Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8C0W6

Protein Details
Accession S8C0W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
306-331LPVVRRLKRTVKVIKKEKKDEEDGKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-177AKKKEEEERKRREAEKD
311-324RLKRTVKVIKKEKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 10, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021627  Mediator_Med27  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11571  Med27  
Amino Acid Sequences MAVDSKPVIKPQNGTSLPADGSVVPGPAGTTANPEDSETTEETTLVSALSLLNQMHQKLTLLRESIPHMVQPIMKASSYPTPERLFDDFSKRTLKASEDLVDFTTLVSDGKWVFEKATASRRDNGDNGEVKRWKSSAPVPHYLKELLDAGGSGSSAKDGEAKKKEEEERKRREAEKDKEREVEIEEVKVMESEETRNGIVEAFKKEYTDLEVTYEDDGQTIKVALPKALNLTFSVEIPEASAESNRYPVTLPASSYLHVLILRSVTTRPNAGSLKYLLDMIATYQTIYKTKCSKCNKLTFGPKADLPVVRRLKRTVKVIKKEKKDEEDGKDGDKMDTSADGKAKEKVAADKDDKGKAAQNEKSKERSDTADDDGEVELIEEFWVAYHESCVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.4
4 0.37
5 0.33
6 0.29
7 0.18
8 0.2
9 0.17
10 0.15
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.09
17 0.13
18 0.14
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.2
24 0.24
25 0.2
26 0.21
27 0.18
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.14
32 0.09
33 0.08
34 0.06
35 0.05
36 0.06
37 0.09
38 0.08
39 0.12
40 0.15
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.19
46 0.23
47 0.24
48 0.22
49 0.23
50 0.25
51 0.28
52 0.31
53 0.28
54 0.25
55 0.22
56 0.22
57 0.22
58 0.21
59 0.21
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.19
64 0.23
65 0.27
66 0.28
67 0.29
68 0.3
69 0.31
70 0.36
71 0.36
72 0.34
73 0.33
74 0.39
75 0.36
76 0.37
77 0.41
78 0.36
79 0.35
80 0.32
81 0.31
82 0.25
83 0.28
84 0.29
85 0.25
86 0.26
87 0.25
88 0.23
89 0.2
90 0.17
91 0.13
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.06
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.15
103 0.17
104 0.26
105 0.31
106 0.32
107 0.37
108 0.39
109 0.4
110 0.39
111 0.38
112 0.36
113 0.36
114 0.35
115 0.38
116 0.38
117 0.36
118 0.36
119 0.34
120 0.28
121 0.26
122 0.31
123 0.32
124 0.36
125 0.44
126 0.46
127 0.47
128 0.48
129 0.45
130 0.38
131 0.3
132 0.24
133 0.15
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.09
145 0.11
146 0.19
147 0.24
148 0.27
149 0.29
150 0.35
151 0.42
152 0.47
153 0.56
154 0.58
155 0.62
156 0.66
157 0.7
158 0.68
159 0.7
160 0.71
161 0.69
162 0.69
163 0.67
164 0.64
165 0.6
166 0.57
167 0.49
168 0.4
169 0.36
170 0.26
171 0.2
172 0.17
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.1
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.17
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.12
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.21
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.11
273 0.14
274 0.15
275 0.2
276 0.27
277 0.33
278 0.42
279 0.5
280 0.58
281 0.64
282 0.73
283 0.74
284 0.74
285 0.79
286 0.76
287 0.73
288 0.66
289 0.58
290 0.51
291 0.48
292 0.43
293 0.36
294 0.38
295 0.42
296 0.43
297 0.46
298 0.48
299 0.53
300 0.55
301 0.62
302 0.63
303 0.64
304 0.71
305 0.78
306 0.82
307 0.84
308 0.87
309 0.86
310 0.83
311 0.82
312 0.8
313 0.76
314 0.75
315 0.67
316 0.6
317 0.54
318 0.48
319 0.39
320 0.31
321 0.24
322 0.17
323 0.19
324 0.17
325 0.18
326 0.2
327 0.22
328 0.23
329 0.27
330 0.28
331 0.27
332 0.28
333 0.32
334 0.34
335 0.41
336 0.43
337 0.47
338 0.51
339 0.52
340 0.51
341 0.45
342 0.46
343 0.44
344 0.49
345 0.48
346 0.52
347 0.55
348 0.61
349 0.65
350 0.62
351 0.6
352 0.54
353 0.53
354 0.5
355 0.46
356 0.45
357 0.42
358 0.38
359 0.35
360 0.32
361 0.27
362 0.2
363 0.16
364 0.1
365 0.07
366 0.07
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.07