FuNGI

S8B8U2

Protein Details

Accession

S8B8U2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
1009-1032	QYNNNNPYDRRPPQQDRRNQGYQG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
407-409	RRQ
411-422	EERREENAKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 6, cyto 4, plas 1, extr 1, pero 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAFFRWLSQKYPKIISPVLETLPLEIDGQLIPVDTTEPNPNGEELDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPETEEEMMLEVFRYTERVVAMVRPRKVLMMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKDKEEEMEEFVKMLASKGTEIDSTLQKKGWDSNAITPGTPFMDILSIALKYWVSYKLNTDAAWAKLKIIISDSSVPGEGEHKIMEFVRSQRSDPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFAQDSRPRVCKICNQKGHRAEECTGKAKEKTGAFDEKSAPNTRKPFIWLDVGILREYLEVELRVPGLSFQWDLERAIDDWVFLCFFVGNDFLPHFPSLEIRDAGIETLATIWKENLGAMKGFVTTDGVVNLERAQYILDGLAKQEDAIFRKRRQVEERREENAKRRKLQQGNNGDSKDGTKLPTHRGKNERVPTAHPANIPLFAPNDTSVETKKLNHDVVVNRAQIRTANYANKSAAAALKAQLLQNTLSTATTEPSTAAGDSKPNPDQSVLGKRKLEIMEEGSGAQTPDTQTPDTEAVDENTDTVKLWEPGYRDRYYEQKFNCPPSDTDFRKGVANAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAQDFENIGDLKITFTLGKPFKPFEQLMGVLPAASKHNIPDAFWPLMTEEDSEIIDFYPETFPLDLNGKKFAWQGVAILPFIDEARLLNAMNKIYPKISDAEKARNEMGSELLLFSESHPLYDELATQFFSKRAIEGDFQLDPRVSEGLSGSVRKDPNFIPHSGLSFPFSNMSSDLYGDIDDDQSMSVVYLLPEKKNLHKSMLLRGVVLKEPALTTADKQFLANRKQGNGRTYGGGYLDRSNSNRGGYGRHNYNPIAPPSGVRGPSLPAGYTLPDSGAPSGNHQNFKGHQGWGQNWSGGNHNFDFKYNNQGGYQQRRDHGNSPHGGSNYQSYGNQGHRTYNGDGTYDRGYDDRRSGYGGGDGYRGDNSNRRSSYERRDDRGGYSQNQYNNNNPYDRRPPQQDRRNQGYQGQGQGQGSSVSTCI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.55
3	0.56
4	0.56
5	0.51
6	0.48
7	0.45
8	0.41
9	0.38
10	0.35
11	0.29
12	0.27
13	0.25
14	0.19
15	0.14
16	0.13
17	0.1
18	0.11
19	0.1
20	0.08
21	0.07
22	0.07
23	0.09
24	0.08
25	0.12
26	0.18
27	0.19
28	0.21
29	0.22
30	0.22
31	0.22
32	0.22
33	0.21
34	0.18
35	0.2
36	0.18
37	0.17
38	0.17
39	0.14
40	0.14
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.18
50	0.21
51	0.23
52	0.29
53	0.36
54	0.4
55	0.44
56	0.45
57	0.43
58	0.41
59	0.41
60	0.35
61	0.29
62	0.24
63	0.21
64	0.18
65	0.13
66	0.12
67	0.1
68	0.09
69	0.07
70	0.09
71	0.08
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.19
77	0.29
78	0.35
79	0.37
80	0.38
81	0.38
82	0.38
83	0.37
84	0.34
85	0.27
86	0.25
87	0.23
88	0.21
89	0.22
90	0.2
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.46
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.82
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.75
110	0.77
111	0.72
112	0.68
113	0.68
114	0.62
115	0.52
116	0.44
117	0.36
118	0.29
119	0.27
120	0.22
121	0.18
122	0.17
123	0.17
124	0.14
125	0.14
126	0.11
127	0.1
128	0.11
129	0.11
130	0.13
131	0.12
132	0.13
133	0.16
134	0.22
135	0.25
136	0.26
137	0.27
138	0.26
139	0.28
140	0.32
141	0.34
142	0.33
143	0.33
144	0.39
145	0.43
146	0.43
147	0.41
148	0.36
149	0.33
150	0.27
151	0.24
152	0.16
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.08
159	0.08
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.1
164	0.16
165	0.16
166	0.18
167	0.22
168	0.26
169	0.28
170	0.28
171	0.29
172	0.28
173	0.29
174	0.33
175	0.29
176	0.24
177	0.25
178	0.26
179	0.22
180	0.21
181	0.19
182	0.17
183	0.2
184	0.2
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.16
189	0.17
190	0.14
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.11
195	0.11
196	0.13
197	0.14
198	0.18
199	0.25
200	0.27
201	0.27
202	0.33
203	0.37
204	0.41
205	0.42
206	0.47
207	0.45
208	0.48
209	0.5
210	0.48
211	0.51
212	0.45
213	0.41
214	0.32
215	0.27
216	0.23
217	0.23
218	0.18
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.06
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.07
232	0.08
233	0.11
234	0.13
235	0.14
236	0.18
237	0.2
238	0.21
239	0.23
240	0.23
241	0.22
242	0.24
243	0.24
244	0.21
245	0.22
246	0.23
247	0.24
248	0.26
249	0.27
250	0.25
251	0.29
252	0.36
253	0.43
254	0.5
255	0.57
256	0.6
257	0.68
258	0.73
259	0.77
260	0.72
261	0.66
262	0.58
263	0.57
264	0.55
265	0.51
266	0.45
267	0.41
268	0.38
269	0.36
270	0.39
271	0.33
272	0.32
273	0.31
274	0.37
275	0.35
276	0.37
277	0.39
278	0.36
279	0.38
280	0.41
281	0.38
282	0.37
283	0.4
284	0.38
285	0.36
286	0.37
287	0.36
288	0.33
289	0.35
290	0.28
291	0.27
292	0.28
293	0.27
294	0.23
295	0.19
296	0.16
297	0.11
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.06
302	0.07
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.1
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.13
319	0.12
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.07
325	0.07
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.08
333	0.08
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.11
339	0.13
340	0.15
341	0.15
342	0.13
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.11
347	0.08
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.08
387	0.1
388	0.12
389	0.19
390	0.25
391	0.27
392	0.35
393	0.39
394	0.44
395	0.51
396	0.59
397	0.62
398	0.66
399	0.7
400	0.67
401	0.69
402	0.66
403	0.67
404	0.66
405	0.62
406	0.56
407	0.56
408	0.62
409	0.64
410	0.69
411	0.68
412	0.69
413	0.68
414	0.7
415	0.64
416	0.54
417	0.46
418	0.39
419	0.32
420	0.22
421	0.18
422	0.15
423	0.18
424	0.25
425	0.33
426	0.36
427	0.41
428	0.46
429	0.51
430	0.57
431	0.6
432	0.58
433	0.52
434	0.52
435	0.5
436	0.48
437	0.45
438	0.35
439	0.32
440	0.27
441	0.26
442	0.22
443	0.17
444	0.14
445	0.11
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.11
452	0.13
453	0.14
454	0.14
455	0.17
456	0.2
457	0.19
458	0.19
459	0.23
460	0.22
461	0.27
462	0.31
463	0.29
464	0.26
465	0.25
466	0.24
467	0.21
468	0.22
469	0.2
470	0.19
471	0.22
472	0.23
473	0.25
474	0.25
475	0.24
476	0.21
477	0.18
478	0.15
479	0.11
480	0.1
481	0.08
482	0.1
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.11
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.08
491	0.07
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.06
501	0.07
502	0.06
503	0.09
504	0.1
505	0.13
506	0.15
507	0.15
508	0.15
509	0.15
510	0.16
511	0.18
512	0.27
513	0.27
514	0.29
515	0.29
516	0.29
517	0.33
518	0.32
519	0.29
520	0.2
521	0.19
522	0.16
523	0.16
524	0.16
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.08
529	0.06
530	0.06
531	0.07
532	0.09
533	0.09
534	0.09
535	0.11
536	0.13
537	0.12
538	0.12
539	0.11
540	0.09
541	0.1
542	0.1
543	0.08
544	0.07
545	0.07
546	0.06
547	0.07
548	0.08
549	0.08
550	0.09
551	0.11
552	0.13
553	0.19
554	0.24
555	0.24
556	0.24
557	0.25
558	0.32
559	0.34
560	0.38
561	0.34
562	0.38
563	0.41
564	0.44
565	0.45
566	0.39
567	0.36
568	0.36
569	0.43
570	0.37
571	0.37
572	0.34
573	0.32
574	0.31
575	0.31
576	0.26
577	0.2
578	0.18
579	0.14
580	0.14
581	0.13
582	0.11
583	0.11
584	0.1
585	0.06
586	0.05
587	0.05
588	0.03
589	0.03
590	0.04
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.08
596	0.09
597	0.13
598	0.16
599	0.15
600	0.19
601	0.2
602	0.24
603	0.27
604	0.29
605	0.27
606	0.23
607	0.24
608	0.22
609	0.23
610	0.19
611	0.17
612	0.15
613	0.14
614	0.14
615	0.16
616	0.14
617	0.11
618	0.1
619	0.09
620	0.08
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.14
626	0.15
627	0.18
628	0.2
629	0.22
630	0.22
631	0.27
632	0.27
633	0.22
634	0.24
635	0.23
636	0.21
637	0.21
638	0.19
639	0.14
640	0.14
641	0.12
642	0.09
643	0.09
644	0.09
645	0.07
646	0.13
647	0.13
648	0.14
649	0.17
650	0.21
651	0.21
652	0.2
653	0.2
654	0.15
655	0.16
656	0.16
657	0.12
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.07
663	0.06
664	0.06
665	0.05
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.09
673	0.14
674	0.15
675	0.16
676	0.19
677	0.18
678	0.19
679	0.2
680	0.2
681	0.17
682	0.15
683	0.15
684	0.15
685	0.16
686	0.14
687	0.13
688	0.12
689	0.11
690	0.1
691	0.09
692	0.05
693	0.04
694	0.05
695	0.06
696	0.07
697	0.09
698	0.11
699	0.12
700	0.13
701	0.15
702	0.14
703	0.14
704	0.15
705	0.14
706	0.14
707	0.16
708	0.21
709	0.24
710	0.31
711	0.33
712	0.35
713	0.34
714	0.32
715	0.31
716	0.25
717	0.22
718	0.14
719	0.12
720	0.09
721	0.08
722	0.08
723	0.07
724	0.07
725	0.14
726	0.13
727	0.13
728	0.14
729	0.15
730	0.15
731	0.16
732	0.17
733	0.11
734	0.12
735	0.13
736	0.12
737	0.13
738	0.12
739	0.13
740	0.11
741	0.11
742	0.12
743	0.14
744	0.15
745	0.16
746	0.19
747	0.2
748	0.2
749	0.21
750	0.19
751	0.16
752	0.16
753	0.14
754	0.1
755	0.08
756	0.08
757	0.11
758	0.13
759	0.14
760	0.14
761	0.19
762	0.21
763	0.21
764	0.24
765	0.22
766	0.29
767	0.31
768	0.31
769	0.3
770	0.3
771	0.31
772	0.3
773	0.29
774	0.23
775	0.2
776	0.2
777	0.17
778	0.16
779	0.15
780	0.14
781	0.16
782	0.13
783	0.12
784	0.12
785	0.11
786	0.1
787	0.09
788	0.09
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.11
800	0.14
801	0.15
802	0.2
803	0.23
804	0.31
805	0.39
806	0.41
807	0.39
808	0.43
809	0.45
810	0.49
811	0.55
812	0.48
813	0.4
814	0.39
815	0.37
816	0.33
817	0.31
818	0.22
819	0.14
820	0.14
821	0.14
822	0.14
823	0.12
824	0.13
825	0.18
826	0.2
827	0.2
828	0.2
829	0.25
830	0.31
831	0.36
832	0.4
833	0.38
834	0.4
835	0.47
836	0.52
837	0.5
838	0.46
839	0.43
840	0.4
841	0.37
842	0.34
843	0.28
844	0.24
845	0.23
846	0.22
847	0.22
848	0.23
849	0.24
850	0.27
851	0.27
852	0.26
853	0.28
854	0.25
855	0.27
856	0.3
857	0.36
858	0.39
859	0.4
860	0.43
861	0.41
862	0.46
863	0.47
864	0.43
865	0.4
866	0.33
867	0.3
868	0.32
869	0.38
870	0.32
871	0.27
872	0.25
873	0.23
874	0.27
875	0.27
876	0.21
877	0.17
878	0.17
879	0.18
880	0.18
881	0.16
882	0.13
883	0.13
884	0.14
885	0.14
886	0.17
887	0.16
888	0.2
889	0.29
890	0.34
891	0.36
892	0.36
893	0.4
894	0.37
895	0.43
896	0.42
897	0.34
898	0.32
899	0.35
900	0.38
901	0.38
902	0.38
903	0.34
904	0.32
905	0.31
906	0.34
907	0.3
908	0.32
909	0.27
910	0.3
911	0.28
912	0.28
913	0.31
914	0.26
915	0.33
916	0.32
917	0.32
918	0.28
919	0.35
920	0.42
921	0.48
922	0.55
923	0.5
924	0.52
925	0.56
926	0.61
927	0.61
928	0.61
929	0.59
930	0.56
931	0.55
932	0.56
933	0.5
934	0.46
935	0.4
936	0.37
937	0.31
938	0.28
939	0.24
940	0.22
941	0.26
942	0.31
943	0.36
944	0.33
945	0.34
946	0.34
947	0.39
948	0.39
949	0.39
950	0.34
951	0.3
952	0.29
953	0.28
954	0.29
955	0.24
956	0.22
957	0.19
958	0.21
959	0.24
960	0.29
961	0.28
962	0.26
963	0.29
964	0.29
965	0.28
966	0.29
967	0.26
968	0.22
969	0.21
970	0.2
971	0.18
972	0.2
973	0.2
974	0.19
975	0.24
976	0.28
977	0.37
978	0.38
979	0.41
980	0.45
981	0.51
982	0.59
983	0.63
984	0.66
985	0.63
986	0.68
987	0.66
988	0.66
989	0.67
990	0.63
991	0.56
992	0.55
993	0.54
994	0.53
995	0.58
996	0.56
997	0.54
998	0.55
999	0.55
1000	0.55
1001	0.53
1002	0.54
1003	0.57
1004	0.59
1005	0.6
1006	0.63
1007	0.69
1008	0.73
1009	0.81
1010	0.83
1011	0.82
1012	0.85
1013	0.84
1014	0.77
1015	0.72
1016	0.71
1017	0.66
1018	0.64
1019	0.58
1020	0.54
1021	0.47
1022	0.43
1023	0.38
1024	0.29
1025	0.24

S8B8U2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer