Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RFN8

Protein Details
Accession F4RFN8    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1035-1055MNKKKGGEANGKQKKRRDESEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
474-481KKHGSPRK
1037-1051KKKGGEANGKQKKRR
1067-1078RKERKKKPAKKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 12.833, mito 8, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029149  Creatin/AminoP/Spt16_NTD  
IPR036005  Creatinase/aminopeptidase-like  
IPR029148  FACT-Spt16_Nlobe  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR000994  Pept_M24  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG mlr:MELLADRAFT_42765  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14826  FACT-Spt16_Nlob  
PF00557  Peptidase_M24  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MSEVKLNPIVFHRRLRTLLDLWKNATEDEAETAPFLSTGGLLLVAGNADETNPYRKTGALQTYLLGYEFPSTLIFITPENVTFLCSEGKAKILKPLEDPNNVPGADVTVNVLVKSKDATQATEAMGKVIQAMEDAVQDGKKLGCLTKDKYGGKFVDEWTSFLNAKKQNHMVKEANDISSGISVLMATKDAEEMQNTEVACKMTQKLMAALCQQITNLIEAEKKITHERLTDIIETKLEDSSIWKGAKFAPDFDSTYSDWCYTPIIQSGGVYDLRTSAQSTDERLHDTGIILASLGIRYKSYCSNVSRAIMIDPHPTQQENYNYLRELQKFALQELKEGVIAKDFFSTIVAKVSTDRPDLESTLPKSFGFGIGIEFRDSFLSLNPKCSRTLKSDMIFSLAMSFANIEDPLDSSKSYSLQLIDTIVVKEDSSSILSDGLKELTEVAFFFNDKPKNAAKSNASGSRNTDNKPASSSKKHGSPRKSGAAVMTTSRKGRLRNDGKEIDNEATVKRKIHQRELAERRQEDGLSKYAEDDGTGKGTVVKQWKRFESFQRERDLPSAVASLKIVVELNKRSFLLPINGFAVPFHINTLKNVVKQEEGEYTVLRFMFIAPGQITGKKEDTPFEDPNATFIRGLTYRSTDQDHMNEVHKQIMDLKKAVLKREKDQAEKADVVDQDQLIELRTKRPIKMLDISVRPSFDGKRQAGDVEIHQNGIRYQSSLRNDHRIDILFNNMQHLFFQPCDQELIVILHVHLKSPIFIGKKKVKDVQFYREASEAAFDETGNRKRRRQQNGGDEDEIDAEQEERKKRADLNKHFKMFADKIADASDGRLEVEIPYRELAFQGVPFRSSVLLQPTTDCLVHLVEPPFLVITTTEVEVVHLERIQYGLKNFDIVFVFKDFTRTPVHINTIPSGQLENVKEWIDSCDIPFSEGPVNLNWTAIMKTVTDDPYEFFKEGGWSFLNSQSDDEEDEEDEEDEDSAFEVSDLEVESSSASDSGSAFDEDASGSSGTASGSSASDGSSAEDWSDQEKSAARSDMNKKKGGEANGKQKKRRDESESDVSIDSEEEERKERKKKPAKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.55
3 0.54
4 0.52
5 0.56
6 0.57
7 0.55
8 0.53
9 0.54
10 0.5
11 0.43
12 0.38
13 0.3
14 0.22
15 0.21
16 0.19
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.12
22 0.11
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.04
35 0.05
36 0.07
37 0.1
38 0.16
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.2
43 0.25
44 0.31
45 0.36
46 0.35
47 0.35
48 0.34
49 0.35
50 0.35
51 0.31
52 0.22
53 0.15
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.14
75 0.19
76 0.21
77 0.22
78 0.29
79 0.32
80 0.34
81 0.36
82 0.45
83 0.48
84 0.5
85 0.52
86 0.47
87 0.47
88 0.44
89 0.39
90 0.29
91 0.25
92 0.2
93 0.18
94 0.16
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.16
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.19
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.27
108 0.28
109 0.3
110 0.28
111 0.22
112 0.21
113 0.18
114 0.16
115 0.13
116 0.11
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.13
129 0.14
130 0.19
131 0.26
132 0.31
133 0.38
134 0.46
135 0.48
136 0.49
137 0.54
138 0.49
139 0.45
140 0.45
141 0.38
142 0.39
143 0.35
144 0.33
145 0.29
146 0.31
147 0.29
148 0.27
149 0.33
150 0.3
151 0.33
152 0.39
153 0.45
154 0.48
155 0.51
156 0.57
157 0.54
158 0.5
159 0.56
160 0.52
161 0.45
162 0.38
163 0.34
164 0.27
165 0.22
166 0.2
167 0.11
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.19
191 0.19
192 0.21
193 0.21
194 0.24
195 0.24
196 0.25
197 0.23
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.17
202 0.14
203 0.12
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.15
208 0.14
209 0.17
210 0.2
211 0.23
212 0.24
213 0.25
214 0.27
215 0.28
216 0.3
217 0.31
218 0.28
219 0.26
220 0.24
221 0.22
222 0.21
223 0.17
224 0.14
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.22
233 0.29
234 0.28
235 0.27
236 0.25
237 0.28
238 0.29
239 0.29
240 0.3
241 0.23
242 0.24
243 0.24
244 0.21
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.13
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.12
265 0.13
266 0.16
267 0.19
268 0.2
269 0.23
270 0.22
271 0.22
272 0.19
273 0.18
274 0.16
275 0.13
276 0.11
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.1
286 0.14
287 0.17
288 0.23
289 0.25
290 0.3
291 0.33
292 0.34
293 0.32
294 0.29
295 0.26
296 0.22
297 0.21
298 0.21
299 0.19
300 0.2
301 0.2
302 0.2
303 0.2
304 0.24
305 0.27
306 0.27
307 0.29
308 0.29
309 0.29
310 0.31
311 0.35
312 0.31
313 0.29
314 0.25
315 0.26
316 0.25
317 0.25
318 0.29
319 0.24
320 0.24
321 0.22
322 0.21
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.13
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.09
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.12
339 0.16
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.19
344 0.2
345 0.22
346 0.23
347 0.25
348 0.25
349 0.26
350 0.26
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.19
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.09
366 0.1
367 0.17
368 0.17
369 0.25
370 0.27
371 0.28
372 0.31
373 0.34
374 0.35
375 0.33
376 0.4
377 0.39
378 0.38
379 0.4
380 0.37
381 0.36
382 0.33
383 0.26
384 0.2
385 0.13
386 0.11
387 0.08
388 0.08
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.07
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.06
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.08
434 0.14
435 0.16
436 0.16
437 0.19
438 0.22
439 0.26
440 0.28
441 0.32
442 0.28
443 0.3
444 0.35
445 0.39
446 0.37
447 0.34
448 0.36
449 0.37
450 0.38
451 0.35
452 0.36
453 0.3
454 0.28
455 0.31
456 0.33
457 0.32
458 0.34
459 0.37
460 0.35
461 0.42
462 0.49
463 0.52
464 0.54
465 0.56
466 0.57
467 0.58
468 0.55
469 0.48
470 0.41
471 0.36
472 0.31
473 0.25
474 0.22
475 0.18
476 0.17
477 0.2
478 0.22
479 0.22
480 0.26
481 0.34
482 0.4
483 0.44
484 0.5
485 0.52
486 0.5
487 0.49
488 0.47
489 0.37
490 0.29
491 0.25
492 0.18
493 0.17
494 0.17
495 0.16
496 0.17
497 0.23
498 0.26
499 0.33
500 0.39
501 0.4
502 0.49
503 0.57
504 0.61
505 0.6
506 0.57
507 0.5
508 0.45
509 0.4
510 0.31
511 0.25
512 0.2
513 0.15
514 0.15
515 0.13
516 0.13
517 0.12
518 0.11
519 0.1
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.12
527 0.19
528 0.24
529 0.29
530 0.33
531 0.36
532 0.4
533 0.43
534 0.48
535 0.51
536 0.54
537 0.52
538 0.53
539 0.51
540 0.47
541 0.45
542 0.39
543 0.28
544 0.21
545 0.18
546 0.13
547 0.12
548 0.1
549 0.09
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.1
555 0.13
556 0.14
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.17
561 0.17
562 0.18
563 0.16
564 0.16
565 0.16
566 0.16
567 0.16
568 0.14
569 0.15
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.12
576 0.18
577 0.18
578 0.19
579 0.2
580 0.2
581 0.18
582 0.19
583 0.2
584 0.16
585 0.16
586 0.14
587 0.13
588 0.12
589 0.13
590 0.12
591 0.1
592 0.08
593 0.06
594 0.08
595 0.07
596 0.09
597 0.08
598 0.1
599 0.11
600 0.13
601 0.14
602 0.14
603 0.16
604 0.16
605 0.17
606 0.17
607 0.21
608 0.25
609 0.26
610 0.25
611 0.27
612 0.25
613 0.27
614 0.28
615 0.24
616 0.17
617 0.15
618 0.17
619 0.14
620 0.16
621 0.14
622 0.15
623 0.16
624 0.18
625 0.21
626 0.19
627 0.21
628 0.21
629 0.23
630 0.21
631 0.22
632 0.23
633 0.2
634 0.21
635 0.19
636 0.17
637 0.21
638 0.24
639 0.24
640 0.22
641 0.23
642 0.24
643 0.26
644 0.32
645 0.33
646 0.31
647 0.33
648 0.41
649 0.45
650 0.46
651 0.48
652 0.46
653 0.44
654 0.41
655 0.38
656 0.33
657 0.28
658 0.25
659 0.22
660 0.17
661 0.13
662 0.12
663 0.12
664 0.08
665 0.11
666 0.11
667 0.12
668 0.2
669 0.23
670 0.23
671 0.28
672 0.31
673 0.32
674 0.37
675 0.4
676 0.39
677 0.4
678 0.43
679 0.39
680 0.37
681 0.32
682 0.29
683 0.24
684 0.22
685 0.28
686 0.25
687 0.25
688 0.26
689 0.26
690 0.25
691 0.25
692 0.23
693 0.2
694 0.19
695 0.18
696 0.18
697 0.18
698 0.17
699 0.18
700 0.16
701 0.1
702 0.12
703 0.18
704 0.23
705 0.3
706 0.33
707 0.39
708 0.39
709 0.39
710 0.4
711 0.35
712 0.32
713 0.26
714 0.28
715 0.22
716 0.22
717 0.23
718 0.2
719 0.19
720 0.17
721 0.18
722 0.14
723 0.12
724 0.14
725 0.12
726 0.12
727 0.14
728 0.13
729 0.11
730 0.1
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.12
736 0.12
737 0.12
738 0.12
739 0.11
740 0.11
741 0.12
742 0.17
743 0.16
744 0.19
745 0.27
746 0.35
747 0.4
748 0.45
749 0.51
750 0.5
751 0.56
752 0.59
753 0.59
754 0.59
755 0.56
756 0.53
757 0.47
758 0.42
759 0.32
760 0.28
761 0.2
762 0.13
763 0.12
764 0.1
765 0.12
766 0.18
767 0.26
768 0.34
769 0.37
770 0.42
771 0.51
772 0.61
773 0.67
774 0.71
775 0.73
776 0.75
777 0.79
778 0.79
779 0.71
780 0.62
781 0.52
782 0.43
783 0.33
784 0.22
785 0.14
786 0.08
787 0.1
788 0.15
789 0.18
790 0.19
791 0.21
792 0.23
793 0.29
794 0.39
795 0.47
796 0.52
797 0.6
798 0.67
799 0.69
800 0.67
801 0.61
802 0.6
803 0.51
804 0.45
805 0.41
806 0.32
807 0.29
808 0.3
809 0.3
810 0.22
811 0.21
812 0.16
813 0.1
814 0.1
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.14
819 0.14
820 0.14
821 0.14
822 0.14
823 0.14
824 0.14
825 0.15
826 0.1
827 0.12
828 0.16
829 0.16
830 0.16
831 0.16
832 0.17
833 0.16
834 0.16
835 0.17
836 0.18
837 0.2
838 0.19
839 0.21
840 0.22
841 0.24
842 0.23
843 0.2
844 0.14
845 0.13
846 0.14
847 0.18
848 0.17
849 0.15
850 0.15
851 0.16
852 0.14
853 0.13
854 0.12
855 0.07
856 0.08
857 0.09
858 0.09
859 0.1
860 0.09
861 0.1
862 0.11
863 0.11
864 0.11
865 0.1
866 0.1
867 0.09
868 0.11
869 0.12
870 0.14
871 0.14
872 0.16
873 0.15
874 0.18
875 0.18
876 0.2
877 0.2
878 0.18
879 0.19
880 0.17
881 0.18
882 0.15
883 0.2
884 0.17
885 0.19
886 0.23
887 0.22
888 0.25
889 0.29
890 0.35
891 0.34
892 0.36
893 0.35
894 0.32
895 0.32
896 0.28
897 0.24
898 0.19
899 0.21
900 0.21
901 0.2
902 0.21
903 0.21
904 0.2
905 0.2
906 0.22
907 0.19
908 0.17
909 0.17
910 0.19
911 0.19
912 0.21
913 0.21
914 0.21
915 0.21
916 0.21
917 0.22
918 0.18
919 0.22
920 0.2
921 0.2
922 0.17
923 0.15
924 0.14
925 0.14
926 0.14
927 0.1
928 0.11
929 0.16
930 0.17
931 0.18
932 0.18
933 0.18
934 0.23
935 0.26
936 0.25
937 0.2
938 0.19
939 0.22
940 0.22
941 0.24
942 0.19
943 0.18
944 0.2
945 0.25
946 0.27
947 0.23
948 0.24
949 0.21
950 0.21
951 0.21
952 0.2
953 0.16
954 0.15
955 0.15
956 0.15
957 0.14
958 0.13
959 0.11
960 0.1
961 0.09
962 0.08
963 0.07
964 0.06
965 0.06
966 0.05
967 0.05
968 0.05
969 0.06
970 0.07
971 0.07
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.07
976 0.08
977 0.07
978 0.06
979 0.06
980 0.06
981 0.08
982 0.1
983 0.1
984 0.1
985 0.09
986 0.1
987 0.09
988 0.1
989 0.11
990 0.09
991 0.08
992 0.08
993 0.08
994 0.08
995 0.08
996 0.08
997 0.07
998 0.07
999 0.08
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.09
1003 0.09
1004 0.11
1005 0.11
1006 0.11
1007 0.1
1008 0.11
1009 0.12
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.14
1013 0.15
1014 0.19
1015 0.21
1016 0.25
1017 0.27
1018 0.26
1019 0.34
1020 0.44
1021 0.52
1022 0.54
1023 0.57
1024 0.54
1025 0.59
1026 0.64
1027 0.63
1028 0.63
1029 0.63
1030 0.68
1031 0.72
1032 0.79
1033 0.79
1034 0.8
1035 0.82
1036 0.8
1037 0.8
1038 0.77
1039 0.75
1040 0.75
1041 0.78
1042 0.73
1043 0.66
1044 0.57
1045 0.48
1046 0.4
1047 0.31
1048 0.25
1049 0.18
1050 0.17
1051 0.17
1052 0.23
1053 0.28
1054 0.36
1055 0.45
1056 0.52
1057 0.6
1058 0.68