787 0.14
788 0.09
789 0.13
790 0.19
791 0.25
792 0.25
793 0.27
794 0.28
795 0.33
796 0.34
797 0.33
798 0.36
799 0.36
800 0.37
801 0.42
802 0.41
803 0.36
804 0.36
805 0.33
806 0.24
807 0.18
808 0.15
809 0.1
810 0.1
811 0.09
812 0.1
813 0.1
814 0.13
815 0.19
816 0.25
817 0.24
818 0.29
819 0.34
820 0.37
821 0.38
822 0.36
823 0.31
824 0.27
825 0.29
826 0.25
827 0.2
828 0.17
829 0.15
830 0.14
831 0.13
832 0.11
833 0.08
834 0.06
835 0.06
836 0.05
837 0.05
838 0.09
839 0.12
840 0.14
841 0.2
842 0.23
843 0.27
844 0.35
845 0.36
846 0.33
847 0.38
848 0.38
849 0.41
850 0.39
851 0.35
852 0.29
853 0.29
854 0.28
855 0.2
856 0.18
857 0.11
858 0.11
859 0.12
860 0.11
861 0.11
862 0.11
863 0.1
864 0.12
865 0.12
866 0.11
867 0.1
868 0.1
869 0.11
870 0.15
871 0.17
872 0.14
873 0.14
874 0.15
875 0.15
876 0.16
877 0.15
878 0.13
879 0.12
880 0.14
881 0.2
882 0.19
883 0.19
884 0.18
885 0.18
886 0.16
887 0.16
888 0.14
889 0.08
890 0.11
891 0.12
892 0.15
893 0.22
894 0.22
895 0.23
896 0.24
897 0.24
898 0.26
899 0.27
900 0.3
901 0.25
902 0.25
903 0.24
904 0.24
905 0.27
906 0.22
907 0.21
908 0.14
909 0.17
910 0.17
911 0.17
912 0.17
913 0.13
914 0.12
915 0.13
916 0.14
917 0.13
918 0.14
919 0.16
920 0.16
921 0.17
922 0.18
923 0.21
924 0.2
925 0.22
926 0.23
927 0.25
928 0.25
929 0.24
930 0.27
931 0.27
932 0.28
933 0.31
934 0.39
935 0.4
936 0.43
937 0.45
938 0.44
939 0.51
940 0.52
941 0.49
942 0.47
943 0.44
944 0.4
945 0.42
946 0.41
947 0.4
948 0.42
949 0.4
950 0.38
951 0.39
952 0.38
953 0.37
954 0.42
955 0.39
956 0.37
957 0.38
958 0.39
959 0.42
960 0.43
961 0.45
962 0.43
963 0.41
964 0.42
965 0.44
966 0.39
967 0.36
968 0.4
969 0.36
970 0.3
971 0.3
972 0.29
973 0.24
974 0.23
975 0.21
976 0.15
977 0.15
978 0.15
979 0.13
980 0.12
981 0.11
982 0.14
983 0.14
984 0.15
985 0.19
986 0.26
987 0.37
988 0.45
989 0.54
990 0.62
991 0.69
992 0.75
993 0.8
994 0.82
995 0.83
996 0.83
997 0.84
998 0.85
999 0.85
1000 0.83
1001 0.79