Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8BGM9

Protein Details
Accession S8BGM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
791-815HLESIKSRNKPKDPIKKPEKSPFFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
799-807NKPKDPIKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007319  SSU_processome_Utp21  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04192  Utp21  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MASDTANPPAKRARLEVAKSAPSTPSQKSQSRIFAPFRSLGHVTTSTPFALLQHSATFQISTSTGYSISTYDIRKLNLLFVTSPQTPSEITSIYARGKELYVGFRTGIWIFERGKKTGEMQMDEVKKGRTGIKDIFGFGDWLVGVIGPKSVGVWKIGTRELYTTIELFGDADIVNIIHPPTFLNKICIGTSDGGVEIWNIRSSKLVYSILTPRAPTGTDIGHLTSLSLSTHHSIVAMGFSSGIINLHNIQTDTPVFQLSSSAPVTSLSFRSDLVPPPLKSSSDPLSPSDMLASASSNGNITLWSLKSRKVVGIMRGVHSAATGGITRATFLPGQNVIVTSGGDNAIKLWVFDTPTTVLPRILRQRGGHALAPNTILFHPSTHFILSGSLDHSLWGFSLRSDAQSTELSQGNMESTMNKLKKSGMYDRIADVSLLKGAVITCIAAEGNRDGAGAEWGSNELGWEGVITGGREEAFARSWSWTKRKIGRWTLPTGDGGEVKSVAISPCGTFGIVGSAKGAIDMYNLQSGLHRSRFPAKATRAQIAARKNGEGSRAGWKHAGAVTGLAVDSVNKVMISCGLDGFVKFWEFKSGLLQQQISFTENTACTALRMHRSSGLIAISCDDLGIRVVDIETRKVVRELWGCGGRISDLCFSNDSRWLIASSMDSTIRVWDLPTGHLIDGFKTQSVVNSIAFSPDGNFLATAAIDSIGIGIYTNKTVFTHVPTRRISEDDIRKLTGPSSTGEGGTGLVESAFVEDTEDVDTEGQYTTVDQLSDQMLTMSLLPKNRWVNLLHLESIKSRNKPKDPIKKPEKSPFFLGSLASSKDGVAKLTGLDGVKDLDNGLDLSDADASRRAIERAELSRVKTGGIEFERSFTKLLMEGSEDGDYTEFIEHLKTLPPSTTDLEIRTLDASTAPYFELISFVEALTQRLRTRKDYELVLTWMRVFLKIHGEIISKEEEELERLGDGSENEDDDSDDEMLQFRQQDNPTIKDALQEYKDEMKQEAGRVGELVGYCGGVLGFLRSGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.58
4 0.57
5 0.58
6 0.57
7 0.54
8 0.47
9 0.43
10 0.44
11 0.4
12 0.42
13 0.44
14 0.48
15 0.51
16 0.57
17 0.6
18 0.61
19 0.65
20 0.62
21 0.59
22 0.58
23 0.58
24 0.51
25 0.49
26 0.44
27 0.37
28 0.36
29 0.33
30 0.3
31 0.28
32 0.29
33 0.23
34 0.22
35 0.21
36 0.16
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.14
54 0.12
55 0.15
56 0.17
57 0.18
58 0.23
59 0.26
60 0.26
61 0.29
62 0.29
63 0.31
64 0.28
65 0.29
66 0.24
67 0.24
68 0.29
69 0.27
70 0.28
71 0.24
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.23
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.23
87 0.25
88 0.24
89 0.25
90 0.24
91 0.23
92 0.25
93 0.22
94 0.21
95 0.17
96 0.19
97 0.21
98 0.29
99 0.33
100 0.32
101 0.34
102 0.33
103 0.35
104 0.37
105 0.4
106 0.35
107 0.35
108 0.42
109 0.43
110 0.43
111 0.42
112 0.36
113 0.32
114 0.31
115 0.32
116 0.28
117 0.31
118 0.34
119 0.39
120 0.39
121 0.39
122 0.38
123 0.33
124 0.29
125 0.23
126 0.19
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.13
141 0.16
142 0.19
143 0.23
144 0.24
145 0.23
146 0.24
147 0.25
148 0.25
149 0.24
150 0.21
151 0.19
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.1
168 0.17
169 0.18
170 0.21
171 0.23
172 0.25
173 0.25
174 0.26
175 0.25
176 0.2
177 0.2
178 0.17
179 0.14
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.17
191 0.2
192 0.21
193 0.18
194 0.23
195 0.29
196 0.31
197 0.31
198 0.3
199 0.26
200 0.25
201 0.25
202 0.22
203 0.18
204 0.14
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.12
245 0.09
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.14
253 0.15
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.2
260 0.25
261 0.3
262 0.29
263 0.34
264 0.35
265 0.34
266 0.32
267 0.34
268 0.31
269 0.28
270 0.3
271 0.26
272 0.3
273 0.29
274 0.28
275 0.23
276 0.2
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.14
291 0.15
292 0.18
293 0.22
294 0.23
295 0.24
296 0.27
297 0.31
298 0.3
299 0.37
300 0.36
301 0.34
302 0.34
303 0.33
304 0.26
305 0.22
306 0.18
307 0.1
308 0.08
309 0.07
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.13
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.14
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.23
347 0.28
348 0.3
349 0.32
350 0.31
351 0.35
352 0.39
353 0.4
354 0.37
355 0.32
356 0.3
357 0.26
358 0.27
359 0.22
360 0.18
361 0.15
362 0.13
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.12
368 0.1
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.16
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.07
401 0.07
402 0.15
403 0.16
404 0.16
405 0.17
406 0.19
407 0.22
408 0.27
409 0.33
410 0.32
411 0.34
412 0.35
413 0.36
414 0.35
415 0.32
416 0.26
417 0.19
418 0.11
419 0.09
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.1
464 0.13
465 0.17
466 0.22
467 0.27
468 0.32
469 0.4
470 0.47
471 0.55
472 0.61
473 0.63
474 0.63
475 0.62
476 0.58
477 0.51
478 0.44
479 0.35
480 0.27
481 0.21
482 0.16
483 0.11
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.03
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.1
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.15
518 0.22
519 0.25
520 0.26
521 0.32
522 0.33
523 0.39
524 0.41
525 0.41
526 0.36
527 0.36
528 0.38
529 0.34
530 0.35
531 0.28
532 0.26
533 0.25
534 0.24
535 0.24
536 0.2
537 0.18
538 0.22
539 0.22
540 0.23
541 0.22
542 0.21
543 0.21
544 0.21
545 0.19
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.15
576 0.18
577 0.2
578 0.22
579 0.23
580 0.19
581 0.21
582 0.22
583 0.19
584 0.15
585 0.13
586 0.13
587 0.12
588 0.13
589 0.11
590 0.1
591 0.09
592 0.11
593 0.13
594 0.17
595 0.18
596 0.18
597 0.2
598 0.21
599 0.21
600 0.21
601 0.19
602 0.14
603 0.12
604 0.12
605 0.09
606 0.08
607 0.08
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.06
616 0.07
617 0.08
618 0.1
619 0.11
620 0.11
621 0.12
622 0.13
623 0.16
624 0.18
625 0.2
626 0.23
627 0.26
628 0.25
629 0.25
630 0.25
631 0.2
632 0.17
633 0.17
634 0.15
635 0.13
636 0.14
637 0.15
638 0.16
639 0.17
640 0.21
641 0.19
642 0.16
643 0.16
644 0.15
645 0.14
646 0.14
647 0.13
648 0.1
649 0.11
650 0.11
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.1
660 0.12
661 0.12
662 0.12
663 0.13
664 0.13
665 0.12
666 0.14
667 0.14
668 0.12
669 0.11
670 0.11
671 0.11
672 0.13
673 0.14
674 0.11
675 0.12
676 0.12
677 0.12
678 0.12
679 0.11
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.06
689 0.05
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.04
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.1
704 0.11
705 0.16
706 0.25
707 0.27
708 0.34
709 0.36
710 0.39
711 0.39
712 0.4
713 0.38
714 0.38
715 0.44
716 0.44
717 0.45
718 0.42
719 0.41
720 0.39
721 0.36
722 0.29
723 0.21
724 0.15
725 0.16
726 0.15
727 0.15
728 0.14
729 0.13
730 0.12
731 0.1
732 0.09
733 0.05
734 0.04
735 0.04
736 0.04
737 0.04
738 0.04
739 0.04
740 0.05
741 0.05
742 0.06
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.06
751 0.05
752 0.06
753 0.07
754 0.08
755 0.08
756 0.07
757 0.09
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.08
762 0.07
763 0.07
764 0.09
765 0.1
766 0.11
767 0.14
768 0.14
769 0.21
770 0.25
771 0.26
772 0.28
773 0.26
774 0.3
775 0.34
776 0.37
777 0.32
778 0.3
779 0.3
780 0.3
781 0.36
782 0.37
783 0.36
784 0.41
785 0.48
786 0.53
787 0.61
788 0.69
789 0.73
790 0.76
791 0.81
792 0.83
793 0.83
794 0.85
795 0.86
796 0.83
797 0.76
798 0.73
799 0.66
800 0.58
801 0.49
802 0.42
803 0.34
804 0.29
805 0.26
806 0.21
807 0.18
808 0.15
809 0.18
810 0.18
811 0.15
812 0.13
813 0.12
814 0.11
815 0.11
816 0.14
817 0.1
818 0.1
819 0.1
820 0.11
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.08
825 0.08
826 0.08
827 0.07
828 0.06
829 0.06
830 0.07
831 0.09
832 0.09
833 0.09
834 0.11
835 0.12
836 0.13
837 0.15
838 0.15
839 0.13
840 0.16
841 0.21
842 0.23
843 0.31
844 0.32
845 0.33
846 0.37
847 0.36
848 0.34
849 0.29
850 0.26
851 0.26
852 0.25
853 0.28
854 0.24
855 0.26
856 0.28
857 0.27
858 0.28
859 0.2
860 0.18
861 0.15
862 0.16
863 0.15
864 0.16
865 0.16
866 0.17
867 0.17
868 0.16
869 0.14
870 0.13
871 0.12
872 0.1
873 0.09
874 0.07
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.09
879 0.13
880 0.14
881 0.15
882 0.16
883 0.18
884 0.21
885 0.24
886 0.27
887 0.25
888 0.25
889 0.27
890 0.26
891 0.25
892 0.22
893 0.2
894 0.16
895 0.14
896 0.15
897 0.12
898 0.13
899 0.12
900 0.11
901 0.11
902 0.11
903 0.11
904 0.09
905 0.1
906 0.1
907 0.09
908 0.13
909 0.13
910 0.15
911 0.16
912 0.2
913 0.22
914 0.28
915 0.33
916 0.35
917 0.41
918 0.46
919 0.48
920 0.49
921 0.49
922 0.47
923 0.48
924 0.44
925 0.4
926 0.33
927 0.31
928 0.27
929 0.24
930 0.21
931 0.19
932 0.24
933 0.24
934 0.25
935 0.26
936 0.27
937 0.26
938 0.28
939 0.28
940 0.21
941 0.2
942 0.2
943 0.18
944 0.18
945 0.18
946 0.16
947 0.12
948 0.12
949 0.12
950 0.12
951 0.11
952 0.13
953 0.13
954 0.13
955 0.13
956 0.13
957 0.14
958 0.13
959 0.15
960 0.13
961 0.11
962 0.11
963 0.12
964 0.12
965 0.14
966 0.16
967 0.15
968 0.21
969 0.23
970 0.32
971 0.36
972 0.39
973 0.41
974 0.41
975 0.4
976 0.38
977 0.39
978 0.38
979 0.35
980 0.33
981 0.33
982 0.38
983 0.41
984 0.38
985 0.36
986 0.35
987 0.36
988 0.37
989 0.37
990 0.3
991 0.28
992 0.27
993 0.26
994 0.22
995 0.18
996 0.17
997 0.12
998 0.11
999 0.1
1000 0.1
1001 0.09
1002 0.06
1003 0.07
1004 0.07