Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8C1M6

Protein Details
Accession S8C1M6    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-82LWPPQTCNGSRKARRKEREALDVCHydrophilic
170-194LTNASPEPPKPKPRKNNWQHKLATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-183PKPR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MARETQTTRALRDHAANLKAPSRRALRYLRGIVDGRPYTTLPVSSADLQELEELREMGLWPPQTCNGSRKARRKEREALDVCGISQMEEKAVNRVVQGLQGRQPELRLDYEDTSVIGRNRHRALLAKGSAFNNRQEISGSRCLHTDAKAEARRMHTSADLMNPSILLSQLTNASPEPPKPKPRKNNWQHKLATAGRLRANAERNDASLFTQRLHARPLTTVIDDENRNLEHRFSELLQRPSARSLKESSPSLGREMAKLMKAGKFGLATQKFRSKMSSRPDDLSMDGVTKCMDAHRRLGRIATAEATMERYKTGYKPTEEAMVVMLRLLLDRCKVDAAIQFVRMAHETATGFGILLTKTLLEGLRQIGVEFGTLSKVFHLVEELLPASQSVHYTIFIRGCVDNQRSDLAAEWLLKMQAAGHTPDDATYNSILAATAKHGTWENVQVTMELCQQKEIKISSEAMNAVLNAASNRPEYSLEELRELTKSIGAEWNIATWNIILKATIAKCPPDEDLEKSLKSLLQQMRDSGFSPNSVTINTLLAKIDHTGDKNPQALRRLIHTISSGESHRNLQIQDIVAGSMLSNTSSKSTAKVIRRDVDNPHSQDTTLRMVALLRELKPVEALRIFQAHIAQSLRPTTELLILGIKAVFLLPATPDIPATASIAEKEQIKYTHEKQRSQTINQILSLSATHGLDVHTSLSKRAWTYLSAVYGYKITKDPTKTNPVLLRAPSEQILFEIYKFYQQHDLKNPHHPLMVSISIQYNIRQYQTIVDLMRAVAYSEWGKANKFNIVALTILLKAYISLRDERGVKWIVEHIKERGVEPDDVFMKTLKGGIKVPMAKYVQEWDEAEQGVVQDCIKLCERLRDSQMEKREKNRKMIEDLLLDNSGKSIEDKKSKVNDVAAAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.46
3 0.47
4 0.46
5 0.49
6 0.49
7 0.46
8 0.46
9 0.45
10 0.45
11 0.48
12 0.53
13 0.54
14 0.6
15 0.65
16 0.6
17 0.59
18 0.57
19 0.52
20 0.53
21 0.46
22 0.38
23 0.34
24 0.32
25 0.29
26 0.29
27 0.28
28 0.2
29 0.21
30 0.22
31 0.23
32 0.23
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.21
37 0.19
38 0.17
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.12
45 0.16
46 0.17
47 0.17
48 0.2
49 0.24
50 0.27
51 0.29
52 0.33
53 0.37
54 0.45
55 0.54
56 0.61
57 0.69
58 0.76
59 0.81
60 0.85
61 0.86
62 0.83
63 0.84
64 0.78
65 0.72
66 0.67
67 0.58
68 0.5
69 0.43
70 0.35
71 0.25
72 0.23
73 0.18
74 0.14
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.22
79 0.22
80 0.2
81 0.22
82 0.21
83 0.23
84 0.27
85 0.26
86 0.29
87 0.32
88 0.34
89 0.31
90 0.32
91 0.3
92 0.29
93 0.28
94 0.26
95 0.26
96 0.26
97 0.27
98 0.26
99 0.23
100 0.21
101 0.22
102 0.21
103 0.22
104 0.24
105 0.3
106 0.32
107 0.34
108 0.35
109 0.37
110 0.4
111 0.44
112 0.45
113 0.41
114 0.42
115 0.43
116 0.48
117 0.44
118 0.42
119 0.38
120 0.34
121 0.31
122 0.29
123 0.3
124 0.3
125 0.37
126 0.36
127 0.31
128 0.31
129 0.34
130 0.34
131 0.34
132 0.31
133 0.26
134 0.33
135 0.37
136 0.4
137 0.42
138 0.44
139 0.46
140 0.43
141 0.4
142 0.32
143 0.3
144 0.29
145 0.29
146 0.26
147 0.23
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.16
152 0.13
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.15
161 0.17
162 0.21
163 0.27
164 0.33
165 0.43
166 0.52
167 0.62
168 0.7
169 0.78
170 0.84
171 0.88
172 0.92
173 0.88
174 0.88
175 0.8
176 0.72
177 0.7
178 0.62
179 0.59
180 0.52
181 0.5
182 0.43
183 0.43
184 0.43
185 0.4
186 0.42
187 0.36
188 0.38
189 0.34
190 0.32
191 0.31
192 0.29
193 0.26
194 0.26
195 0.24
196 0.19
197 0.24
198 0.26
199 0.26
200 0.29
201 0.29
202 0.24
203 0.25
204 0.29
205 0.25
206 0.23
207 0.22
208 0.2
209 0.23
210 0.23
211 0.22
212 0.21
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.19
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.14
221 0.23
222 0.28
223 0.31
224 0.34
225 0.35
226 0.35
227 0.39
228 0.42
229 0.34
230 0.29
231 0.3
232 0.32
233 0.36
234 0.36
235 0.32
236 0.33
237 0.33
238 0.32
239 0.33
240 0.28
241 0.24
242 0.25
243 0.26
244 0.22
245 0.23
246 0.23
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.19
251 0.17
252 0.17
253 0.25
254 0.28
255 0.29
256 0.32
257 0.39
258 0.38
259 0.38
260 0.43
261 0.36
262 0.39
263 0.45
264 0.5
265 0.46
266 0.48
267 0.49
268 0.44
269 0.42
270 0.36
271 0.27
272 0.2
273 0.17
274 0.14
275 0.12
276 0.1
277 0.09
278 0.11
279 0.16
280 0.16
281 0.24
282 0.3
283 0.32
284 0.32
285 0.33
286 0.31
287 0.28
288 0.27
289 0.2
290 0.15
291 0.13
292 0.12
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.12
299 0.14
300 0.21
301 0.23
302 0.24
303 0.26
304 0.27
305 0.3
306 0.28
307 0.26
308 0.21
309 0.16
310 0.13
311 0.11
312 0.1
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.13
324 0.18
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.19
330 0.17
331 0.15
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.13
385 0.11
386 0.12
387 0.18
388 0.18
389 0.17
390 0.18
391 0.18
392 0.17
393 0.17
394 0.16
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.16
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.15
440 0.15
441 0.18
442 0.17
443 0.14
444 0.14
445 0.16
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.13
450 0.13
451 0.11
452 0.09
453 0.07
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.08
462 0.09
463 0.14
464 0.18
465 0.18
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.19
470 0.18
471 0.13
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.12
476 0.11
477 0.12
478 0.11
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.06
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.1
490 0.1
491 0.14
492 0.14
493 0.14
494 0.15
495 0.16
496 0.17
497 0.17
498 0.18
499 0.18
500 0.22
501 0.24
502 0.24
503 0.23
504 0.22
505 0.19
506 0.18
507 0.23
508 0.21
509 0.24
510 0.25
511 0.26
512 0.27
513 0.27
514 0.27
515 0.22
516 0.19
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.13
521 0.12
522 0.12
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.16
536 0.2
537 0.23
538 0.25
539 0.27
540 0.28
541 0.29
542 0.28
543 0.28
544 0.3
545 0.26
546 0.25
547 0.23
548 0.2
549 0.19
550 0.2
551 0.17
552 0.15
553 0.16
554 0.16
555 0.16
556 0.18
557 0.17
558 0.15
559 0.17
560 0.15
561 0.15
562 0.13
563 0.11
564 0.09
565 0.09
566 0.07
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.07
573 0.08
574 0.09
575 0.1
576 0.15
577 0.22
578 0.29
579 0.36
580 0.4
581 0.44
582 0.47
583 0.49
584 0.5
585 0.5
586 0.5
587 0.46
588 0.44
589 0.39
590 0.36
591 0.33
592 0.3
593 0.27
594 0.2
595 0.17
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.17
600 0.18
601 0.14
602 0.17
603 0.18
604 0.18
605 0.2
606 0.2
607 0.18
608 0.16
609 0.16
610 0.15
611 0.16
612 0.17
613 0.15
614 0.17
615 0.14
616 0.15
617 0.16
618 0.14
619 0.14
620 0.16
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.12
625 0.14
626 0.14
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.1
632 0.09
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.03
637 0.04
638 0.04
639 0.06
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.09
651 0.11
652 0.13
653 0.13
654 0.16
655 0.17
656 0.2
657 0.26
658 0.32
659 0.41
660 0.45
661 0.5
662 0.49
663 0.58
664 0.61
665 0.58
666 0.58
667 0.55
668 0.51
669 0.47
670 0.44
671 0.34
672 0.28
673 0.25
674 0.18
675 0.13
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.13
686 0.14
687 0.17
688 0.17
689 0.19
690 0.19
691 0.17
692 0.21
693 0.23
694 0.23
695 0.22
696 0.22
697 0.2
698 0.21
699 0.2
700 0.18
701 0.17
702 0.17
703 0.22
704 0.27
705 0.32
706 0.37
707 0.47
708 0.46
709 0.51
710 0.53
711 0.52
712 0.52
713 0.47
714 0.44
715 0.37
716 0.37
717 0.32
718 0.27
719 0.23
720 0.18
721 0.2
722 0.16
723 0.14
724 0.14
725 0.13
726 0.19
727 0.2
728 0.22
729 0.28
730 0.3
731 0.38
732 0.45
733 0.53
734 0.5
735 0.6
736 0.62
737 0.55
738 0.54
739 0.47
740 0.39
741 0.36
742 0.35
743 0.26
744 0.23
745 0.22
746 0.21
747 0.22
748 0.21
749 0.2
750 0.19
751 0.2
752 0.19
753 0.18
754 0.2
755 0.22
756 0.25
757 0.21
758 0.19
759 0.19
760 0.18
761 0.18
762 0.14
763 0.12
764 0.08
765 0.1
766 0.1
767 0.12
768 0.16
769 0.17
770 0.18
771 0.21
772 0.24
773 0.26
774 0.25
775 0.24
776 0.22
777 0.21
778 0.2
779 0.17
780 0.16
781 0.12
782 0.11
783 0.1
784 0.08
785 0.08
786 0.09
787 0.12
788 0.13
789 0.16
790 0.18
791 0.23
792 0.25
793 0.26
794 0.3
795 0.3
796 0.27
797 0.26
798 0.31
799 0.33
800 0.36
801 0.39
802 0.36
803 0.38
804 0.39
805 0.38
806 0.37
807 0.34
808 0.32
809 0.29
810 0.33
811 0.29
812 0.29
813 0.29
814 0.23
815 0.2
816 0.17
817 0.2
818 0.17
819 0.18
820 0.19
821 0.23
822 0.3
823 0.35
824 0.36
825 0.4
826 0.39
827 0.37
828 0.36
829 0.38
830 0.32
831 0.3
832 0.3
833 0.25
834 0.27
835 0.27
836 0.25
837 0.2
838 0.18
839 0.15
840 0.15
841 0.12
842 0.11
843 0.11
844 0.15
845 0.17
846 0.21
847 0.22
848 0.31
849 0.36
850 0.4
851 0.46
852 0.51
853 0.55
854 0.58
855 0.67
856 0.67
857 0.69
858 0.71
859 0.76
860 0.74
861 0.78
862 0.79
863 0.75
864 0.72
865 0.73
866 0.69
867 0.64
868 0.6
869 0.54
870 0.47
871 0.4
872 0.32
873 0.26
874 0.2
875 0.15
876 0.15
877 0.18
878 0.24
879 0.33
880 0.36
881 0.45
882 0.53
883 0.58
884 0.6
885 0.58