Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8C742

Protein Details
Accession S8C742    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-87SSSSNVRTSERRRNIPNKFGSDHydrophilic
384-408AHPLHSRPVPPKKTRKRTVKEMAVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-400PKKTRKR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10, nucl 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAIYPKIKLNTAKPPLGGVVSSASAASHAIPRPSPTPSKTLPSPTMTTSITVSTPVNGNSSAASSSSNVRTSERRRNIPNKFGSDSNVHARIKKDRGADVDEDGDTVALNQPPRKKLKPMPTGIPTVITTQYILDKYKDKPPSLTLHMHPTHFRFDQQDGTFNYNSAMRSILEFIAHETIPADAVEVFRDARLPFYEGRLIVHIHDHRTTAKDADGAAVKPKNDMLFSLNKWNDHLTPSPFVPYPAQKSTEIKEEPITNGDTKPMDIDNSSSKPPEEVKKVYKTVLHPTPASLHAEISLLALTPVPPNPRARHGSIAQTPATPATAHPLTVSTGNSKNPPTILNDKTALTFEADYLLTTGPSLVLTPAESPEHAAAIIGALAHPLHSRPVPPKKTRKRTVKEMAVDEAKAAEEERLMLIMDERHQSSAIGATDDGPVGSGGFEPSFKRWKTLESIKQKYEEERLKKAQEQRAQQEKERQKAVKEQHARAASEAQARAAAAASTPTEQSPLEGKGSLREIIARGGATQQHLQAQQRAQEQAARDAVAREQQAQQAAAQAQAQAQAQAREQQAAREAAAAQAAAQREATIAQAAREKANHAAQVAAQAQAQAAAQTPTSAPAQTAATQGSPIAAASSPFAHQGSPPMPNRTSNHSSQPGSRQQSPHMSTVQSIQHQHNQPMPGSPAMHASPMMRATSQAMHGSPAMNQGSPLARNMGMVGGQHMTPAQIAAHQVMMANARNQTAINIAKNTAQQMHATPEQQKAMMQRAFMLQQQQNAYRQQQIFANQAAAHAAAQQQQQNQQHGMMDGMGGAAGMHPGMAGRGFMGGMVSANGMHMNGMMGGMQMGMNGYPQMMAPNGMAAAGGMPMSMMNSAALQGYSPAQINMLMARGRGQPPQGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.5
4 0.46
5 0.41
6 0.34
7 0.25
8 0.2
9 0.16
10 0.16
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.14
17 0.16
18 0.19
19 0.21
20 0.25
21 0.28
22 0.34
23 0.4
24 0.37
25 0.41
26 0.43
27 0.48
28 0.5
29 0.55
30 0.55
31 0.53
32 0.53
33 0.48
34 0.49
35 0.42
36 0.38
37 0.31
38 0.27
39 0.22
40 0.21
41 0.19
42 0.16
43 0.18
44 0.17
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.12
52 0.13
53 0.12
54 0.17
55 0.21
56 0.24
57 0.23
58 0.26
59 0.35
60 0.42
61 0.52
62 0.56
63 0.6
64 0.67
65 0.76
66 0.81
67 0.82
68 0.83
69 0.78
70 0.73
71 0.66
72 0.61
73 0.55
74 0.51
75 0.48
76 0.47
77 0.42
78 0.41
79 0.44
80 0.48
81 0.5
82 0.5
83 0.48
84 0.45
85 0.49
86 0.51
87 0.5
88 0.44
89 0.4
90 0.35
91 0.3
92 0.24
93 0.19
94 0.13
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.15
99 0.19
100 0.26
101 0.34
102 0.42
103 0.46
104 0.52
105 0.59
106 0.66
107 0.71
108 0.72
109 0.73
110 0.7
111 0.71
112 0.62
113 0.56
114 0.46
115 0.39
116 0.33
117 0.25
118 0.2
119 0.16
120 0.19
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.23
125 0.26
126 0.34
127 0.4
128 0.38
129 0.39
130 0.43
131 0.47
132 0.49
133 0.52
134 0.46
135 0.49
136 0.5
137 0.49
138 0.48
139 0.44
140 0.44
141 0.38
142 0.38
143 0.32
144 0.32
145 0.37
146 0.35
147 0.39
148 0.35
149 0.4
150 0.37
151 0.33
152 0.31
153 0.25
154 0.24
155 0.18
156 0.17
157 0.11
158 0.13
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.11
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.16
183 0.15
184 0.19
185 0.23
186 0.2
187 0.22
188 0.21
189 0.2
190 0.18
191 0.24
192 0.24
193 0.24
194 0.25
195 0.25
196 0.25
197 0.27
198 0.28
199 0.22
200 0.21
201 0.19
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.17
206 0.21
207 0.22
208 0.21
209 0.21
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.17
215 0.21
216 0.23
217 0.32
218 0.32
219 0.32
220 0.33
221 0.34
222 0.31
223 0.29
224 0.31
225 0.24
226 0.26
227 0.26
228 0.27
229 0.25
230 0.26
231 0.26
232 0.27
233 0.29
234 0.3
235 0.33
236 0.32
237 0.35
238 0.36
239 0.4
240 0.36
241 0.31
242 0.31
243 0.3
244 0.28
245 0.27
246 0.28
247 0.21
248 0.2
249 0.21
250 0.18
251 0.16
252 0.16
253 0.14
254 0.13
255 0.12
256 0.14
257 0.17
258 0.19
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.2
263 0.24
264 0.28
265 0.29
266 0.33
267 0.39
268 0.45
269 0.47
270 0.47
271 0.48
272 0.45
273 0.47
274 0.46
275 0.43
276 0.36
277 0.35
278 0.35
279 0.33
280 0.32
281 0.24
282 0.18
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.11
287 0.09
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.09
294 0.11
295 0.14
296 0.19
297 0.22
298 0.28
299 0.32
300 0.34
301 0.37
302 0.37
303 0.41
304 0.4
305 0.42
306 0.36
307 0.31
308 0.29
309 0.24
310 0.22
311 0.15
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.15
323 0.17
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.21
330 0.25
331 0.26
332 0.26
333 0.27
334 0.26
335 0.26
336 0.26
337 0.21
338 0.15
339 0.13
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.06
375 0.06
376 0.09
377 0.17
378 0.28
379 0.36
380 0.44
381 0.55
382 0.65
383 0.75
384 0.82
385 0.85
386 0.82
387 0.84
388 0.85
389 0.82
390 0.76
391 0.68
392 0.62
393 0.52
394 0.45
395 0.35
396 0.25
397 0.17
398 0.12
399 0.09
400 0.06
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.06
433 0.08
434 0.15
435 0.15
436 0.18
437 0.18
438 0.2
439 0.26
440 0.34
441 0.41
442 0.45
443 0.5
444 0.49
445 0.52
446 0.5
447 0.47
448 0.45
449 0.44
450 0.39
451 0.39
452 0.42
453 0.42
454 0.46
455 0.51
456 0.51
457 0.49
458 0.5
459 0.52
460 0.58
461 0.58
462 0.56
463 0.58
464 0.57
465 0.55
466 0.55
467 0.49
468 0.41
469 0.46
470 0.48
471 0.48
472 0.49
473 0.46
474 0.47
475 0.48
476 0.46
477 0.39
478 0.36
479 0.29
480 0.26
481 0.24
482 0.17
483 0.15
484 0.14
485 0.13
486 0.11
487 0.08
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.13
503 0.15
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.12
516 0.12
517 0.15
518 0.17
519 0.18
520 0.21
521 0.21
522 0.24
523 0.25
524 0.25
525 0.23
526 0.23
527 0.22
528 0.22
529 0.21
530 0.17
531 0.15
532 0.14
533 0.15
534 0.16
535 0.16
536 0.14
537 0.15
538 0.16
539 0.17
540 0.17
541 0.16
542 0.15
543 0.15
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.11
552 0.12
553 0.12
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.18
558 0.17
559 0.2
560 0.19
561 0.19
562 0.14
563 0.14
564 0.12
565 0.12
566 0.1
567 0.07
568 0.08
569 0.09
570 0.08
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.12
580 0.13
581 0.14
582 0.15
583 0.16
584 0.18
585 0.2
586 0.2
587 0.17
588 0.16
589 0.15
590 0.19
591 0.19
592 0.15
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.06
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.09
609 0.11
610 0.11
611 0.13
612 0.12
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.09
617 0.08
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.05
622 0.06
623 0.07
624 0.08
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.14
630 0.15
631 0.22
632 0.25
633 0.29
634 0.3
635 0.35
636 0.38
637 0.42
638 0.44
639 0.41
640 0.45
641 0.45
642 0.46
643 0.45
644 0.5
645 0.51
646 0.51
647 0.53
648 0.48
649 0.46
650 0.54
651 0.53
652 0.48
653 0.42
654 0.37
655 0.32
656 0.35
657 0.34
658 0.29
659 0.3
660 0.3
661 0.36
662 0.39
663 0.41
664 0.41
665 0.39
666 0.35
667 0.34
668 0.33
669 0.27
670 0.24
671 0.22
672 0.21
673 0.19
674 0.19
675 0.17
676 0.15
677 0.15
678 0.16
679 0.17
680 0.13
681 0.13
682 0.15
683 0.16
684 0.18
685 0.17
686 0.16
687 0.16
688 0.17
689 0.17
690 0.15
691 0.19
692 0.18
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.18
697 0.18
698 0.18
699 0.15
700 0.14
701 0.14
702 0.14
703 0.13
704 0.11
705 0.1
706 0.11
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.08
712 0.07
713 0.08
714 0.06
715 0.07
716 0.08
717 0.09
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.12
723 0.12
724 0.14
725 0.14
726 0.15
727 0.15
728 0.15
729 0.14
730 0.17
731 0.2
732 0.2
733 0.21
734 0.22
735 0.24
736 0.26
737 0.28
738 0.25
739 0.22
740 0.2
741 0.21
742 0.26
743 0.26
744 0.28
745 0.29
746 0.31
747 0.32
748 0.3
749 0.3
750 0.28
751 0.34
752 0.32
753 0.28
754 0.25
755 0.27
756 0.28
757 0.28
758 0.33
759 0.26
760 0.3
761 0.35
762 0.37
763 0.38
764 0.42
765 0.43
766 0.43
767 0.41
768 0.39
769 0.38
770 0.38
771 0.38
772 0.34
773 0.33
774 0.25
775 0.24
776 0.23
777 0.19
778 0.15
779 0.12
780 0.13
781 0.14
782 0.18
783 0.21
784 0.24
785 0.32
786 0.38
787 0.4
788 0.4
789 0.37
790 0.35
791 0.31
792 0.28
793 0.2
794 0.15
795 0.1
796 0.08
797 0.06
798 0.05
799 0.04
800 0.03
801 0.03
802 0.03
803 0.03
804 0.03
805 0.03
806 0.04
807 0.05
808 0.05
809 0.05
810 0.05
811 0.06
812 0.06
813 0.06
814 0.05
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.05
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.05
825 0.05
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.05
832 0.04
833 0.05
834 0.05
835 0.05
836 0.05
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.08
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.1
846 0.09
847 0.09
848 0.07
849 0.07
850 0.06
851 0.05
852 0.04
853 0.04
854 0.04
855 0.05
856 0.05
857 0.05
858 0.05
859 0.06
860 0.06
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.08
865 0.09
866 0.11
867 0.12
868 0.11
869 0.11
870 0.12
871 0.13
872 0.13
873 0.15
874 0.14
875 0.13
876 0.17
877 0.22
878 0.25
879 0.28