FuNGI

S8BMS8

Protein Details

Accession

S8BMS8

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-60	RATGDPLVRPKPKRPPPKKTTGPVPARPKPAF	Hydrophilic
176-199	GGAVKQKKNMFKKKTQQVFQRDEE	Hydrophilic
391-413	ESRKAHGRKVKKYLKQREKNLIY	Basic
576-600	TAIDPTKAKNLKKRRKPTGAGSGSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-58	PPRKIRRATGDPLVRPKPKRPPPKKTTGPVPARPKP
181-183	QKK
385-406	EKRALEESRKAHGRKVKKYLKQ
438-464	KEEEEKKKAAEKAAKEKEEEDRKRERQ
583-592	AKNLKKRRKP

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MASPAPQTTSTKTTPGPNAPHLPPRKIRRATGDPLVRPKPKRPPPKKTTGPVPARPKPAFKEEPEPDDDPSTYTEYKLVTTKKALLRNMRFHCMRLYSKNEVNIMDPDEFVRPIKLHRRDPRGPLQGAKVDPSANGSQLDPDEKDIDPEEKAKREAEKAEKERQHAENLARIAPHGGAVKQKKNMFKKKTQQVFQRDEEERRLKYEEYFPWFIEDYENKNTWIGNLEGGLSGTSVMLVMDEGMFKMIPVEKFYRFQQRNTFKTLSADQAEAAMKQKEKLNRWFMDVTKTEEKEAKLKEERENMRATKRLYTVKGDRLEGRDAKPGFTDADELDFEEDFADDEAPPIIEGDEEELKNATKKMQREQLSANIFDIRDEKDYDREEKEKRALEESRKAHGRKVKKYLKQREKNLIYETDSDENPYASSQESVDSDEEAAKKEEEEKKKAAEKAAKEKEEEDRKRERQEQKEAEEAVKSLKAAAAGKAAAQPGTSSSITTTAPSKSPGLPAKSLKRTGSPGAADSGTESTPQTKRIKKEEQPSTIKPPAAASNGQVPTPQSRLITIKREPDSASATPNNTAIDPTKAKNLKKRRKPTGAGSGSEYETGGEMSDGATSDGGKATKKIKIRMGGDTSANFPVRSGSPAVTKAAVGKKSRSGSPTIGTSRDASPGASTDKSKGSITEEEIKAVLTPEGIDFATISKKFHGRVNPTNKAEFFRKLKGLSRLVDDKDRGKVFYPREEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.51
3	0.53
4	0.54
5	0.59
6	0.59
7	0.66
8	0.65
9	0.66
10	0.67
11	0.7
12	0.73
13	0.72
14	0.73
15	0.73
16	0.74
17	0.73
18	0.74
19	0.73
20	0.69
21	0.73
22	0.75
23	0.74
24	0.71
25	0.73
26	0.74
27	0.75
28	0.8
29	0.81
30	0.83
31	0.84
32	0.9
33	0.91
34	0.88
35	0.88
36	0.87
37	0.86
38	0.84
39	0.86
40	0.82
41	0.82
42	0.77
43	0.74
44	0.68
45	0.69
46	0.66
47	0.61
48	0.64
49	0.6
50	0.62
51	0.61
52	0.58
53	0.51
54	0.47
55	0.42
56	0.33
57	0.3
58	0.29
59	0.24
60	0.22
61	0.22
62	0.19
63	0.21
64	0.26
65	0.27
66	0.26
67	0.3
68	0.37
69	0.41
70	0.48
71	0.52
72	0.57
73	0.62
74	0.68
75	0.69
76	0.7
77	0.65
78	0.6
79	0.58
80	0.55
81	0.52
82	0.49
83	0.51
84	0.5
85	0.53
86	0.56
87	0.53
88	0.47
89	0.43
90	0.38
91	0.34
92	0.28
93	0.24
94	0.2
95	0.19
96	0.19
97	0.17
98	0.17
99	0.14
100	0.21
101	0.31
102	0.38
103	0.47
104	0.55
105	0.64
106	0.68
107	0.75
108	0.78
109	0.77
110	0.72
111	0.66
112	0.62
113	0.59
114	0.53
115	0.48
116	0.39
117	0.31
118	0.28
119	0.29
120	0.24
121	0.19
122	0.19
123	0.16
124	0.17
125	0.18
126	0.21
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.17
131	0.19
132	0.19
133	0.19
134	0.18
135	0.23
136	0.26
137	0.26
138	0.29
139	0.3
140	0.32
141	0.35
142	0.41
143	0.45
144	0.5
145	0.53
146	0.61
147	0.63
148	0.63
149	0.65
150	0.59
151	0.55
152	0.5
153	0.46
154	0.42
155	0.39
156	0.37
157	0.3
158	0.27
159	0.23
160	0.18
161	0.18
162	0.14
163	0.13
164	0.2
165	0.27
166	0.32
167	0.38
168	0.43
169	0.5
170	0.58
171	0.68
172	0.67
173	0.71
174	0.76
175	0.8
176	0.84
177	0.83
178	0.82
179	0.81
180	0.8
181	0.74
182	0.72
183	0.66
184	0.6
185	0.61
186	0.57
187	0.49
188	0.45
189	0.44
190	0.36
191	0.35
192	0.39
193	0.36
194	0.37
195	0.39
196	0.36
197	0.36
198	0.35
199	0.32
200	0.29
201	0.26
202	0.24
203	0.27
204	0.28
205	0.25
206	0.25
207	0.25
208	0.2
209	0.2
210	0.15
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.06
233	0.09
234	0.09
235	0.13
236	0.16
237	0.18
238	0.21
239	0.25
240	0.35
241	0.34
242	0.38
243	0.44
244	0.5
245	0.51
246	0.56
247	0.54
248	0.44
249	0.46
250	0.43
251	0.37
252	0.3
253	0.27
254	0.2
255	0.2
256	0.19
257	0.16
258	0.17
259	0.15
260	0.13
261	0.15
262	0.19
263	0.23
264	0.29
265	0.37
266	0.44
267	0.42
268	0.46
269	0.48
270	0.44
271	0.45
272	0.41
273	0.39
274	0.37
275	0.36
276	0.33
277	0.33
278	0.33
279	0.32
280	0.32
281	0.32
282	0.31
283	0.35
284	0.39
285	0.45
286	0.47
287	0.44
288	0.48
289	0.44
290	0.43
291	0.43
292	0.39
293	0.35
294	0.36
295	0.38
296	0.35
297	0.39
298	0.4
299	0.42
300	0.43
301	0.4
302	0.39
303	0.37
304	0.39
305	0.36
306	0.32
307	0.32
308	0.3
309	0.28
310	0.26
311	0.24
312	0.19
313	0.16
314	0.16
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.03
335	0.03
336	0.05
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.13
345	0.14
346	0.17
347	0.23
348	0.31
349	0.33
350	0.36
351	0.38
352	0.4
353	0.39
354	0.37
355	0.32
356	0.25
357	0.22
358	0.19
359	0.18
360	0.12
361	0.11
362	0.13
363	0.13
364	0.15
365	0.18
366	0.21
367	0.22
368	0.26
369	0.27
370	0.29
371	0.33
372	0.33
373	0.32
374	0.34
375	0.36
376	0.37
377	0.43
378	0.42
379	0.42
380	0.45
381	0.45
382	0.44
383	0.46
384	0.49
385	0.49
386	0.57
387	0.6
388	0.61
389	0.72
390	0.78
391	0.82
392	0.82
393	0.82
394	0.82
395	0.78
396	0.74
397	0.66
398	0.58
399	0.49
400	0.42
401	0.37
402	0.29
403	0.24
404	0.21
405	0.18
406	0.16
407	0.13
408	0.11
409	0.09
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.1
424	0.1
425	0.17
426	0.25
427	0.29
428	0.33
429	0.34
430	0.38
431	0.44
432	0.46
433	0.45
434	0.44
435	0.43
436	0.49
437	0.55
438	0.52
439	0.47
440	0.47
441	0.5
442	0.54
443	0.52
444	0.48
445	0.49
446	0.52
447	0.58
448	0.65
449	0.66
450	0.64
451	0.7
452	0.71
453	0.65
454	0.66
455	0.6
456	0.52
457	0.43
458	0.35
459	0.26
460	0.19
461	0.15
462	0.1
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.11
467	0.11
468	0.1
469	0.11
470	0.13
471	0.13
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.13
477	0.12
478	0.1
479	0.1
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.14
484	0.12
485	0.13
486	0.15
487	0.17
488	0.16
489	0.22
490	0.27
491	0.29
492	0.32
493	0.38
494	0.45
495	0.49
496	0.53
497	0.48
498	0.46
499	0.46
500	0.44
501	0.42
502	0.35
503	0.29
504	0.27
505	0.25
506	0.21
507	0.19
508	0.17
509	0.12
510	0.12
511	0.11
512	0.14
513	0.15
514	0.22
515	0.28
516	0.33
517	0.39
518	0.47
519	0.57
520	0.59
521	0.68
522	0.71
523	0.72
524	0.74
525	0.73
526	0.73
527	0.68
528	0.61
529	0.51
530	0.44
531	0.39
532	0.35
533	0.3
534	0.23
535	0.27
536	0.27
537	0.27
538	0.25
539	0.23
540	0.23
541	0.24
542	0.25
543	0.16
544	0.19
545	0.24
546	0.29
547	0.34
548	0.36
549	0.42
550	0.42
551	0.44
552	0.42
553	0.4
554	0.41
555	0.35
556	0.36
557	0.31
558	0.3
559	0.29
560	0.29
561	0.26
562	0.2
563	0.2
564	0.16
565	0.19
566	0.21
567	0.21
568	0.29
569	0.35
570	0.4
571	0.48
572	0.58
573	0.63
574	0.7
575	0.8
576	0.81
577	0.85
578	0.86
579	0.86
580	0.86
581	0.8
582	0.72
583	0.66
584	0.58
585	0.48
586	0.42
587	0.33
588	0.22
589	0.16
590	0.14
591	0.09
592	0.06
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.09
602	0.1
603	0.1
604	0.14
605	0.18
606	0.24
607	0.3
608	0.36
609	0.4
610	0.48
611	0.5
612	0.55
613	0.57
614	0.55
615	0.52
616	0.47
617	0.43
618	0.39
619	0.37
620	0.28
621	0.22
622	0.21
623	0.19
624	0.21
625	0.2
626	0.17
627	0.2
628	0.23
629	0.25
630	0.22
631	0.22
632	0.26
633	0.3
634	0.34
635	0.34
636	0.36
637	0.41
638	0.45
639	0.49
640	0.45
641	0.43
642	0.41
643	0.42
644	0.46
645	0.42
646	0.4
647	0.38
648	0.37
649	0.34
650	0.33
651	0.29
652	0.21
653	0.19
654	0.2
655	0.22
656	0.22
657	0.22
658	0.22
659	0.25
660	0.27
661	0.27
662	0.26
663	0.27
664	0.28
665	0.32
666	0.38
667	0.36
668	0.35
669	0.34
670	0.32
671	0.27
672	0.24
673	0.19
674	0.09
675	0.09
676	0.08
677	0.1
678	0.1
679	0.09
680	0.08
681	0.1
682	0.17
683	0.17
684	0.19
685	0.22
686	0.26
687	0.28
688	0.35
689	0.43
690	0.44
691	0.54
692	0.63
693	0.68
694	0.69
695	0.73
696	0.69
697	0.66
698	0.62
699	0.6
700	0.56
701	0.53
702	0.54
703	0.52
704	0.58
705	0.61
706	0.62
707	0.57
708	0.59
709	0.59
710	0.57
711	0.61
712	0.58
713	0.53
714	0.55
715	0.54
716	0.48
717	0.45
718	0.48
719	0.46

S8BMS8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer