Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8A842

Protein Details
Accession S8A842    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-194PVIECASKSKKRKVEKPPNRDGEYDHydrophilic
685-707VAGKGAKEWKVRRNIMRRGQQRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-183KKRKV
690-707AKEWKVRRNIMRRGQQRR
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MSKRTSDSKVKAPLSALAARRLRQQQQQQITAEPASGTGTPNDDSPVVTPGIEIAPTITRKSVPNSYPIDGQTTAGPSSKGSVAEIPGNQLGEKSDNLPRQLSNFTPTDDNYVYDSQNAEITVKLRRGESLVVQGEFRISVGSGSISICGAIVETSSSISVVAPASQALPVIECASKSKKRKVEKPPNRDGEYDAVFTIKSTRTGLSDLGKVCPRFDKIWKPPLTSTTTKLEGTESFTPILTSLQSTPILTVPPSWQSAITSLSSTKQSPKCIFIVGGKSVGKSTFGRYLLNNIVTSQTPSRTIIYLDVDPGQPSFTPPCALSLHRITRPIVTPSFATFGSTEVLRQHHIGYTSPREDPKYYLRCAADLIQEYRNLVQQLGEEHTLVVNTCGWIKGLGRELLQELVLICEPTDAVGLGDVDGVFAEILPTDKSIKKHLLEGAGSGASGNSNSNGVASGGAGGGGGGGGAQAFSPADLRTLQTVAYFHAVPKGTDADIAFDFDRHLTGMMPIVASYRGANKVIHGITVLDADVTADLAFTAINATVVSINLIKGDDKEHPILRYLEDVYGGDDNAAPFIASNQFDGTSGVLPAEGTEMIGLAIIRGVNEEKGQLQLLTPVSEAELNQRVEDGYKVVLSRGRDEMPVWLMWDWRGRGAEQRRRRGTGANGGGVDKAPYLDFVVGGEVAGKGAKEWKVRRNIMRRGQQRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.48
3 0.42
4 0.42
5 0.44
6 0.43
7 0.5
8 0.54
9 0.55
10 0.57
11 0.65
12 0.66
13 0.7
14 0.76
15 0.69
16 0.64
17 0.61
18 0.52
19 0.42
20 0.32
21 0.23
22 0.18
23 0.17
24 0.15
25 0.13
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.17
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.17
34 0.15
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.13
39 0.12
40 0.1
41 0.09
42 0.14
43 0.16
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.23
48 0.29
49 0.36
50 0.33
51 0.39
52 0.43
53 0.44
54 0.47
55 0.45
56 0.43
57 0.35
58 0.34
59 0.28
60 0.25
61 0.24
62 0.2
63 0.19
64 0.15
65 0.17
66 0.18
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.22
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.22
76 0.21
77 0.18
78 0.18
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.22
83 0.26
84 0.29
85 0.31
86 0.3
87 0.31
88 0.34
89 0.32
90 0.3
91 0.27
92 0.27
93 0.28
94 0.27
95 0.31
96 0.27
97 0.26
98 0.25
99 0.26
100 0.24
101 0.23
102 0.23
103 0.16
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.11
108 0.13
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.23
116 0.24
117 0.28
118 0.28
119 0.27
120 0.27
121 0.25
122 0.24
123 0.21
124 0.18
125 0.1
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.13
162 0.21
163 0.29
164 0.36
165 0.44
166 0.5
167 0.6
168 0.69
169 0.77
170 0.8
171 0.83
172 0.86
173 0.88
174 0.88
175 0.82
176 0.73
177 0.65
178 0.59
179 0.5
180 0.41
181 0.31
182 0.22
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.16
192 0.19
193 0.18
194 0.22
195 0.21
196 0.24
197 0.28
198 0.26
199 0.26
200 0.27
201 0.27
202 0.27
203 0.33
204 0.39
205 0.43
206 0.53
207 0.56
208 0.56
209 0.55
210 0.56
211 0.55
212 0.48
213 0.43
214 0.38
215 0.37
216 0.33
217 0.31
218 0.28
219 0.22
220 0.25
221 0.24
222 0.21
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.22
254 0.23
255 0.29
256 0.3
257 0.33
258 0.32
259 0.31
260 0.31
261 0.27
262 0.28
263 0.23
264 0.25
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.19
269 0.18
270 0.14
271 0.16
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.24
277 0.25
278 0.26
279 0.23
280 0.17
281 0.18
282 0.16
283 0.18
284 0.15
285 0.12
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.12
307 0.13
308 0.14
309 0.17
310 0.22
311 0.26
312 0.26
313 0.28
314 0.26
315 0.27
316 0.29
317 0.28
318 0.22
319 0.19
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.15
324 0.14
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.18
340 0.19
341 0.21
342 0.22
343 0.23
344 0.23
345 0.25
346 0.3
347 0.3
348 0.29
349 0.32
350 0.31
351 0.29
352 0.29
353 0.28
354 0.22
355 0.2
356 0.21
357 0.17
358 0.17
359 0.18
360 0.17
361 0.17
362 0.14
363 0.12
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.08
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.1
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.02
414 0.03
415 0.04
416 0.05
417 0.08
418 0.11
419 0.13
420 0.18
421 0.23
422 0.23
423 0.27
424 0.29
425 0.3
426 0.27
427 0.26
428 0.23
429 0.18
430 0.17
431 0.13
432 0.1
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.03
460 0.04
461 0.04
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.15
475 0.16
476 0.14
477 0.16
478 0.16
479 0.14
480 0.16
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.15
485 0.13
486 0.11
487 0.12
488 0.1
489 0.11
490 0.08
491 0.08
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.1
503 0.12
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.2
508 0.2
509 0.19
510 0.16
511 0.14
512 0.13
513 0.14
514 0.12
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.03
528 0.04
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.11
541 0.14
542 0.18
543 0.23
544 0.25
545 0.26
546 0.29
547 0.29
548 0.28
549 0.27
550 0.24
551 0.2
552 0.18
553 0.17
554 0.16
555 0.15
556 0.14
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.08
562 0.06
563 0.05
564 0.07
565 0.11
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.13
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.07
592 0.08
593 0.09
594 0.1
595 0.11
596 0.11
597 0.13
598 0.14
599 0.12
600 0.12
601 0.15
602 0.16
603 0.16
604 0.15
605 0.13
606 0.13
607 0.14
608 0.14
609 0.16
610 0.21
611 0.21
612 0.2
613 0.21
614 0.2
615 0.2
616 0.21
617 0.17
618 0.11
619 0.12
620 0.13
621 0.15
622 0.18
623 0.19
624 0.22
625 0.25
626 0.25
627 0.24
628 0.25
629 0.27
630 0.27
631 0.25
632 0.23
633 0.2
634 0.19
635 0.2
636 0.26
637 0.22
638 0.24
639 0.25
640 0.24
641 0.33
642 0.42
643 0.5
644 0.54
645 0.64
646 0.67
647 0.71
648 0.72
649 0.69
650 0.67
651 0.67
652 0.63
653 0.57
654 0.51
655 0.47
656 0.45
657 0.38
658 0.31
659 0.21
660 0.15
661 0.1
662 0.1
663 0.11
664 0.11
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.07
672 0.07
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.13
677 0.19
678 0.27
679 0.35
680 0.44
681 0.53
682 0.63
683 0.72
684 0.76
685 0.81
686 0.83
687 0.86