Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4R871

Protein Details
Accession F4R871    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-52APVFLPRPTRIRNYKPKHEETKTEKEEHydrophilic
334-360RNPPSVTSSSHRKKKSKSKDDGSSSVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-350RKKKSK
390-398PKKKKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, cyto 5, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG mlr:MELLADRAFT_90966  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSNQDLSSVIPSDFHHLKAKFSLPLAPVFLPRPTRIRNYKPKHEETKTEKEEEEEEISIQLEPTKDFSNRIDNSGGAVEAVNQILSTLLMKYIPNLGCVLLSYLSPPMFIFKDQNGKEYTQTSNNLNQNLPFQTIVGSGWSIIKVKLNLLGWRPKIGDRLIGKPTMSSPSHLSLILYQTFNAFIPANHMLGAGYRYDPNVEIPSSWKFNGKDQTTNLHQANQSGYENDGDDLEIHERGCWVDSNGVVVGGEAGVMSFTAISLTITNDMISVTGSLLSDPFSVPANGYQSTRPSRPISPSQASNSSNSSDEDDLPTVDSITTMNIENQDDHQTRRNPPSVTSSSHRKKKSKSKDDGSSSVNGSLGRKTMLVDSRSNQLKRSGIDDSSNQSPKKKKKKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.3
4 0.33
5 0.37
6 0.4
7 0.36
8 0.36
9 0.39
10 0.32
11 0.35
12 0.36
13 0.32
14 0.31
15 0.29
16 0.33
17 0.32
18 0.33
19 0.37
20 0.39
21 0.47
22 0.54
23 0.62
24 0.68
25 0.73
26 0.8
27 0.83
28 0.87
29 0.87
30 0.84
31 0.83
32 0.81
33 0.83
34 0.77
35 0.72
36 0.63
37 0.55
38 0.51
39 0.44
40 0.39
41 0.29
42 0.23
43 0.19
44 0.19
45 0.17
46 0.15
47 0.13
48 0.1
49 0.1
50 0.13
51 0.16
52 0.17
53 0.19
54 0.22
55 0.3
56 0.31
57 0.33
58 0.32
59 0.28
60 0.29
61 0.27
62 0.23
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.17
99 0.26
100 0.27
101 0.31
102 0.3
103 0.31
104 0.31
105 0.31
106 0.31
107 0.27
108 0.29
109 0.29
110 0.34
111 0.36
112 0.37
113 0.34
114 0.32
115 0.3
116 0.29
117 0.27
118 0.19
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.14
134 0.16
135 0.18
136 0.22
137 0.29
138 0.27
139 0.29
140 0.3
141 0.28
142 0.3
143 0.27
144 0.3
145 0.25
146 0.3
147 0.3
148 0.3
149 0.28
150 0.25
151 0.25
152 0.24
153 0.21
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.14
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.08
170 0.06
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.18
194 0.17
195 0.22
196 0.3
197 0.3
198 0.32
199 0.31
200 0.36
201 0.35
202 0.4
203 0.35
204 0.31
205 0.29
206 0.26
207 0.25
208 0.22
209 0.19
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.04
237 0.04
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.22
276 0.27
277 0.28
278 0.31
279 0.32
280 0.34
281 0.4
282 0.46
283 0.48
284 0.47
285 0.5
286 0.5
287 0.53
288 0.51
289 0.46
290 0.41
291 0.34
292 0.31
293 0.27
294 0.26
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.24
315 0.24
316 0.27
317 0.33
318 0.37
319 0.43
320 0.5
321 0.54
322 0.47
323 0.48
324 0.54
325 0.5
326 0.5
327 0.49
328 0.52
329 0.56
330 0.64
331 0.7
332 0.69
333 0.75
334 0.8
335 0.86
336 0.86
337 0.86
338 0.87
339 0.88
340 0.88
341 0.84
342 0.76
343 0.69
344 0.6
345 0.51
346 0.42
347 0.34
348 0.27
349 0.23
350 0.21
351 0.18
352 0.16
353 0.16
354 0.21
355 0.27
356 0.29
357 0.32
358 0.33
359 0.4
360 0.49
361 0.49
362 0.45
363 0.44
364 0.45
365 0.41
366 0.44
367 0.41
368 0.35
369 0.38
370 0.4
371 0.39
372 0.43
373 0.49
374 0.46
375 0.49
376 0.56
377 0.62
378 0.7