Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8AFN3

Protein Details
Accession S8AFN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-298LCMYDKVQRTKNKWKCVLRDGVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-211NKKKRKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11, cyto 11, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MTNQAVGKVYDRVIQDVIHTSQADVQDSGVDTAVLEELKKVWQEKLSSFKVATFPWDPAEVVEPVPPKTEEQPENHGEISVDGVRIKPDPEADLPPPPPPAPLGQPLSDPSLAAARAQQMVEKKLGAATQQRPMGLMLPSLPQPHLGGQTDGPDDGPDVSRFDADQHIRQVVLEGEEIRSYEDAIGEAMRRFDIQSDVMQARPLNKKKRKAAAGLPKDEVSSSLVPALAGASITPKALQTDGPEMDEDAINSDLDDPDEEAVDDDDDGEGIPQIMLCMYDKVQRTKNKWKCVLRDGVLTVNGREYVFRKANGEYEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.23
7 0.2
8 0.23
9 0.24
10 0.24
11 0.19
12 0.17
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.13
17 0.1
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.1
26 0.14
27 0.15
28 0.17
29 0.22
30 0.26
31 0.31
32 0.39
33 0.4
34 0.41
35 0.39
36 0.38
37 0.37
38 0.33
39 0.34
40 0.27
41 0.25
42 0.23
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.21
47 0.16
48 0.15
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.22
56 0.29
57 0.3
58 0.33
59 0.39
60 0.39
61 0.41
62 0.39
63 0.34
64 0.27
65 0.22
66 0.21
67 0.15
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.16
78 0.2
79 0.21
80 0.26
81 0.26
82 0.27
83 0.28
84 0.25
85 0.23
86 0.2
87 0.2
88 0.18
89 0.23
90 0.24
91 0.22
92 0.23
93 0.24
94 0.26
95 0.23
96 0.19
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.18
115 0.2
116 0.24
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.24
122 0.17
123 0.14
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.13
151 0.14
152 0.16
153 0.16
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.11
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.16
187 0.15
188 0.19
189 0.27
190 0.35
191 0.41
192 0.49
193 0.58
194 0.64
195 0.73
196 0.73
197 0.7
198 0.72
199 0.72
200 0.73
201 0.68
202 0.62
203 0.54
204 0.48
205 0.42
206 0.33
207 0.25
208 0.17
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.18
234 0.14
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.08
265 0.1
266 0.16
267 0.21
268 0.28
269 0.36
270 0.44
271 0.51
272 0.61
273 0.69
274 0.74
275 0.79
276 0.81
277 0.82
278 0.82
279 0.83
280 0.75
281 0.72
282 0.64
283 0.59
284 0.55
285 0.48
286 0.39
287 0.32
288 0.3
289 0.24
290 0.24
291 0.21
292 0.25
293 0.29
294 0.3
295 0.31
296 0.32