Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8BCF3

Protein Details
Accession S8BCF3    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
505-529MAPSNRKPRTRAPRVRKRDRDIKALBasic
588-616PSKTSSRNTAKNNKKREERRKAAKGRAAAHydrophilic
639-658NADKAKTKGKKTTTKPERFIHydrophilic
756-798GGKSEDRKEKVRAKNEKLNEERKVRFEEERKRKTEKKAEEGDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
509-524NRKPRTRAPRVRKRDR
563-571KSRKRKREL
581-618KKEEATGPSKTSSRNTAKNNKKREERRKAAKGRAAAAK
696-705PKVRGRGRPK
758-800KSEDRKEKVRAKNEKLNEERKVRFEEERKRKTEKKAEEGDGEK
811-821IHPSRRKRVRR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10, cyto 7, mito 5, extr 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036249  Thioredoxin-like_sf  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR001012  UBX_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00789  UBX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50033  UBX  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
cd01767  UBX  
Amino Acid Sequences MTDSIFFSGRIEEAIAATVQNQKPLACFVTDENDDSNTWEHDYLSNQSISNALKDSAITVRLLKDSTEANYLNAFCAITTYPTLLIIKNGGAGVDGLTVITHPISKDDFISKIESTLITPAATASLLDGVNSNPTFPTTPTPTATSTPPPAGAATRTPTTSEDEIPENTQFPADSATARRLASIQQQHRERIARLKAQREAAEQEEAKKRELARRSDTKAMVEAAETQQSRTNRQYAEEQKKRKMEMDRERKRVLEQIKADREEMRIREMNRKAIAAEAAAVSSALDGATTSEKGKEREGGVPADGECNIAFRLLNGERISNKFPVGATVEKDLRPWLDQNRTDGNQPYKLVAQASSMSSKNIEGTSILSDLGLYPSAILILKPVSASRVSTAFAPVIRTNGTQHNFFIAFLLSVWLMIKTFLGMHNPNASVQVGEKDKSQAGDSSESAGESGSSSSGNSAAKDVARKRIRTLHDGDEDKRSAYYNGNTLDFEPKKGDEGFDPAMAPSNRKPRTRAPRVRKRDRDIKALPETDDAEGGVPLDASDEPTFTVGGVDTTNEGLAKSRKRKRELQGEEGNAEEKKEEATGPSKTSSRNTAKNNKKREERRKAAKGRAAAAKGNDEAAATSNAAEGDEDKDANADKAKTKGKKTTTKPERFIVFVGNLPFDTTQEALSEHFVNVKPTAIRLATFKAGEGPKVRGRGRPKPADEESGEQKCKGYGFVEFSDVGRMKTCLSLFHHSEFKGRKINVELTAGGGGKSEDRKEKVRAKNEKLNEERKVRFEEERKRKTEKKAEEGDGEKAEEKEEENDGIHPSRRKRVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.09
4 0.11
5 0.2
6 0.19
7 0.23
8 0.23
9 0.23
10 0.24
11 0.28
12 0.28
13 0.2
14 0.21
15 0.19
16 0.26
17 0.27
18 0.28
19 0.25
20 0.25
21 0.24
22 0.25
23 0.24
24 0.18
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.17
29 0.2
30 0.23
31 0.25
32 0.25
33 0.23
34 0.22
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.18
43 0.17
44 0.18
45 0.16
46 0.17
47 0.19
48 0.2
49 0.21
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.24
55 0.22
56 0.22
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.22
61 0.19
62 0.12
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.15
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.09
91 0.12
92 0.13
93 0.15
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.25
98 0.22
99 0.21
100 0.21
101 0.19
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.12
121 0.14
122 0.15
123 0.16
124 0.22
125 0.23
126 0.27
127 0.29
128 0.32
129 0.32
130 0.33
131 0.35
132 0.34
133 0.32
134 0.3
135 0.28
136 0.26
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.21
144 0.22
145 0.23
146 0.26
147 0.27
148 0.25
149 0.23
150 0.24
151 0.25
152 0.26
153 0.25
154 0.21
155 0.19
156 0.17
157 0.14
158 0.12
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.17
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.2
169 0.27
170 0.34
171 0.38
172 0.44
173 0.49
174 0.51
175 0.56
176 0.57
177 0.51
178 0.5
179 0.5
180 0.49
181 0.52
182 0.56
183 0.55
184 0.57
185 0.56
186 0.51
187 0.48
188 0.41
189 0.41
190 0.35
191 0.36
192 0.39
193 0.38
194 0.36
195 0.35
196 0.36
197 0.37
198 0.44
199 0.45
200 0.45
201 0.53
202 0.57
203 0.61
204 0.59
205 0.53
206 0.48
207 0.41
208 0.33
209 0.25
210 0.22
211 0.16
212 0.2
213 0.18
214 0.17
215 0.21
216 0.22
217 0.26
218 0.28
219 0.31
220 0.27
221 0.29
222 0.38
223 0.43
224 0.53
225 0.58
226 0.61
227 0.63
228 0.67
229 0.67
230 0.64
231 0.62
232 0.61
233 0.63
234 0.68
235 0.69
236 0.72
237 0.72
238 0.67
239 0.6
240 0.57
241 0.5
242 0.48
243 0.45
244 0.47
245 0.52
246 0.52
247 0.51
248 0.46
249 0.44
250 0.41
251 0.36
252 0.32
253 0.3
254 0.3
255 0.38
256 0.4
257 0.43
258 0.38
259 0.38
260 0.31
261 0.29
262 0.27
263 0.17
264 0.15
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.02
274 0.02
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.11
280 0.14
281 0.15
282 0.17
283 0.2
284 0.21
285 0.24
286 0.26
287 0.24
288 0.22
289 0.21
290 0.2
291 0.17
292 0.15
293 0.11
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.05
300 0.11
301 0.11
302 0.16
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.23
307 0.25
308 0.21
309 0.21
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.17
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.18
321 0.16
322 0.16
323 0.18
324 0.21
325 0.27
326 0.28
327 0.32
328 0.37
329 0.37
330 0.38
331 0.39
332 0.36
333 0.32
334 0.3
335 0.27
336 0.22
337 0.22
338 0.2
339 0.16
340 0.13
341 0.11
342 0.12
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.09
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.06
361 0.04
362 0.04
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.19
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.19
393 0.18
394 0.18
395 0.16
396 0.09
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.05
401 0.04
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.04
409 0.05
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.1
419 0.09
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.12
429 0.13
430 0.15
431 0.14
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.15
451 0.17
452 0.25
453 0.3
454 0.31
455 0.33
456 0.4
457 0.43
458 0.43
459 0.46
460 0.43
461 0.44
462 0.47
463 0.45
464 0.42
465 0.39
466 0.34
467 0.29
468 0.23
469 0.18
470 0.18
471 0.18
472 0.17
473 0.18
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.26
478 0.24
479 0.23
480 0.2
481 0.19
482 0.2
483 0.2
484 0.2
485 0.12
486 0.17
487 0.17
488 0.16
489 0.15
490 0.13
491 0.19
492 0.18
493 0.19
494 0.2
495 0.28
496 0.34
497 0.36
498 0.41
499 0.45
500 0.56
501 0.65
502 0.7
503 0.71
504 0.77
505 0.85
506 0.92
507 0.91
508 0.88
509 0.87
510 0.81
511 0.8
512 0.73
513 0.71
514 0.66
515 0.59
516 0.52
517 0.43
518 0.4
519 0.31
520 0.26
521 0.18
522 0.12
523 0.09
524 0.08
525 0.06
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.08
548 0.14
549 0.21
550 0.31
551 0.39
552 0.47
553 0.53
554 0.63
555 0.69
556 0.75
557 0.74
558 0.74
559 0.75
560 0.69
561 0.64
562 0.55
563 0.48
564 0.37
565 0.29
566 0.2
567 0.11
568 0.09
569 0.09
570 0.08
571 0.09
572 0.14
573 0.16
574 0.18
575 0.21
576 0.22
577 0.24
578 0.27
579 0.33
580 0.36
581 0.41
582 0.48
583 0.56
584 0.65
585 0.72
586 0.79
587 0.78
588 0.82
589 0.85
590 0.87
591 0.88
592 0.87
593 0.89
594 0.9
595 0.9
596 0.89
597 0.83
598 0.76
599 0.71
600 0.68
601 0.61
602 0.53
603 0.46
604 0.4
605 0.34
606 0.31
607 0.24
608 0.17
609 0.14
610 0.13
611 0.12
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.09
622 0.08
623 0.09
624 0.1
625 0.11
626 0.14
627 0.14
628 0.16
629 0.23
630 0.32
631 0.38
632 0.44
633 0.51
634 0.57
635 0.65
636 0.7
637 0.75
638 0.77
639 0.81
640 0.79
641 0.77
642 0.7
643 0.62
644 0.55
645 0.48
646 0.39
647 0.32
648 0.29
649 0.23
650 0.2
651 0.2
652 0.19
653 0.14
654 0.15
655 0.12
656 0.11
657 0.1
658 0.11
659 0.1
660 0.13
661 0.14
662 0.12
663 0.15
664 0.16
665 0.18
666 0.18
667 0.2
668 0.18
669 0.17
670 0.21
671 0.18
672 0.18
673 0.18
674 0.22
675 0.23
676 0.23
677 0.22
678 0.25
679 0.26
680 0.29
681 0.29
682 0.31
683 0.32
684 0.4
685 0.42
686 0.42
687 0.5
688 0.56
689 0.63
690 0.67
691 0.67
692 0.68
693 0.7
694 0.69
695 0.64
696 0.6
697 0.58
698 0.57
699 0.53
700 0.45
701 0.41
702 0.36
703 0.33
704 0.29
705 0.22
706 0.18
707 0.21
708 0.22
709 0.25
710 0.24
711 0.24
712 0.3
713 0.29
714 0.25
715 0.21
716 0.21
717 0.18
718 0.22
719 0.22
720 0.2
721 0.25
722 0.33
723 0.35
724 0.38
725 0.43
726 0.39
727 0.47
728 0.46
729 0.47
730 0.48
731 0.44
732 0.45
733 0.46
734 0.51
735 0.47
736 0.46
737 0.39
738 0.33
739 0.35
740 0.3
741 0.24
742 0.18
743 0.15
744 0.15
745 0.19
746 0.22
747 0.27
748 0.31
749 0.37
750 0.46
751 0.55
752 0.61
753 0.68
754 0.73
755 0.75
756 0.8
757 0.83
758 0.84
759 0.84
760 0.83
761 0.81
762 0.79
763 0.75
764 0.7
765 0.69
766 0.63
767 0.63
768 0.64
769 0.67
770 0.69
771 0.74
772 0.75
773 0.77
774 0.8
775 0.82
776 0.83
777 0.82
778 0.81
779 0.8
780 0.8
781 0.79
782 0.74
783 0.69
784 0.61
785 0.53
786 0.46
787 0.36
788 0.32
789 0.25
790 0.24
791 0.21
792 0.21
793 0.2
794 0.18
795 0.2
796 0.23
797 0.26
798 0.3
799 0.35
800 0.38
801 0.47