Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8AJT4

Protein Details
Accession S8AJT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-46EVAPVRSEQPHKKHKIQDVGLSSKIERTKKKRRIEGPVTKQTAAHydrophilic
313-340MDSDDEGSRRRRKERKERKKRKREGNAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-35IERTKKKRR
321-337RRRRKERKERKKRKREG
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9.833, mito_nucl 8.833, mito 8.5, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAEVAPVRSEQPHKKHKIQDVGLSSKIERTKKKRRIEGPVTKQTAASTTAFPSPPMTDPSPPSTSKSTRQPGNRTLKAAAVSSPYALTTASRYLSISPAYSATPHVGIQRDHLDPLVFKYDSTLDGVVLLHQNLRFQSPAARILGESPFAFVWCLVEFMLWKPVVGMVLEGWVNNVSPSHVGMLYANVFSVAVTSAGIPEGWKFVPAKENEQNSEAEADSGEGDAARRKGKGDKKDGTELIEGLTQAMGRWVNLEGKDVEGIQKFLVTGVKTEGGMLSLEGSFKDGDFPEIAEGGELQQATVARKQVTQLHGMDSDDEGSRRRRKERKERKKRKREGNAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.77
3 0.8
4 0.82
5 0.78
6 0.77
7 0.74
8 0.72
9 0.66
10 0.59
11 0.5
12 0.46
13 0.47
14 0.46
15 0.48
16 0.52
17 0.6
18 0.67
19 0.77
20 0.81
21 0.84
22 0.87
23 0.88
24 0.89
25 0.88
26 0.89
27 0.84
28 0.74
29 0.66
30 0.55
31 0.47
32 0.39
33 0.3
34 0.22
35 0.19
36 0.23
37 0.22
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.29
46 0.35
47 0.37
48 0.36
49 0.38
50 0.39
51 0.41
52 0.44
53 0.5
54 0.51
55 0.54
56 0.62
57 0.66
58 0.69
59 0.74
60 0.72
61 0.65
62 0.59
63 0.54
64 0.47
65 0.4
66 0.32
67 0.24
68 0.21
69 0.17
70 0.16
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.14
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.16
94 0.16
95 0.18
96 0.22
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.17
101 0.15
102 0.17
103 0.19
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.16
110 0.14
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.14
125 0.15
126 0.18
127 0.17
128 0.17
129 0.16
130 0.18
131 0.18
132 0.14
133 0.12
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.16
193 0.17
194 0.24
195 0.29
196 0.32
197 0.32
198 0.34
199 0.33
200 0.27
201 0.27
202 0.2
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.04
210 0.05
211 0.08
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.14
216 0.22
217 0.3
218 0.39
219 0.46
220 0.51
221 0.55
222 0.61
223 0.61
224 0.56
225 0.49
226 0.4
227 0.31
228 0.25
229 0.2
230 0.13
231 0.12
232 0.08
233 0.06
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.13
240 0.13
241 0.16
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.17
247 0.14
248 0.15
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.15
254 0.11
255 0.11
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.1
283 0.09
284 0.07
285 0.09
286 0.11
287 0.13
288 0.16
289 0.19
290 0.19
291 0.2
292 0.24
293 0.29
294 0.31
295 0.34
296 0.33
297 0.33
298 0.33
299 0.33
300 0.31
301 0.24
302 0.23
303 0.19
304 0.19
305 0.18
306 0.25
307 0.33
308 0.39
309 0.48
310 0.56
311 0.65
312 0.75
313 0.83
314 0.86
315 0.9
316 0.94
317 0.95
318 0.97
319 0.97
320 0.97