Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S8C9U4

Protein Details
Accession S8C9U4    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
501-528VDPEQEAPKPPPKKKEKTKSPPIEGMDEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-447KTAPKAGGIKKTIGGKKKQEPAKPAKA
464-490PEPPKRTGKIKGTIGGRKIGGDAPKRK
508-522PKPPPKKKEKTKSPP
533-555KRREELQKQLAAKSAGKKKGRKF
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11.5, mito 3.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAPTPIAPWELFPLQNPSSPPLYLQRRFTETSYAVYLTDLTSIWAESLEKGSICDRAEDRNCSIDPSTDESQLQILLEKLSSGITGINPAVTVELEVRGDTFNVNTKEKLQAPLQPLEWRFRLKLQPGAQFTKNFSLPLLYYGSLLSRQTASLLSIIDEKDVAIARLLEKFEEYKIDISSVFPGYKKGRPPTGRAKGIKQFDQDDWKRDILATELNTKTSKELVKATFKHIPKSNYKLEIPLPKPSETQWWTKINGKVIVKGEPEVEATPHTTPRKPPKPVRLNTDSDDDFEALRSSPVRTRVAESSVPVKSEAPLSKPAADGDTTEDEDDLDVAPKSQSSRATTNKSSQPTPPPVGRTASPRRSMTLSVSPKPPKRKSSAENRQFEENFGNSYGLVQALVDDEATTSESDDEPAPNPTPKTAPKAGGIKKTIGGKKKQEPAKPAKADSEEDMPAPPPEPEAEPEPPKRTGKIKGTIGGRKIGGDAPKRKEPEPDSDEEMVDPEQEAPKPPPKKKEKTKSPPIEGMDEDAAQKRREELQKQLAAKSAGKKKGRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.33
4 0.31
5 0.3
6 0.3
7 0.31
8 0.33
9 0.41
10 0.44
11 0.48
12 0.5
13 0.53
14 0.56
15 0.55
16 0.54
17 0.45
18 0.43
19 0.39
20 0.34
21 0.28
22 0.25
23 0.24
24 0.16
25 0.15
26 0.11
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.19
40 0.18
41 0.22
42 0.21
43 0.29
44 0.35
45 0.39
46 0.4
47 0.41
48 0.41
49 0.4
50 0.39
51 0.33
52 0.31
53 0.32
54 0.32
55 0.29
56 0.29
57 0.26
58 0.26
59 0.23
60 0.19
61 0.14
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.16
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.3
95 0.32
96 0.35
97 0.3
98 0.32
99 0.35
100 0.38
101 0.38
102 0.39
103 0.38
104 0.4
105 0.4
106 0.37
107 0.34
108 0.36
109 0.41
110 0.39
111 0.45
112 0.46
113 0.51
114 0.53
115 0.57
116 0.55
117 0.5
118 0.49
119 0.46
120 0.41
121 0.33
122 0.27
123 0.24
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.17
171 0.2
172 0.25
173 0.31
174 0.33
175 0.41
176 0.43
177 0.5
178 0.56
179 0.62
180 0.66
181 0.62
182 0.64
183 0.62
184 0.64
185 0.61
186 0.53
187 0.47
188 0.41
189 0.48
190 0.44
191 0.41
192 0.39
193 0.35
194 0.32
195 0.29
196 0.26
197 0.18
198 0.19
199 0.16
200 0.19
201 0.19
202 0.21
203 0.21
204 0.21
205 0.2
206 0.2
207 0.2
208 0.15
209 0.21
210 0.23
211 0.31
212 0.33
213 0.37
214 0.41
215 0.41
216 0.45
217 0.45
218 0.46
219 0.44
220 0.49
221 0.49
222 0.46
223 0.46
224 0.43
225 0.42
226 0.46
227 0.41
228 0.42
229 0.39
230 0.35
231 0.35
232 0.33
233 0.37
234 0.31
235 0.34
236 0.33
237 0.33
238 0.34
239 0.4
240 0.42
241 0.37
242 0.4
243 0.35
244 0.34
245 0.32
246 0.33
247 0.28
248 0.25
249 0.22
250 0.16
251 0.17
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.16
259 0.17
260 0.23
261 0.33
262 0.41
263 0.47
264 0.54
265 0.6
266 0.68
267 0.71
268 0.72
269 0.68
270 0.64
271 0.58
272 0.55
273 0.45
274 0.36
275 0.32
276 0.24
277 0.18
278 0.14
279 0.12
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.15
286 0.17
287 0.17
288 0.2
289 0.22
290 0.25
291 0.25
292 0.23
293 0.24
294 0.22
295 0.22
296 0.19
297 0.17
298 0.14
299 0.18
300 0.18
301 0.16
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.22
306 0.21
307 0.18
308 0.17
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.08
325 0.1
326 0.14
327 0.17
328 0.24
329 0.3
330 0.37
331 0.39
332 0.44
333 0.48
334 0.48
335 0.46
336 0.44
337 0.45
338 0.45
339 0.46
340 0.43
341 0.4
342 0.39
343 0.39
344 0.36
345 0.37
346 0.4
347 0.43
348 0.46
349 0.43
350 0.43
351 0.43
352 0.43
353 0.4
354 0.39
355 0.39
356 0.37
357 0.44
358 0.49
359 0.53
360 0.62
361 0.64
362 0.61
363 0.61
364 0.66
365 0.66
366 0.7
367 0.74
368 0.74
369 0.74
370 0.7
371 0.7
372 0.62
373 0.56
374 0.49
375 0.38
376 0.3
377 0.24
378 0.22
379 0.14
380 0.14
381 0.12
382 0.08
383 0.07
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.14
402 0.16
403 0.18
404 0.18
405 0.19
406 0.23
407 0.26
408 0.32
409 0.33
410 0.34
411 0.37
412 0.46
413 0.5
414 0.53
415 0.52
416 0.46
417 0.45
418 0.51
419 0.52
420 0.5
421 0.52
422 0.53
423 0.59
424 0.66
425 0.7
426 0.68
427 0.71
428 0.73
429 0.76
430 0.72
431 0.66
432 0.64
433 0.6
434 0.56
435 0.49
436 0.44
437 0.34
438 0.29
439 0.28
440 0.23
441 0.2
442 0.18
443 0.15
444 0.11
445 0.12
446 0.13
447 0.15
448 0.2
449 0.25
450 0.32
451 0.38
452 0.41
453 0.45
454 0.46
455 0.47
456 0.48
457 0.51
458 0.52
459 0.55
460 0.56
461 0.57
462 0.63
463 0.66
464 0.62
465 0.58
466 0.5
467 0.41
468 0.38
469 0.35
470 0.34
471 0.37
472 0.43
473 0.45
474 0.52
475 0.55
476 0.55
477 0.6
478 0.56
479 0.58
480 0.56
481 0.53
482 0.52
483 0.5
484 0.49
485 0.41
486 0.38
487 0.28
488 0.22
489 0.17
490 0.13
491 0.14
492 0.15
493 0.18
494 0.22
495 0.31
496 0.41
497 0.47
498 0.56
499 0.63
500 0.73
501 0.81
502 0.86
503 0.89
504 0.9
505 0.94
506 0.94
507 0.92
508 0.89
509 0.82
510 0.76
511 0.66
512 0.59
513 0.51
514 0.41
515 0.35
516 0.33
517 0.33
518 0.29
519 0.28
520 0.27
521 0.33
522 0.41
523 0.44
524 0.48
525 0.54
526 0.61
527 0.64
528 0.63
529 0.6
530 0.55
531 0.55
532 0.55
533 0.54
534 0.55
535 0.61