Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RAJ2

Protein Details
Accession F4RAJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-295ETSNKSRLMRYKKLIHKTLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019404  Mediator_Med11  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG mlr:MELLADRAFT_124662  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10280  Med11  
Amino Acid Sequences MSQSSSSSSDSDSSIEFDPISLTSISQTNNNLTTSNDHTDPSQVQASTLPTTQPILDNQSDSSDPDPNNPSNQPVPTLANLIRDLPPVPAANATPKTPNVFGSSSEDDDDDDDDDMDEVEAPVLNLSIDPQSLPTSNQNPPTAATRSWMSQRKGKAILIDGVDHSNTMMEEDSNEENSSNGQIGSAQRIRELGLVDEQIAALLGMASKALECLSPPPPSAKLEDSKSIQTFSESIQEYFTTLNNVQLGLRTSIVHLRAARISTRILFEPPHSNVPETSNKSRLMRYKKLIHKTLTSDREYIDPEVKPANPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.15
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.14
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.14
12 0.15
13 0.17
14 0.2
15 0.21
16 0.24
17 0.24
18 0.23
19 0.21
20 0.25
21 0.28
22 0.3
23 0.27
24 0.25
25 0.25
26 0.28
27 0.28
28 0.27
29 0.25
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.24
34 0.22
35 0.22
36 0.18
37 0.15
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.2
43 0.2
44 0.21
45 0.2
46 0.22
47 0.22
48 0.21
49 0.21
50 0.21
51 0.2
52 0.23
53 0.28
54 0.27
55 0.31
56 0.3
57 0.32
58 0.31
59 0.31
60 0.28
61 0.26
62 0.27
63 0.23
64 0.26
65 0.23
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.21
70 0.2
71 0.19
72 0.16
73 0.17
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.18
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.24
84 0.23
85 0.24
86 0.22
87 0.21
88 0.21
89 0.25
90 0.26
91 0.24
92 0.24
93 0.22
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.11
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.13
122 0.17
123 0.21
124 0.25
125 0.25
126 0.24
127 0.25
128 0.27
129 0.26
130 0.21
131 0.19
132 0.16
133 0.17
134 0.24
135 0.29
136 0.28
137 0.3
138 0.32
139 0.35
140 0.36
141 0.36
142 0.3
143 0.25
144 0.25
145 0.21
146 0.2
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.11
151 0.09
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.05
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.02
192 0.02
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.08
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.17
204 0.19
205 0.21
206 0.24
207 0.25
208 0.27
209 0.28
210 0.33
211 0.33
212 0.36
213 0.35
214 0.33
215 0.29
216 0.25
217 0.22
218 0.18
219 0.23
220 0.19
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.14
236 0.15
237 0.12
238 0.14
239 0.18
240 0.19
241 0.21
242 0.2
243 0.21
244 0.23
245 0.25
246 0.25
247 0.22
248 0.24
249 0.22
250 0.24
251 0.23
252 0.22
253 0.22
254 0.24
255 0.3
256 0.31
257 0.36
258 0.34
259 0.34
260 0.33
261 0.37
262 0.43
263 0.43
264 0.45
265 0.44
266 0.47
267 0.49
268 0.54
269 0.58
270 0.58
271 0.6
272 0.63
273 0.68
274 0.73
275 0.8
276 0.8
277 0.76
278 0.74
279 0.72
280 0.74
281 0.72
282 0.66
283 0.58
284 0.51
285 0.5
286 0.46
287 0.42
288 0.38
289 0.3
290 0.29
291 0.32