Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8C5Q4

Protein Details
Accession S8C5Q4    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-152GAGGQKKKEVSRRSRKTRDEVKGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-193HRRARGEGAGGQKKKEVSRRSRKTRDEVKGVDSDGGEKPARPAKPLTANERKLKELDSKIDKVVKAPGRKRK
420-436RLKARATGKVGGRGSGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDTTTQKTPIAADASVKPPAPSFEDISDMEISDKEPDEPRKKIVTHGLDSEDDVAAVDSARISAGKDKDLADGDSDLSDLSDLDEDELDDLADIDDDDLVAGRERPEVDLDKDAMQKMGVHRRARGEGAGGQKKKEVSRRSRKTRDEVKGVDSDGGEKPARPAKPLTANERKLKELDSKIDKVVKAPGRKRKQDGDSTFYDDMVADLTNRMKAAARDDADDKEAGRPATRKLKMLPEVLSAFRQRELKSIIDGNVLEAVRFWLEPLPDRSLPAYDIQRDLFQVLLEMQDIDYDHLRISGLGKLLNFYIRDARPQQHIRFTAQKLYENWSRPILEKHNDYRHRKIQTADFDHSVKRTKTKISSLRDKPDALAPPQLKANRTRVPDATPQTYTIAPRSNISTIDPAAARPLGASAEDSIRRLKARATGKVGGRGSGKGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.32
4 0.31
5 0.27
6 0.25
7 0.27
8 0.29
9 0.27
10 0.27
11 0.25
12 0.29
13 0.29
14 0.31
15 0.28
16 0.23
17 0.2
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.21
24 0.31
25 0.37
26 0.41
27 0.45
28 0.5
29 0.5
30 0.53
31 0.56
32 0.55
33 0.52
34 0.53
35 0.51
36 0.44
37 0.44
38 0.4
39 0.29
40 0.21
41 0.17
42 0.12
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.13
52 0.16
53 0.18
54 0.2
55 0.21
56 0.24
57 0.26
58 0.26
59 0.21
60 0.19
61 0.18
62 0.15
63 0.14
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.22
98 0.23
99 0.24
100 0.26
101 0.25
102 0.22
103 0.19
104 0.19
105 0.22
106 0.3
107 0.34
108 0.34
109 0.37
110 0.41
111 0.44
112 0.43
113 0.37
114 0.3
115 0.27
116 0.35
117 0.4
118 0.37
119 0.35
120 0.36
121 0.39
122 0.41
123 0.44
124 0.44
125 0.47
126 0.57
127 0.67
128 0.75
129 0.82
130 0.84
131 0.85
132 0.86
133 0.83
134 0.8
135 0.72
136 0.65
137 0.58
138 0.51
139 0.43
140 0.33
141 0.28
142 0.2
143 0.21
144 0.17
145 0.14
146 0.16
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.22
151 0.24
152 0.33
153 0.37
154 0.44
155 0.48
156 0.54
157 0.58
158 0.59
159 0.55
160 0.46
161 0.44
162 0.43
163 0.37
164 0.38
165 0.37
166 0.37
167 0.38
168 0.41
169 0.38
170 0.32
171 0.36
172 0.35
173 0.37
174 0.43
175 0.5
176 0.55
177 0.61
178 0.65
179 0.66
180 0.66
181 0.68
182 0.64
183 0.59
184 0.53
185 0.53
186 0.48
187 0.39
188 0.33
189 0.23
190 0.18
191 0.14
192 0.11
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.11
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.16
210 0.12
211 0.14
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.16
216 0.25
217 0.27
218 0.27
219 0.28
220 0.35
221 0.37
222 0.39
223 0.36
224 0.3
225 0.3
226 0.29
227 0.29
228 0.23
229 0.19
230 0.19
231 0.21
232 0.18
233 0.2
234 0.22
235 0.21
236 0.21
237 0.23
238 0.21
239 0.2
240 0.19
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.13
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.11
253 0.14
254 0.19
255 0.19
256 0.2
257 0.21
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.21
262 0.17
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.17
268 0.14
269 0.1
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.19
296 0.18
297 0.24
298 0.27
299 0.3
300 0.36
301 0.43
302 0.46
303 0.47
304 0.49
305 0.48
306 0.52
307 0.52
308 0.51
309 0.46
310 0.47
311 0.4
312 0.44
313 0.46
314 0.42
315 0.42
316 0.38
317 0.37
318 0.34
319 0.38
320 0.39
321 0.38
322 0.42
323 0.48
324 0.54
325 0.63
326 0.68
327 0.7
328 0.71
329 0.7
330 0.66
331 0.62
332 0.6
333 0.61
334 0.61
335 0.56
336 0.52
337 0.48
338 0.47
339 0.46
340 0.45
341 0.37
342 0.36
343 0.35
344 0.39
345 0.44
346 0.52
347 0.58
348 0.6
349 0.68
350 0.72
351 0.76
352 0.73
353 0.68
354 0.6
355 0.57
356 0.54
357 0.45
358 0.46
359 0.38
360 0.35
361 0.41
362 0.43
363 0.39
364 0.4
365 0.46
366 0.44
367 0.48
368 0.52
369 0.48
370 0.5
371 0.56
372 0.56
373 0.53
374 0.47
375 0.44
376 0.41
377 0.41
378 0.37
379 0.33
380 0.33
381 0.29
382 0.29
383 0.31
384 0.31
385 0.3
386 0.3
387 0.3
388 0.24
389 0.26
390 0.25
391 0.21
392 0.22
393 0.21
394 0.18
395 0.14
396 0.14
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.17
402 0.19
403 0.2
404 0.23
405 0.25
406 0.27
407 0.27
408 0.28
409 0.3
410 0.37
411 0.44
412 0.49
413 0.53
414 0.56
415 0.64
416 0.61
417 0.57
418 0.51
419 0.43